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  • 發布時間:2019-10-21 07:24 原文鏈接: 細胞系的DNASTR譜

    • 細胞團抽提

    • 用SGM Plus?進行擴增

    • 利用ABI377DNA測序儀進行凝膠電泳

    • 細胞系結果分析

               

    實驗方法原理 用 Qiagen?QIAamp?迷你試劑盒從細胞團提取 DNA;抽提到的 DNA 用SGMPlius?擴增,然后用 ABI377 DNA 測序儀進行聚丙烯酰胺凝膠電泳,用GeneScan?和Genotyper?軟件進行分析。
    實驗材料

    Qiagen?DNA迷你試劑盒

    試劑、試劑盒

    無水乙醇 磷酸緩沖液

    儀器、耗材

    小離心管 離心機 水浴或可以維持56℃的烤箱 渦流混合器

    實驗步驟

    一、開始實驗前,必須準備以下試劑:

    (a)蛋白酶溶劑溶解:向 Qiagen? 冷凍干燥的蛋白酶中加適量蛋白酶溶劑。該溶液 2~8°C 保存 2 個月內穩定。

    (b)AW 1 和 AW 2 緩沖液:向裝有 AW 1 和 AW 2 濃縮液的瓶子中加人適量無水乙醇。AW 1 和 AW 2 緩沖液室溫下一年內穩定。

    (c)AL 緩沖液:用前顛倒充分混勻。

    二、操作步驟

    (試劑盒生產商的操作步驟,稍加修改)

    如果細胞不是以培養基懸浮的細胞懸液,從步驟 5 進行。

    如果收到的是在培養基中的細胞團:

    1. 樣品 20000 g 離心(離心機,如Eppendorf 5415D 或相似規格) 3 min 。

    2. 用細尖移液管,小心移棄上清液。

    3 . 以 200 μl PBSA 懸浮細胞。

    4. 重復步驟 1、2 一次。

    5. 以 200 μl PBSA 懸浮細胞。

    6. 將 20 μl Qiagen? 蛋白酶加到標記好的 1.5 ml 空離心管(如 Eppendorf Biopure Safelock tubes)中。

    7. 取 200 μl 各樣品,加到相應標記的已加蛋白酶的離心管中。

    8. 每管中加 200 μl AL 緩沖液(裂解緩沖液)。

    9. 樣品在 56°C 孵育 30 min 。

    10. 每管用渦流混旋器混勻約 15 s。

    11. 之后,1000 g 離心 3 s,使管中內容物聚到管底。 .

    12. 小心打開每管,加人 200 μl 無水乙醇。

    13. 每管用渦流混旋器混勻約 15 s。1000 g 離心 3 s,使管中內容物沉淀。

    14. 小心將每管的內容物轉移到對應標記的 QIAamp? 旋轉柱中,該離心柱已置于收集管中。

    15. 抒緊離心柱的蓋子,6000 g 轉 1 min 。

    16. 將旋轉柱置于干凈的收集管中,棄掉含濾液的管子。

    17. 小心打開旋轉柱的蓋子,加入 500 μl AW1 緩沖液。

    18. 重復步驟 15 和 16。

    19. 小心打開旋轉柱的蓋子,加入 500 μl AW2 緩沖液。

    20. 擰緊蓋子,20000 g 離心 3 min。

    21. AW 2 對下游使用有破壞作用,所以建議更換收集管,旋轉柱在以 20000 g 轉離心 1 min 。確保所有的 AW 2 緩沖液已棄掉。

    22. 將柱子放入對應標記的 1.5 ml 離心管中。

    23. 打開柱子的蓋,加 200 μl AE 緩沖液(洗脫緩沖液)。

    24. 56°C 孵育 1 min,然后 6000 g 再離心 1 min 。

    25. 每個樣品的 DNA 進行定量,如用 Picogreen (Molecular Probes)。

    26. 如果不是馬上進行擴增,樣品應凍存。

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