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  • 發布時間:2025-02-24 18:32 原文鏈接: 科學團隊研究組裝無患子染色體級別高質量基因組

    近日,中國林業科學研究院亞熱帶林業研究所林木種質資源研究團隊在《經濟作物和產品》(Industrial Crops & Products)上發表了研究論文。該研究組裝了無患子的染色體級別高質量基因組,分析挖掘了油脂合成候選基因,開發驗證了一套特異分子標記,為無患子基因組學研究和種質遺傳改良及鑒定評價提供了科學依據。

    無患子。中國林科院亞林所供圖

    無患子果皮富含皂苷,種仁含油率高,秋季葉色金黃,是我國重要的天然洗滌原料、生物質能源和彩化樹種。中國林科院亞林所在國內率先系統開展無患子種質資源收集保存、遺傳評價和開發利用等工作。2016年在浙江安吉建成我國首個無患子國家林木種質資源庫,收集保存了無患子全分布區重要遺傳資源。

    該研究基于庫存種質,結合三代測序和二代測序技術,完成了無患子染色體級別基因組組裝。與以往公開的基因組相比,該研究基因組的完整性由83.8%提升至97.64%,并填補了4931個Gaps,極大提高了無患子基因組繪制質量。

    此外,通過基因注釋和比對分析,研究團隊挖掘出6個參與調控無患子種仁油脂合成的候選基因。該研究還基于全基因組序列,開發了20對多態性高、穩定性強的SSR標記,通過346份無患子遺傳資源驗證了其可靠性,揭示了無患子及其近緣種遺傳關系和種質資源豐富的遺傳多樣性。

    該研究得到了浙江省農業(林木)新品種選育重大科技專項、國家科技基礎資源調查專項和林業行業標準等項目資助。

    相關論文信息:https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2025.120694


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