本病是一種病因及發病機制尚不明確的炎癥性腸病,目前多數學者認為,本病的發生與免疫因素與遺傳因素有關,而其他各種因素多是誘發因素。
（一）免疫因素
1.體液免疫
本病患者免疫球蛋白常有升高,并可在血清中找到多種非特異性的抗結腸抗體。
2.細胞免疫
本病的發生與細胞免疫功能下降有關。
3.免疫復合體
免疫復合體可能是產生本病的局部病變的原因之一。
（二）遺傳因素
多數學者認為遺傳因素是UC發病的重要因素。
有關數據表明,炎癥性腸病患者與普通人群相比,其家族發病率較高,血緣關系越近發病率越高。
此外,本病的發生具有地區性差異,歐美國家的家族性及發病率明顯高于亞洲人群。在種族差異上白種人發病率高,黑種人發病率低。
（三）腸道菌群失調
有學者認為腸道內致病菌與正常菌群的比例失調是UC發病的觸發點。
（四）環境因素
一系列研究表明,飲食不當、勞累、精神緊張、吸煙、闌尾切除、服用避孕藥、妊娠等,都可以使易感者對腸道細菌的免疫反應能力下降,導致了腸道對正常菌群的耐受性降低,從而誘發了潰瘍性結腸炎。
（五）感染因素
感染與潰瘍性結腸炎的發生密切相關,感染可促使潰瘍性結腸炎發生,但具體作用機制尚待進一步研究。
（六）其他因素
食物過敏,精神障礙,以及一氧化氮、血管損傷與血小板聚集、抗內皮細胞抗體等因素均與UC發生有關。