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3月21日,《分子植物》(Molecular Plant)刊載了中國科學家的最新研究,中國農業科學院作物科學研究所、國家南繁研究院與阿里達摩院(湖畔實驗室)聯合開發,推出了顛覆傳統育種的“全流程智慧育種平臺”。該平臺實現了育種數據管理和分析、計算加速、AI預測親本及優良品種的育種全流程整合,目前已吸引了全國23家科研機構“嘗鮮”。
研究論文信息 圖源:Molecular Plant
傳統育種方法耗時長、成本高,往往需要十年甚至更久的時間,智慧育種平臺將有望大幅縮短育種周期。該平臺不僅整合了種質資源信息管理、育種試驗設計與模擬、高通量數據分析等模塊,還擴大了對育種數據管理和分析的能力。據介紹,該平臺的數據容量、運行速度以及數據安全性均已達到世界先進水平。
智慧育種需要高通量數據分析,依賴龐大的計算和建模、復雜的操作,挑戰很大。前述各單位各自發揮優勢、通力協作,開發出了這個個功能全面、操作界面友好的全流程智慧育種平臺。其作為一個高通量計算平臺,可在網頁端為育種家提供一站式、低門檻的科學支撐服務。目前,全球已有23家科研機構率先采用該平臺,包括中國水稻研究所、中國科學院遺傳與發育生物學研究所、國際畜牧研究所、荷蘭瓦格寧根大學等。
智慧育種平臺主要模塊 達摩院 供圖
為加速育種決策運算,智慧育種平臺引入多種大數據計算、人工智能模型、自動化處理模塊。論文通訊作者、達摩院智慧育種科學家顧斐介紹,平臺實現針對基因測序數據的變異位點計算加速110倍,基因型過濾加速25倍以上,群體遺傳學分析加速1000倍以上。針對全基因組選擇算法,平臺的準確率平均提升15%以上,預測穩定性提升5%。此外,該平臺數據存儲容量達1PB,可支持上百個用戶同時開展高效的育種大數據管理、調度和分析,實現了加速育種決策運算。
另據介紹,該智慧育種平臺的建設啟動于于2021年6月,由阿里巴巴公益基金會、達摩院與中國農業科學院作物科學研究所等多家單位共同建設。
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