2015Nature、Science你不容錯過“五大論文”

　　轉眼又到了年中，各位或許都在忙于應付各種考試，準備研討會，參加會議，撰寫論文，完成試驗等等各種事務。而遺憾的是，卻從未留出足夠的時間來享受（或甚至找到）一兩篇真正好的研究文章。近日，BioTechnique網站為我們列出了今年值得關注的一些好的文章，來看看其中有沒有你錯過的吧……

　　Multiplex single-cell profiling of chromatin accessibility by combinatorial cellular indexing（Science）

　　從表面上看，這篇論文主要是定義了巨大數量單細胞的染色質狀態。然而再細細品味一下，你或許就會發現Jay Shendure最新研究方法中一些有趣的東西——它是基于一種組合索引策略，除了染色質狀態這種策略還可用于排序很多的事項。事實上，這并非是第一篇采用這種索引方法的“大”文章：Shendure的研究小組過去就曾采用這種方法相序排列了基因組DNA。因此，我們認為這篇論文值得一看，當這種索引策略再次出現時——這次或許就會在你的領域里。

　　Recoded organisms engineered to depend on synthetic amino acids（Nature）

　　現在轉基因生物(GMOs)出現越來越頻繁。采用諸如CRISPR/Cas9一類的方法很容易就可以實現對生物的基因組改造，在未來有可能我們會看到越來越多的轉基因生物。這由此提出了一個問題：如何最好地隔離和管控這些轉基因生物？

　　這篇在2015年初發布的文章報告了首個“基因組重編碼生物”（recoded organism），研究人員通過表達一些基因限制了基因組重編碼生物的生長，而這些基因的表達則依賴于外源供應的一些非常特異的合成氨基酸。這項研究工作的影響相當廣泛且令人印象深刻，它展示了分子生物學的未來。

　　CRISPR/Cas9-mediated gene editing in human tripronuclear zygotes（Protein Cell）

　　我確信你肯定聽說了這篇首次在人類細胞中測試CRISPR/Cas9基因組編輯的文章。這篇論文的發表引發了在推動基因組編輯技術進步之時怎樣做才最好的相關激烈討論，因此對于所有對未來數年里科學界將如何適應新技術感興趣的人來說這篇文章值得一讀。

　　此外，研究結果還表明了CRISPR-editing還未達完美，我們還需要退回去更多地了解這一技術，或是在未來的實驗中改進方法，尤其小心使用它。而無論從哪方面的意義來講，這篇論文所具有的獨特意義都值得你在今夏讀一讀它。

　　Expansion Microscopy（Science）

　　來自麻省理工學院的研究人員Ed Boyden和同事們在這篇文章中，采用了一種非常簡單成本也很低的方法，他們沒有從顯微鏡上下功夫，而是從組織樣本下手，利用一種吸水膨脹的聚合物將組織樣本整體放大，使得采用普通共聚焦顯微鏡也能達到超越200nm的分辨率。

　　該研究團隊采用這種膨脹顯微技術（Expansion Microscopy）在常規共聚焦顯微鏡下成像了500×200×100微米的大腦組織切片。而其他超高分辨率技術難以成像這么大的樣本。

　　Tissue-based map of the human proteome（Science）

　　由Mathias Uhlen和同事們撰寫的這篇論文之所以尤其有趣，是因為研究人員利用了兩種強大的方法——基于組織芯片的免疫組化和RNA測序來了解細胞中發生的事件，并第一次檢測了人類基因組的業務終端——32個不同人類組織中蛋白質的表達模式。項研究為我們打開了開始了解人類細胞和組織中的蛋白質生成模式和過程的大門。