超高分辨率解鎖雜質同位素信息
高分辨高質量精度（HRAM）的一級和二級質譜數據是未知雜質分析的有力工具，但這并非是用來結構解析的唯一依據， Q Exactive Focus 具有比常規高分辨更高的分辨率（70,000 FWHM），超高的分辨率可用于進一步解鎖同位素信息，如下圖中，可將 15N 與 13C 同位素分離，由此可判斷該化合物中含有元素 C 和 N，進一步通過兩者同位素豐度比，可判斷出化合物中 C 和 N 的元素比例 , 獲得更準確而唯一的雜質鑒定結果。
高靈敏度帶來卓越的雜質定量能力
在雜質定量研究中， Q Exactive Focus 系統具有和三重四極桿質譜相當的靈敏度和定量能力，可以對法規要求的低濃度基因毒性雜質進行很好的檢出與鑒定。和四極桿質譜常用的選擇離子監測（SIM）和選擇反應監測（SRM）掃描方式不同， Q Exactive Focus 不需要事先用標準品建立譜庫和方法，只要有化合物的分子式信息就可進行定量信號的提取。其超高的分辨率可區分背景基體干擾物，獲得和三重四極桿質譜相當的靈敏度和定量能力，對法規要求的低濃度基因毒性雜質可進行很好的檢出與鑒定。采用全掃描的定量方式可記錄樣品中所有已知和未知雜質的信息，方便數據的回溯分析。 |
質量軸優越的穩定性
長期質量軸穩定性實驗考察結果表明， Q Exactive Focus 對實驗室環境有很強的耐受性，僅使用外標校正就能夠在溫度波動的情況下保持長期穩定的質量準確度。
藥物中的雜質在不同電離極性之間的電離效率可能會有巨大差異。而在 MS 和 MS/MS 模式下掃描間正負極性的快速切換，確保 Q Exactive Focus 系統能夠在單次色譜運行中最大限度地檢測和鑒定雜質。
數據分析
雜質的種類繁多，來源廣泛，即使是相同元素組成的化合物，結構也可能完全不同，所以需要專業的分析軟件對采集到的數據進行分析，對可能的雜質進行有效的提取和分析，對推測的結構式進行判斷。
專業雜質分析軟件
Compound Discoverer（化合物發現者）是智能的小分子化合物發現和鑒定軟件。研究人員使用該軟件，可以方便的實現以下功能：
● 可根據預設的分類對不同條件下的樣品進行分組和批量處理；
● 根據研究需要設定自定義的數據處理流程；
● 利用多種先進的處理技術：多重質量虧損過濾（MMDF）、同位素過濾（IPF）、碎片離子檢索（FISh Scoring）等功能對預期和未知的有關物質進行提取分析；
● 在結果瀏覽中直觀的獲得不同條件下樣品差異比對結果。
Mass Frontier 專業的結構解析軟件為質譜譜圖的管理、評估和解析提供精密的特性。通過調用豐富的碎裂數據，可快速的對母藥碎片結構進行了準確推測和歸屬，通過對雜質與母藥的比對分析，可進一步對雜質變化位點進行推測，最終獲得全面的雜質鑒定結果。
使用 Mass Frontier 軟件，研究人員可以方便的從已采集的數據中獲取以下信息：
● 化合物的裂解機理
因為雜質的結構和母藥的結構往往類似或者具有淵源，所以了解母藥的裂解規律可以幫助判斷雜質的碎片結構，進一步推測出雜質的結構。
以前的方法僅僅依靠研究者的個人經驗，或者純理論的計算，使得數據分析的重現性和準確性受到了限制。
Mass Frontier 所含有的 Fragmentation Library 碎裂機理譜圖庫是從現存的所有關于質譜的出版物中收集而來，幾乎涵蓋了所有已發表的文獻。每一種機理，連同其化學結構，都經過人工和自動核對，然后連同標題、作者及信息來源等附帶信息一塊儲存于譜圖庫中。譜圖庫所收集的信息，加上通用的電離、碎裂和重組規則，為碎裂機理的預測提供了有力的保障。 Mass Frontier 還可以允許用戶創建基于客戶自定義碎裂機理上的譜圖庫，并能學會并運用這些機理來智能預測碎片分子。
● 有關物質的檢獲
一些雜質組分會因為信號響應太低，或者形成的色譜峰不夠尖銳，而被研究人員忽略，但是含量很低的毒性雜質嚴重的影響藥物安全性，漏檢不僅會極大的影響用藥的安全性，也會間接影響到新藥申報。
Mass Frontier 的 Fragment Ion Search (FISh) 可通過過濾無論是由理論裂解預測還是由實驗 MSn 質譜譜樹
獲得的一組裂解碎片可對結構相似化合物進行快速篩選，通過雜質與母藥的碎片比對查找，精確的找出所有有關雜質。
