基本方案通過蔗糖梯度浮選 法 制備 去 污劑 抗 性的 膜 并 通 過免 疫 印 跡 對蛋 白質進行分析
材 料
細胞,貼壁或非貼壁
N E /P 緩沖液,單獨或包含以下一種或多種組分:
1 % 、 2 % 或 5 % (W V ) TritonX-IOO
0.lmol/L 碳酸鈉, pHll
5 % 、 3 5 % 或 8 0 % (m /V ) 蔗糖
60m m o l /L 辛基葡糖苷
T N E 緩沖液
去污劑相容的蛋白質檢測試劑盒(如 Bio-Rad)
2 X 或 6 X S D S /樣品緩沖液
丙 酮(可選),冰冷的
乙 醚(可選)
I O c m 的 組 織 培 養 皿(用于貼壁細胞)
22 G 針頭
I m l 和 5m l 的注射器
S W 4 1 轉子和超速離心管(B e c k m a n )
對于貼壁細胞,無需進行比較的細胞系
la. 將細胞鋪于 2 個 I O c m 組織培養皿中,生長至細胞匯合。對 于 D R M 脂 質 分 析(見輔助方案3),則接種細胞至5 個 培 養 皿 或 1 0 個培養皿以定量磷脂酰絲氨酸、磷脂酰肌醇或含量稀少的神經節苷脂。
2a. 用 I m l 含 有 1 % 或 2 % Triton X -100 的 T N E / P 緩沖液置冰上裂解細胞20 min。如果有必要,在裂解緩沖液中加入0. lmol/L 碳酸鈉, p H l l ,以便更好地定量D R M 脂類得率,提 高 D R M 脂質得率,或減少外周或細胞骨架蛋白與D R M 的結合。在分析 D R M 中的酶活性時,不能使用碳酸鹽。
3a. 用細胞刮或橡皮刮將培養皿細胞裂解物刮下來,收于管中。
4a. 如果溶解緩沖液含有碳酸鹽,將裂解液通過帶 22 G 針 頭 的 5m l 注 射 器 1 0 次(保持裂解產物低溫)用于剪切 D N A ,以確保D R M 移至正確的梯度。
對于貼壁細胞,細胞間需進行比較的細胞系
lb. 如需比較兩個不同的細胞類型間D R M 的豐度和得率,按照步驟Ia所示用培養皿培養不同細胞類型的細胞,對每種細胞另接種一個培養皿(以測定培養物的蛋白質含量),確保每個培養皿的細胞數相同。
2b. 用 5 ml T N E 緩沖液漂洗每種類型細胞的一個培養皿2 次 ,用 I m l 含 有 1 % TritonX -100或 者 0. lmol/L 碳酸鈉的 T N E /P 緩沖液裂解細胞。將黏稠的細胞裂解物立即轉 移 至 1.5m l 微量離心管內,并 通 過 22 G 針頭連接的 I m i 注 射 器 1 0 次(或直到黏滯性消失)以剪切D N A 。然后以最大速度離心。
3b. 用去污劑相容的蛋白質檢測試劑盒測定5?IOul等份裂解物的蛋白質含量。將 T N E緩沖液與含有2 % 或 5 % Trit〇n X -100的 T N E 緩沖液混合,來制備含有足量TritonX -100的 T N E /P 緩沖液,使 用 去 污 劑 :蛋 白 質 為 10 : I (m /m ) 混 合 。為增加與脂筏結合較弱蛋白質的得率,使用去污劑:蛋白質為2 : 5 (m /m ) 混合。
4b. 加 入 I m l 含 有 1 % Triton X -IOO 的冰冷T N E /P 緩沖液至剩余的培養皿中,在冰上裂解細胞20 min,在裂解緩沖液中加入0.lmol/L 碳酸鈉, p H l l ,以便更好地定量D R M 脂類得率,提 高 D R M 脂質得率,或減少外周或細胞骨架蛋白與D R M 的結合 。在分析 D R M 中的酶活性時,不能使用碳酸鹽。按照步驟3a 所示操作;如果有必要,按照步驟4a 所示操作。
對于非貼壁細胞
Ic. 培養約5X 107個細胞,并 4°C , 200g離 心 5 min。如需進行細胞間的比較時,應使細胞(來源相同)數量相同。對于脂類分析(見輔助方案3),使 用 2X 108的非貼壁細胞。
2c. 用 5m l 冰 浴 的 T N E 緩沖液重懸細胞,重 復 洗 2 次 。
3c. 用 2m l 含 有 1 % 的 Triton X -100的 T N E /P 緩沖液在冰上裂解細胞20 min。在裂解緩 沖 液中加入〇.lmol/L 碳 酸 鈉 , p H l l ,以 便 更 好 地 定 量 D R M 脂 類 得 率 ,提髙D R M 脂質得率,或減少外周或細胞骨架蛋白與D R M 的結合。在 分 析 D R M 中的酶
