肝衰竭的預后取決于肝細胞壞死程度和再生能力之間的“較量”，如肝細胞大量再生超過壞死，則疾病逐漸恢復，反之，則病情惡化，預后較差。但由于肝衰竭誘因、病因、臨床類型、病程、并發癥及臨床干預措施等的多樣性及個體化差異，目前尚無統一的評估預后的指標。目前公認的凝血酶原活動度（prothrombin time activity percentage，PTA）、凝血酶原時間國際化比率、血肌酐與肝衰竭預后相關。除此以外，一些研究還認為血清甲胎蛋白（alpha-fetoprotein，AFP）、血清鈉、乳酸鹽水平、動脈血氨、磷酸鹽等與肝衰竭預后存在相關性。