蔣太交小組在全球蛋白質結構預測比賽中獲佳績

　　2010年第九屆全球蛋白結構預測比賽結果最近揭曉，中科院生物物理研究所研究組發展的Jiang_Assembly蛋白質結構預測服務器進入了前20名，代表著我國在蛋白質三維結構預測領域中進入了世界上游水平。

　　記者從中科院了解到，蛋白質三維結構預測是計算生物學領域中最具挑戰性的一個研究方向，迄今為止還有很多問題懸而未決。為了客觀和有效地評估蛋白質結構預測技術發展水平，1994年美國科學家約翰·莫爾特倡議在全球范圍內進行蛋白結構預測比賽。該項比賽每兩年舉行一次，已成為計算生物學領域中最權威和盛名的比賽，吸引了許多來自生物物理學、計算機科學、高能物理學、計算化學和計算數學等不同領域的專家參加。

　　第九屆全球蛋白結構預測比賽一共預測129個通過X射線或者核磁共振實驗測定的、但結構未公布的蛋白質結構。全球共有176個研究小組和近80個蛋白質預測服務器參加三維結構預測比賽。來自中科院生物物理所蔣太交研究組發展的Jiang_Assembly蛋白質結構預測服務器獲得了19名的好成績，該平臺2008年首次參加比賽時就曾經進入了前50名。蔣太交研究組從2005年起，在中科院“百人計劃”的支持下開始該領域研究工作，在打分方程、主鏈預測流程與側鏈模擬等蛋白質結構預測的重要環節上發展了原創性的算法，發展了一套蛋白質三維結構預測的新方法。這個結構預測比賽的成績已非常接近國際著名的計算結構生物學實驗室水平，表明我國在蛋白三維結構預測領域已經接近世界領先水平。

　　據了解，蛋白質結構預測是一個巨大的系統工程，在預測流程上，既需要發展有效的打分函數，又需要發展有效的算法；在結構層次上，既需要模擬蛋白質的主鏈結構，又需要模擬蛋白質的側鏈結構。因此，蛋白質預測是一個極度注重積累和傳承的研究領域。在結構預測比賽中取得較好成績的研究小組都是積累多年，花費了大量的人力物力。