簡述單分子測序技術—第三代測序技術的基因組測序應用

　　由于具有讀長長的特點，SMRT測序平臺在基因組測序中能降低測序后的Contig數量，明顯減少后續的基因組拼接和注釋的工作量，節省大量的時間[25]。Christophern等[26]僅僅用0.5*的Pacbio RS系統長度的數據與38*的二代測序(NGS)的測序數據，對馬達加斯加的一種指猴基因組進行拼裝，大幅度提高了數據的質量和完整度，同時借助Pacbio RS的幫助將原有的Contig數量減少了10倍。DavidA．等利用Pachio RS平臺C2試劑通過全球合作幾天內就完成了從德國大腸桿菌疫情中獲得的大腸桿菌樣品以及近似菌株的測序和數據分析，最終獲得了2900bp的平均讀長以及99.998%的一致性準確度。在對霍亂病菌的研究中，第三代測序技術已初現鋒芒。研究人員對5株霍亂菌株的基因組進行了測序研究，并與其他23株霍亂弧菌的基因組進行對比。結果發現海地霍亂菌株與2002年和2008年在孟加拉國分離得到的變異霍亂弧菌ElTorO1菌株之間關系密切，而與1991年拉丁美洲霍亂分離株的關系較遠。相對NGS的優勢就是能更快獲得結果，因此該系統在鑒定新的病原體和細菌的基因組測序方面得到很廣泛的應用。