雪貂基因組測序加深人類疾病研究

　　 近日，一個國際研究團隊進行了雪貂基因組測序,他們認為這將鞏固雪貂作為研究人類呼吸道疾病如流感和囊性纖維化的生物模型。

　　 研究人員檢查了雪貂感染大范圍流感病毒后基因隨著時間推移的不同表達，通過研究囊性纖維化雪貂模型反映了人類疾病的發展。

　　 基因分析中心的合著人Federica Di Palma在一份聲明中表示“通過創建一個高質量的雪貂基因和轉錄組資源庫,我們演示了如何通過對非常規模式生物的研究促進和鞏固基礎生物科學以及健康行業的發展。”

　　 研究團隊完成了對雌性黑貂的全基因組測序并通過ALLPATHS-LG處理得到了包括差異基因在內的2.41Gb數據。緊接著，他們使用Ensembl和兩性雪貂21個組織中的24個樣本的RNA-seq數據注釋了所測得的雪貂基因組。研究人員通過結合他們所生成的樣本RNA-seq數據和通用蛋白資源庫中哺乳動物和其他脊椎動物的蛋白質序列進一步注釋了雪貂蛋白質編碼基因模型。

　　 基于這些經過注釋的雪貂蛋白質序列,研究團隊構建系統發育樹把雪貂歸類在食肉動物犬科亞目之外。雪貂比嚙齒類更早地從它們和靈長類動物的共同祖先中分化出來。因為嚙齒類從其與靈長類的共同祖先中分化出來以后進化速度較快,基因組與靈長類差異逐漸增大，而雪貂進化較慢，具有比嚙齒類動物更類似于人類的基因組。