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  • 發布時間:2016-11-30 16:34 原文鏈接: 蛋白質“社交平臺”建成上線

      美國科學促進會(AAAS)科技新聞共享平臺EurekAlert! 29日報道稱,目前最大的蛋白質—蛋白質相互作用網絡數據庫建成上線,該數據庫集合了超過62.55萬組蛋白質間相互作用,這種規模的數據資源可以闡明多種基因對疾病發展的影響。

      映射大規模蛋白質—蛋白質相互作用網絡的重要性被廣泛認可,但相關數據分散在各種學術文章中。美國、丹麥和英國研究人員合作,整合了來自43000余篇發表文章的數據,創建了這一名為“InWeb_InBioMap”的數據庫。

      團隊負責人卡斯培·拉吉博士說,現代遺傳技術讓定期對癌癥或精神疾病患者基因組進行測序成為可能,但是,了解受致病遺傳變異影響的細胞系統仍然是一個重大挑戰,而“擁有人類蛋白質物理相互作用的更完整地圖,將使我們比以往更精準地探索受疾病影響的細胞過程”。

      團隊聯合主編李泰博(音)解釋說,就像人類社會一樣,蛋白質喜歡在小組中開展工作。“臉譜社交平臺可以基于網絡間交互模式和興趣共享來推斷彼此可能認識的人,蛋白質間相互作用網絡也是如此”,通過探索可能致病的蛋白質間相互作用網絡,可以推斷基因組和分子的路徑,進而加深對發生在人類細胞中生命過程的理解。臨床醫生可以借此觀察遺傳數據模式,為尋找新的致病基因提供新的分子學視角。

      據介紹,該小組還在繼續開發該資源數據庫的其他使用方法,比如通過整合蛋白質組、轉錄組和基因組數據,以改進對復雜生物系統的理解,對這些信息的應用有助于了解心血管疾病、出生缺陷、癌癥、生殖障礙和精神疾病等致病機制。

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