近日鄭春福教授與印度資深教授(總引用次數9000多)合作在Journal of Infection and Public Health (JIPH) 發表新文章：Exploring the structural and molecular interaction landscape of nirmatrelvir and Mpro complex: The study might assist in designing more potent antivirals targeting SARS-CoV-2 and other viruses (探索 nirmatrelvir 和 Mpro 復合物的結構和分子相互作用：該研究有助于設計針對 SARS-CoV-2 和其他病毒的更有效的抗病毒藥物)。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1876034123003271
一些針對SARS-CoV-2的治療分子偶爾被開發出來并獲得批準。 Nirmatrelvir (PF-07321332)是一種重要的抗病毒分子，對大流行病毒具有顯著的活性。Mpro，也稱為 3CLpro，是SARS-CoV-2的非結構蛋白 (NSP5)，是nirmatrelvir的藥物靶點。因此，了解有關 Mpro-nirmatrelvir 復合物的結構和分子相互作用景觀的更多信息是很有意義的。在這里，綜合生物信息學、系統生物學和統計模型已被用來了解Mpro-nirmatrelvir復合物的結構和分子相互作用景觀。 這里從PDB中檢索了兩種大分子復合物用于研究。
該研究涵蓋了相互作用的殘基、氫鍵和相互作用界面，以評估兩種大分子復合物的結構和分子相互作用景觀。第一個和第二個相互作用景觀注意到六個和九個氫鍵形成。觀察到的最大鍵長為 3.33 ?。對于第一個復合物，配體結合袋的表面積和體積分別為 303.485 ?2 和 295.456 ?3。同樣，第二個復合物中配體結合袋的表面積和體積分別為308.397 ?2和304.865 ?3。 通過分析復合物的 NMA 遷移率、特征值、變形能力和 B 因子來評估結構蛋白質組動力學。相反，創建了不同的模型，例如抗病毒分子的熱圖，以評估nirmatrelvir的治療狀態。
我們的研究揭示了Mpro-nirmatrelvir復合物結合模式的結構和分子相互作用。它可能有助于我們更好地了解這種藥物的分子機制。最后，它將指導未來的研究人員設計更廣譜的模仿 nirmatrelvir 的抗病毒分子，這將有助于我們對抗 SARS-CoV-2 和傳染性病毒。這項研究可能有助于我們為未來的流行病或大流行做好公共衛生準備。