Mario Roederer博士的團隊通過研究單細胞來更好地描述在HIV治療過程中免疫系統的特征。該團隊使用非人類靈長目模式動物,用單細胞基因表達分析提高T細胞的鑒定。他們使用了先進的技術,包括18色 FACS系統和Fluidigm BioMark? 系統進行單細胞基因表達分析。基本研究內容包括:
成熟中樞免疫系統中各組成部分的角色和相互作用
? 發病機理的相關性
理解急性感染如何緊隨CD4記憶細胞的大規模感染和破壞而發生。
? 用于疫苗開發的免疫保護相關性
研究提前注射疫苗以保護CD4記憶細胞不被破壞,以及淋巴細胞預防病毒擴增的功能。
? 促進和發展細胞研究技術
使用先進的儀器,包括FACS系統和Fluidigm的儀器、試劑、分析和方法。
圖:HIV感染的H9 T細胞;來源:NIAID
Roederer博士和他的團隊有一篇方法學論文,題目為:Highly multiplexed quantitation of gene expression on single cells (Journal of Immunological Methods, 2013, 391(1-2):133-145)。
“在免疫學領域,極大的細胞異質性已被廣泛認識,但相應的工作還進行的很少。” -Mario Roederer,Ph.D.
在這篇文章里,Roederer和他的團隊提出了一種在BioMark平臺使用多重TaqMan試劑對單個T細胞進行分析的方法。首先,使用BD FACSAria?,根據細胞的標記將其分離以得到單細胞。接下來,Roederer細化其方法學,確保獲得足量的RNA以進行單細胞的表達譜分析。Roederer等展示了低至一個mRNA轉錄本的檢測極限(limit of detection, LOD),結果表明BioMark的高靈敏度和寬的動態范圍,可以檢測單細胞當量的mRNA。
該團隊在單細胞水平監測了T細胞的激活,發現了群體中CD4+細胞的亞群。實際上,CD4+細胞表達類似CSCR5/CCL5和DPPR/TIA1這樣的基因是稀有事件,并非之前使用大量mRNA觀察到的是普遍事件。
通過比較CD154+和CD154 -T細胞對葡萄球菌腸毒素B(SEB, Staphlyococcal enterotoxin B)的反應,(細胞)的異質性被進一步確立。當被刺激時,分析顯示有一組基因和T細胞的激活強烈相關,但是,只有5-20%的T細胞擁有可以結合SEB的受體Vβ鏈變體。
在這項研究中,細胞異質性被證明有很強的免疫相關性。Roederer和他的團隊正繼續推進系統的、單細胞的方法以更好地理解中樞免疫系統中細胞和分子的相互作用。
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