近日,PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展:Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing repression。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制,并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。
RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁,也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中,mRNA前體被剪接成為成熟的mRNA一般需要在多種蛋白質及snRNA的幫助下,經歷兩步轉酯剪接反應來完成。目前對于第二步剪接反應的調控知之甚少。
馮英研究組在前期工作中發現了一種特殊的mRNA前體,該前體在剪接反應已經開啟的情況下,僅將轉酯反應進行到第一步即停止,第二步反應則被完全抑制。馮英研究員指導的博士生李璜等研究人員對造成這一特殊現象的機制進行了深入研究。利用多種體外、體內的剪接模型以及定點突變,研究組發現剪接位點附近形成的RNA二級結構會顯著抑制第二步剪接反應的發生;同時還發現單鏈DNA結合蛋白FUBP1通過與剪接沉默子(ESS)元件結合,能夠有效抑制第二步剪接反應的發生。在體外剪接環境中降低FUBP1蛋白水平,可以有效促進第二步剪接反應的效率;而在細胞水平上改變FUBP1的含量不僅會影響該mRNA 前體的剪接,還會改變一系列內源mRNA前體的剪接模式。
該研究加深了人們對于RNA高級結構與剪接調控之間關系的理解,首次證明了MYC調控蛋白FUBP1也同樣具有調控剪接反應的活性,這種剪接調控能力很可能與FUBP1在多種重要生理過程中發揮的功能相關。
該項目得到了中科院、國家自然科學基金委、科技部及上海市科委項目的支持。
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