福建農林大學長江學者番木瓜基因組學研究刊登國際期刊

2016年11月28日的，福建農林大學、英國愛丁堡大學、美國邁阿密大學、夏威夷農業研究中心、伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校等處的研究人員，在國際生物學權威期刊《Genome Biology》發表一項重要研究成果，題為“Extremely low nucleotide diversity in the X-linked region of papaya caused by a strong selective sweep”。這項研究提供的資源，將加快木瓜性別決定基因以及其他性別特異性利益相關基因的發現。

本文通訊作者是福建農林大學的明瑞光（Ray Ming）教授。明瑞光教授1995年獲美國夏威夷大學植物遺傳育種博士學位，1995年至1998年在美國德州農工大學從事博士后研究，現為美國伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校農學和植物學教授，福建農林大學海外引進人才。明瑞光教授是國際植物性染色體進化研究和植物基因組進化領域重要領導者和活躍科學家，先后共同主持了13場相關國際學術研討會。曾經在Nature、PNAS、Genomics、Mol Breeding、Plant J、Genome Biology等國際知名期刊發表論文多篇。

2015年1月31日，明瑞光教授與伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校的同事合作，在國際生物學權威期刊《Genome Biology》以研究熱點的形式發表一項重要綜述，這項研究指出，利用全基因組鳥槍測序和分離群體skim測序構建高密度連鎖圖譜相結合的方法，對于組裝異源多倍體基因組是很有效的。

2015年11月，明瑞光教授帶領福建農林科技大學等處的科學家們，通過對菠蘿基因組進行測序，研究了“使多汁的菠蘿植物能夠生長在缺水環境”的基因和遺傳途徑。這一新的研究結果，發表在國際著名學術期刊《Nature Genetics》，對禾草植物的復雜進化歷史，打開了一個新窗口，如高粱和水稻，它們與菠蘿共有一個遙遠的祖先。

在木瓜中，X連鎖多樣性的極度減少，與其他性別系統中觀測到的形成鮮明對比，如人類和類人猿，或果蠅米蘭達的neo-X染色體。X連鎖性的多樣性，被預測高于Y連鎖的多樣性，由于更強的遺傳漂變和“搭便車”效應以及抑制重組。這項研究的證據進一步表明，多樣性急劇減少發生在人類馴化之前，與之對比的是，Yh連鎖的多樣性，其通過雌雄同體性的正向選擇發生在早期木瓜栽培過程中。

低的X連鎖多樣性是很強的選擇性清除的產物，可能發生在12個半合子多外顯子基因當中的一個。盡管不同的雌雄異株和雌性兩性異體育種系統，X染色體卻是高度相似的，并聚成一組。這與常染色體中觀察到的兩個亞組（雌性兩性異體和雌雄異體）以及MSY、HSY區域中觀察到的三個亞組，形成鮮明的對比。這項研究提供的資源，將加快木瓜性別決定基因以及其他性別特異性利益相關基因的發現。