人類和黑猩猩的DNA僅百分之一不同。人類加速區域(HAR)是基因組的一部分,美國研究人員分析了數以千計的人類和黑猩猩HAR,發現人類進化過程中積累的許多變化具有相反的影響。研究結果近日發表在《神經元》雜志上。
論文主要作者、格拉德斯通數據科學與生物技術研究所所長凱蒂·波拉德博士說,這有助于回答一個長期存在的問題,即為什么HAR在早期人類進化得如此之快。HAR的初始變化可能會過度提高其活性,然后需要將其調低。這些發現對理解人類進化具有重要意義。此外,研究發現許多HAR在大腦發育中發揮作用,表明人類HAR的變異可能使人們易患精神疾病。
絕大多數HAR不是基因,而是增強子,即控制基因活性的基因組調控區域。為研究人類與黑猩猩的HAR在增強子功能方面的區別,研究人員利用計算機程序,預測任何給定DNA片段是否為增強子的模式。最終,研究人員使用該模型預測出三分之一的HAR控制大腦發育。
每個HAR在人類和黑猩猩之間都有多重差異,因此研究人員懷疑HAR中的個體變異影響其增強子強度。研究人員利用第二種機器學習模型預測出,43%的HAR包含兩個或更多具有較大相反效果的變體:給定HAR中的某些變體使其成為更強的增強子,而其他變化使HAR成為更弱的增強子。
研究人員將每個HAR融合到一個小的DNA條形碼上。每次HAR激活,增強基因表達時,條形碼就會轉錄成一段RNA。然后,研究人員使用RNA測序技術分析任何細胞中存在多少條形碼,以表明HAR在該細胞中的活躍程度。當研究小組對人類和黑猩猩腦細胞前體中的700多個HAR進行實驗時,數據模仿了機器學習算法的預測。
HAR變體在增強子水平上進行的“拉鋸戰”與已經提出的關于人類進化的理論非常吻合:人類物種的高級認知其實也是導致人類患上精神疾病的原因。
近日,西北農林科技大學玉米生物學與遺傳育種團隊聯合華中農業大學玉米團隊在《植物生理學研究》發表論文。研究初步揭示了ZmGBF1-ZmATG8c模塊通過自噬途徑調控玉米耐熱性的分子機制。隨著全球氣溫持續......
記者21日從國家乳業技術創新中心獲悉,該中心技術研發團隊成功研制出奶牛種用胚胎基因組遺傳評估芯片和“高產、抗病、長生產期”功能強化基因組預測芯片。該系列基因芯片具有完全自主知識產權,填補了我國基因芯片......
國際期刊《內分泌學前沿》日前刊登的一項新研究揭示,一種特殊基因對腸道吸收維生素D及其后續代謝過程至關重要,阻斷或抑制該基因能夠選擇性抑制癌細胞生長。這一發現在癌癥治療等精準醫學領域具有廣闊應用前景。維......
記者從安徽農業大學獲悉,該校王曉波教授團隊聯合中國農業科學院作物科學研究所邱麗娟、李英慧研究員團隊,解析了關鍵基因對大豆種子油脂和蛋白比例(油蛋比)的調控機制,為高油或高蛋白大豆品種選育提供了新方向。......
茶樹是以收獲新梢為主的葉用經濟作物,茶芽大小不僅直接影響鮮葉的產量和品質,還與茶類適制性密切相關。解析茶樹芽大小的遺傳調控機制,有助于改良茶樹品種、提高茶葉產量。近日,中國農業科學院茶葉研究所種質資源......
玉米作為全球重要的糧食、飼料和工業原料作物,其高產對保障糧食安全至關重要。近日,東北農業大玉米遺傳育種團隊完成的研究在《農業科學學報(英文)》(JournalofIntegrativeAgricult......
水稻作為起源于熱帶或亞熱帶的糧食作物,其生長發育對低溫脅迫敏感。伴隨全球氣候變化加劇,極端低溫事件發生頻率顯著上升,發掘耐冷基因并解析分子機制,有利于水稻高產穩產遺傳改良。目前,利用自然群體挖掘的水稻......
東南亞人群基因組計劃概念圖。受訪者供圖東南亞是全球最重要的人類演化區域之一。該地區人群擁有極高的遺傳多樣性,但基因組學研究卻長期缺失,制約了人類環境適應性進化與疾病遺傳機制的深度解析,因而被稱為全球人......
近日,中國農業科學院油料所(以下簡稱油料所)油料基因工程與轉基因安全評價創新團隊發布了油菜害蟲西北斑芫菁染色體水平高質量基因組數據,明確該害蟲含10條染色體和11687個蛋白編碼基因,為研發害蟲綠色防......
經過20多年的努力,科研人員成功地對6種現存猿類的基因組進行了完整測序,為研究人類進化提供了近距離視角,這被英國《自然》雜志稱為“遺傳學的一個里程碑”。123名來自多個國家和地區的科研人員組成的團隊9......