主要采用抗病毒治療。治療的目的主要是緩解癥狀，減輕疼痛，縮短病程及防止繼發感染等。目前的治療方法尚不能達到徹底清除病毒、消除復發的效果。
1.一般療法
（1）主要是保持局部清潔、干燥。可每天用等滲生理鹽水清洗，疼痛者可口服止痛藥，給予精神安慰。
（2）并發細菌感染者，可外用抗生素藥膏。
（3）局部疼痛明顯者，可外用5%鹽酸利多卡因軟膏或口服止痛藥。
（4）心理支持，說明疾病的性質、復發的原因和如何治療及處理，增強與疾病斗爭的信心。
2.抗病毒藥治療
推薦采用的治療方案包括：阿昔洛韋，口服，每天5次；或阿昔洛韋，口服，每日3次；或伐昔洛韋，口服，每天2次；或泛昔洛韋，口服，每天3次。如果是初發生殖器皰疹，療程為7～10天；復發性生殖器皰疹療程為5天。頻發復發者則需以較低的劑量服用較長時間的療程。