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  • 發布時間:2018-01-05 16:49 原文鏈接: 科學家開發出集合人類血液中化合物的可視化數據庫!

      日前,一項刊登在國際雜志Nucleic Acids Research上的研究報告中,來自日本東北大學的研究人員通過收集5000名志愿者的血液樣本,開發出了集合血液代謝物的數據庫,目前該數據庫將免費提供給全世界的研究人員。

      代謝產物和蛋白質能夠控制機體內部多個生理學過程,同時還能闡明細胞和其周圍環境之間的相互作用,理解這些化合物的產生以及彼此之間的關聯,或能幫助研究人員有效評估個體機體的健康狀況,并開發治療多種疾病的新型個體化療法。

      研究人員將該數據庫稱為“jMorp”,該數據庫中包含了人類306種代謝產物和256種常見蛋白質的相關信息,這包括樣本的頻率、濃度及這些物質在男性或女性中或不同年齡段人群的分布表現形式;這個數據庫具有一定的特殊性,其不僅能夠顯示原始數據,還能為訪問者提供機會來闡明不同代謝產物之間的相互關聯,從而為后期研究提供方法來有效鑒別代謝產物和蛋白質之間的關聯。

      研究者Tadaka說道,jMorp中的信息能夠通過聚合單個數據創建的統計數據來獲得,在開放瀏覽權限之前,獨立委員會或許還應該仔細考慮所涉及的倫理道德問題;類似的數據庫或許還能覆蓋諸如英國和愛爾蘭等國家,但由于不一致的數據收集或小樣本比例的原因,這樣的數據庫或許還存在一定的局限性,向jMorp數據庫提供樣本信息的大量健康個體或讓該數據庫變得更加有用,研究人員還利用相同的方法收集信息并對其進行分析,這就能夠最大限度地減少測量的誤差。此外研究人員還采取了額外的措施來排除任何低質量的樣本,從而就能確保在整個血液樣本的收集、儲存和分析過程保證樣本的質量控制工作,這就能夠使得jMorp數據庫作為科學家尤為可靠的資源以供使用,尤其是生物化學家和醫學研究人員。

      為了讓該數據庫能對其他研究人員有用,研究人員還以一種用戶友好的方式來對該數據庫進行設置,從而就能使訪問者順利看到其所需要看到地信息,同時還能幫助他們進行不同化合物數據信息關系的比較,用戶們也可以通過名稱或規格來進行搜索,同時還能夠對數據的摘要和圖片信息進行下載保存。

      jMorp數據庫的開發是研究人員不斷努力的結果,后期研究人員還將繼續收集并分析更多血液樣本來更新該數據庫,下一步他們計劃應用多種不同的分析手段來深入解讀多種不同的代謝產物和蛋白質的相關重要信息。


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