活性時,不能使用碳酸鹽。
4c. 如果有必要,按照步驟4a 進行操作。
5 . 將裂解產物與含有8 0 % 蔗 糖的冰冷T N E /P 緩沖液混合。對于來自貼壁細胞的裂解物 ,需要上述加至培養皿中的裂解緩沖液總體積為1.25倍 體 積(即對于 步 驟 3a 或4b 收集的裂解物,加 1.25 ml)。對于非貼壁細胞的裂解物,加 2. 5m l 。完全混合并靜置幾分鐘以便減少泡沫。
6 . 轉移至一個或多個S W 4 1 超速離心管內,移去可能存在的泡沫。每管不超過5 ml。用冰冷的含有3 5 % 蔗 糖 的 T N E /P 緩 沖 液 6?7m l 小心地覆蓋到裂解物/蔗糖復合物上(分層應盡可能的寬),開始倒入液體時應注意觀察以確保其可以浮在上層。如果沒有浮起,則從微量離心管中移去混合物,并徹底混合。如果必要的話,加入少量的8 0 % 蔗糖。
7 . 用 含 5 % 蔗 糖 的 冰 冷 T N E /P 緩 沖 液 填 充 離 心 管 至 距 離 頂 端 約 3m m 。配 平 , 4°C ,l 〇0 00Qg 離心> 3 h (至 24 h)。
蛋白質梯度分布的檢測
8a. 從底端分段收集梯度上的成分,每 份 收 集 lml。加 2 X 或 6 X S D S /樣品緩沖液,通過 SDS-P A G E (單 元 12. 3 ) 和 免 疫 印 跡 法(單 元 12. 5 ) 分析其中 50?100ul 組分。
對于無需免疫沉淀的免疫印跡
8b. 用 5m l 注 射 器 22 G 針頭從離心管的頂端在 5%/35% 蔗糖交界處收集可見的條帶置于 1 個 S W 4 1 超速離心管中。用 冰 冷 的 T N E /P 緩沖液稀釋該膜成分,直到注滿離心管。 4°(:, 100 00(^離心 111。
9b. 移棄上清液。用 100?2 0 0 4 T N E /P 緩沖液移出沉淀物并移至一微量離心管內。用200ul T N E /P 緩沖液清洗超離心管 3 次 ,刮擦管底部以收集沉淀物碎片。將這些清洗液與沉淀物合并。
10b. 4°C ,最高轉速離心 IOmin 以沉淀 D R M 。棄上清液。直接用 2X 或 6X S D S /樣品緩沖液溶解 D R M ,通 過 SDS-PAGE (單元 12. 3 ) 和 免 疫 印 跡(單 元 12. 5 ) 進行分析。
對于低分子質量蛋白質
8c. 依步驟 8b?IOb 制 備 D R M 沉淀物,不 用 S D S /樣品緩沖液來溶解。加 I m l 冰冷的丙酮 至 D R M 沉淀物里,渦旋混勻,置 冰 上 孵 育 lOmin。 4°C ,最 高 轉 速 離 心 lOmin,移棄丙酮。
9c. 在室溫下加 I m l 二乙基醚至管內,渦旋混勻,如上述操作進行沉淀。移去醚并風干。用 2 X 或 6X S D S /樣品緩沖液溶解 D R M 蛋白,以 S D S - P A G E (單 元 12. 3 ) 和免 疫 印 跡 法(單 元 12. 5 ) 進行分析。
免疫沉淀后的免疫印跡
8d. 依照步驟 8b?IOb 制 備 D R M 沉淀物,不 用 S D S /樣品緩沖液來溶解。用 I m l 含有1 % Triton X -IOO 的 T N E /P 緩 沖 液 溶 解 D R M ,置 37°C 孵 育 5 min,或 者 加 入 Iml含 有 60m m o l /L 辛(烷)基葡糖苷的 T N E /P 緩沖液,置冰上孵育 20 min。
9d. 4°C ,最高轉速離心 5 min,以沉淀任何殘存的不溶性物質。將澄清的可溶性 D R M移至新管,通 過 免 疫 共 沉 淀 試 驗(單 元 12. 2 ) 回收目的蛋白,以 S D S - P A G E (單元 12. 3 ) 和 免 疫 印 跡 法(單 元 12. 5 ) 進行分析。
備 選 方 案 用 離 心 法 制 備 去 污 劑 抗 性 的 膜
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