蓖麻是雙子葉胚乳型植物的典型代表,是大戟科中重要的油料作物,其種子油被廣泛地應用在工業上。bZIP(basic leucine zipper)轉錄因子廣泛分布于真核生物中,在植物中涉及多種生物進程,其中ABF亞族更是ABA信號途徑中重要的調控因子。
中國科學院西雙版納熱帶植物園分子遺傳與育種組研究發現ABA對蓖麻油脂累積具有顯著作用,bZIP轉錄因子可能參與ABA調控蓖麻油脂合成信號途徑,為此研究人員在蓖麻全基因組鑒定得到蓖麻bZIP家族所有成員,進一步對蓖麻bZIP家族基因結構、蛋白結構、二聚化特性、進化以及表達譜分析。得到以下結論:蓖麻 bZIP家族成員49個,根據保守bZIP結構域特征將bZIP家族分為11個組(Group);對蓖麻bZIP轉錄因子結構域外的保守基序(Motif)、基因結構、進化關系等生物信息學分析,初步揭示了這兩個家族成員在進化和功能上的相關性;對擬南芥和蓖麻中bZIP成員系統發生分析,均表明二者既存在同源性,又在進化中有基因丟失現象;基于DGE高通量表達測序數據以及公開的蓖麻五個組織RNA-Seq數據分別對蓖麻bZIP基因的組織表達模式分析,得到種子特異性表達的或者潛在與油脂相關的基因。
該研究結果為了解bZIP轉錄因子的結構和功能提供了重要信息。同時也為揭示蓖麻bZIP基因與蓖麻生長和發育,尤其是在種子儲存物質累積中的作用提供了線索。相關研究結果以Genomic surveys and expression analysis of bZIP gene family in castor bean (Ricinus communis L.)為題發表在Planta上。
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