“眾里尋他千百度,驀然回首,那人卻在燈火闌珊處。”對西北農林科技大學生命學院教授劉坤祥來說,苦苦尋找了20年的“他”——植物硝酸鹽受體NLP7,在其帶領的植物氮素營養團隊四年夜以繼日的實驗中,得到了證實。
這一結果9月23日于《科學》在線發表,代表西北農林科技大學在植物營養領域方向的研究取得了重大突破。“這個發現為提高作物的氮利用效率,減少化肥使用和能源消耗,減輕由溫室氣體排放引起的氣候變化,進而支持農業的可持續發展提供了新的啟迪。”
夢想:眾里尋“他”二十年
“我大膽設想植物內是否存在一個類似荷爾蒙的感受蛋白,可以感受到硝態氮的存在,進行下游信號轉導。找到一個硝酸鹽感受器一直是我的夢想。”
劉坤祥本碩就讀于臺灣大學。2003年博士畢業后,他隨即前往美國哈佛醫學院麻省總醫院做博士后。在此前硝態氮吸收轉運研究的基礎上,他萌生研究植物感受硝態氮機制的夢想。
從此開始一直尋找植物是如何感受硝態氮,有哪些蛋白分子可以參與植物感受硝態氮的存在,進而誘導下游基因表達和影響植物生長。“研究植物如何有效地獲取氮,除了對植物是很重要的,同時它也是生物圈內如何從無機氮變成有機氮的重要步驟。沒想到這一找竟然花了20年的時間。”
氮元素是構成生物體最基本元素之一。生物體沒有氮就無法生存。農業生產中,硝態氮是增加農作物產量的重要因素。在1980年左右,人們就認為硝態氮是植物養分和氮的來源;20世紀九十年代,人們發現植物存在感受硝態氮的能力,并且在基因表達水平上檢測到硝態氮不僅是一種營養元素,也可以作為一種信號分子。
雖然之后有很多研究都認為硝態氮是一種信號分子,但當時不清楚植物是如何感受它的。2009年,劉坤祥曾經所在的實驗室發表文章認為CHL1/NRT1.1蛋白除了膜轉運蛋白的功能以外,還存在感受硝態氮的功能,影響后面一些基因的表達。
十多年來,很多研究者都認為CHL1/NRT1.1是硝酸鹽的感受器。但劉坤祥根據多年的研究,認為它不是一個主要的硝酸鹽感受器。他一直懷疑除了CHL1/NRT1.1以外,植物應該還存在其它感受硝態氮的感受器。為了夢想,他一直在文獻與實驗中苦苦探尋。
2008年,有研究者在擬南芥中發現豆科植物NIN蛋白的同源蛋白-NLP7,它的突變體可以影響植物對氮的響應,但對它并沒有進行更深入的研究。之后有很多研究表明NLP作為一個重要的轉錄因子參與了氮信號通路。
2017年,劉坤祥發現一類鈣離子依賴的激酶CPK可以感受到外界硝態氮的刺激,影響鈣離子濃度變化,進而影響CPK的活性。同時也發現,CPK可以通過直接磷酸化NLP調控硝態氮誘導的下游基因表達。
因為找到了Nitrate-Ca2+-CPK-NLP7的連接,而且前期也實驗發現:在沒有硝態氮的情況下,大量表達NLP7或者CPK,并不會誘導下游基因的表達。因此,他極度懷疑NLP7可能可以直接感受硝態氮的存在。“NLP7蛋白感受硝態氮存在兩個可能,首先是NLP7蛋白直接結合硝態氮,其次是有一個所謂的硝酸鹽受體可以感受到硝態氮,然后結構發生改變或者有某個蛋白和它結合,然后再去調節NLP7的活性。”
大多數研究者認為NLP7可能需要跟別的蛋白結合,那個蛋白才是真正的硝酸鹽受體。但劉坤祥始終懷疑NLP7有沒有可能直接結合硝酸鹽,并為此不懈努力著。努力的結果證明他的懷疑是正確的,從設想到懷疑到發現到證明,夢想的實現用了他寶貴的二十年。
發現:“緣”來是“他”驀然間
如何證明NLP7可以直接結合硝酸鹽?這個問題一直縈繞在劉坤祥的腦海間。
一次偶然的機會,他認識了美國實驗室的一位同事。恰巧那位同事當時正在用微量熱泳動儀(MST)做研究,因此,劉坤祥就托他幫忙用MST去檢測硝酸鹽是否會結合NLP7。
由于缺乏經驗,第一次實驗他們沒有發現兩者的互作。但幸運的是,旁邊一位專門做癌癥藥物篩選的專家聽到了他們的對話,發現了實驗中的不足,提供了一些技術上的改進方案,并用儀器證實硝酸鹽會和NLP7結合。
“我非常興奮,因為這證明了我的設想。因為有這樣的發現,我在西農的故事拉開了序幕。”劉坤祥2018年由副校長馬建華和時任生命學院的院長郁飛引進,并給予了他大力支持。
來到學校后,劉坤祥迅速組建了植物氮素營養團隊,全身心投入到NLP7就是一種新的硝酸鹽受體的研究中。目前,他的團隊有博士生7人,碩士生7人,科研助理1人,師資博士后1人。
實驗室初創的時候,需要一臺能夠測量到很小株型植物中硝酸鹽含量的機器。在生命學院黨委書記劉衛軍的推進下,從食品學院農業部食品測試中心找到一臺離子色譜儀。“在本研究中,由這臺機器測定出的結果也用到了文章中,盡管圖片不大,但它也是一個非常重要的研究結果。”
為了增加這項研究的可信度,不少在植物營養研究中不常用到的新技術被應用于此,比如,在動物細胞測試蛋白結合硝酸鹽激活基因表達的實驗、表面等離子體共振等實驗。這些實驗因為在植物營養研究中應用的還很少,所以要做大量的設計和測試。但他們通過巨大的工作量,取得了這些方面的成功。
實證:果然是“他”功未央
“這不是一個人的成功,這是一個團隊的成功。”劉坤祥非常贊賞他的團隊,“他們專注科研,專心實驗,取得了‘1+1>2’的效果,這是我的幸運。”
團隊四年多的努力,證實了劉坤祥的設想,實現了他二十年的夢想——找到了硝酸鹽的感受器。同時,這個NLP蛋白是一個很特殊的例子,直接就是一個感受器,它可以感受到無機營養鹽的存在,可以結合硝酸鹽,去調控它的活性,這是一個全新的發現。
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