光鏡下口腔小涎腺葉狀腺癌的形態學特點是浸潤性生長、組織病理表現的多樣性和細胞學形態的一致性。腫瘤界限一般清楚，但無包膜，浸潤生長到周圍組織，包括上皮、周圍腺體及結締組織、骨骼等。組織病理在同一腫瘤中可以有不同表現，如實性細胞團、腺體或導管樣結構、篩孔狀、小梁狀或囊腔樣等。神經或血管周圍浸潤生長也常見。瘤細胞呈立方狀或柱狀，形態一致，核卵圓形或梭形，泡狀核或呈點刻狀，核仁小而不明顯，罕見有絲分裂相。細胞質含量不同，少量或中等量嗜酸性或兩染細胞質。腫瘤間質呈黏液樣或玻璃樣變，或為纖維血管間質所分開。有時可見小管內鈣化（沙瘤樣小體psammomalike bodies）。
呈乳頭狀生長的低度惡性乳頭狀腺癌（low-grade papillary adenocarcinoma），應該視其為口腔小涎腺葉狀腺癌的一種組織表現，還是應單獨列為一種類型是有爭議的。Batsakis等認為應看作是口腔小涎腺葉狀腺癌的一種組織結構表現，較之不具乳頭狀生長者更具有侵襲性行為。Batsakis等復習文獻報道的101例口腔小涎腺葉狀腺癌，其中乳頭狀結構生長顯著的有15例，其復發率、轉移率，均較無乳頭狀結構者為高：含乳頭狀結構者的復發率為46.6%，頸部淋巴結轉移率為40%；遠處轉移率6.6%，死于腫瘤者13.3%。而在無乳頭狀結構者的上述情況分別是：17.4%、6.9%、0%和1.2%。