質譜流式細胞技術推薦論文

　　研究人員將流式細胞技術與質譜分析技術結合在一起，發展出了質譜流式細胞技術（mass cytometry），這種融合技術能在單細胞水平上同時分析超過40種細胞參數，極大的增加了流式細胞分析評估復雜細胞系統和過程的能力。5月5日Cell雜志發表“Mass Cytometry: Single Cells, Many Features”綜述，介紹了質譜流式細胞技術目前的現狀，相關的儀器，主要涉及的應用范圍，以及數據分析方法，和未來的發展前景。

　　推薦論文：

　　Single-cell mass cytometry of differential immune and drug responses across a human hematopoietic continuum

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　　2012年，多倫多大學和斯坦福大學采用同位素標記抗體，結合質譜分析的方法實現了同時對細胞表面多達一百種標記物的檢測。

　　通常采用的熒光抗體標記細胞表面蛋白結合流式細胞術檢測的方法，雖然能實現細胞分選，但只能夠同時識別6-10種不同顏色的熒光，且還需盡量避免發生熒光重疊。

　　而這項研究通過這大量細胞計數法的方法，觀察了人類骨髓產生的不同形態細胞中及表面的34種物質，不但能正確歸類10多種不同類型的免疫細胞，還能觀察到各類免疫細胞的內部變化，從而預知可能發生的變化。研究人員利用這一可以追蹤單細胞多達45種(潛在性的100種或者更多)的技術觀察了人類骨髓產生的不同形態細胞中及表面的34種物質。而且更為重要的是，研究人員不但能正確歸類10多種不同類型的免疫細胞，還能觀察到各類免疫細胞的內部變化，從而預知可能發生的變化。

　　Droplet barcoding for single-cell transcriptomics applied to embryonic stem cells

　　哈佛醫學院Marc Kirschner等人開發了兩種方法，能利用微珠將大量不同的DNA條形碼同時傳送到幾十萬納米大小的液滴中。這些方法都利用了微流體裝置來將細胞和微珠一起裝入這些液滴中。這些液滴是在一個小型裝配線上生成，沿著一根頭發寬的槽道流動。

　　這兩種技術分別為Drop-seq和inDrops。通過Drop-seq或inDrops運行一個批次的細胞，科學家們就可以看到整個樣本中表達了哪些基因——并可以按每個細胞進行排序。

　　目前如果要生成96個單細胞表達譜，成本為一天數千美元。相比之下，Drop-seq每天只需6.5美分就可生成1萬個單細胞表達譜。兩篇Cell文章：廉價的單細胞基因表達分析新技術

　　Highly multiplexed imaging of tumor tissues with subcellular resolution by mass cytometry

　　來自蘇黎世大學與蘇黎世聯邦理工學院的研究人員開發出了一種新方法成功綜合分析和顯影了來自患者樣本的腫瘤細胞。

　　這項技術以醫院常規使用的一些方法為基礎，采用一些抗體標記非常薄的組織切片上的生物標記，抗體偶聯上純金屬同位素，這樣就無需染料采用純金屬同位素來顯影生物標記物，避免了生物樣本分析中顏色數量有限這一問題。而且這種方法有可能確定哪些細胞受到了什么影響及其影響的程度。通過這種方法可以精確找到控制系統的弱點，這有助于開發一些新的治療方法。

　　A Continuous Molecular Roadmap to iPSC Reprogramming through Progression Analysis of Single-Cell Mass Cytometry

　　來自美國斯坦福大學醫學院的研究人員，借助于質譜流式細胞技術進行分析，對細胞重編程的動態變化過程有了更全面的認識。作者指出，這樣得到的結果與傳統的熒光流式細胞術基本相同，但可讓我們每秒鐘在大約500個細胞中同時測量40多種不同的參數。使用質譜流式細胞技術，該研究小組在重編程的第一個3到4周，分析了三個不同的重編程細胞系。對質譜流式細胞技術數據集進行的時間分辨、高維進展分析，可促進連續的重編程分子圖譜的構建。本研究所描述的這種方法和數據集，為重編程優化和其他細胞重編程機制研究、以及隨時間動態變化的復雜細胞群研究，提供了寶貴的資源。