64％中國癌癥患者有可用藥的潛在臨床基因突變

論文截圖

研究人員在分析數據（受訪者供圖）

近日，《自然-通訊》刊發了一項由中山大學孫逸仙紀念醫院王銘輝教授團隊聯合多家醫院及至本醫療針對亞洲癌癥人群基因組特征的研究成果。該成果從基因層面將中國人群與西方人群突變特征的異同進行了系統分析和全面對比，全面闡述了東西方癌癥患者的不同臨床基因組特征，是截止目前最大規模的亞洲癌癥人群基因組全面分析。

研究共報告了超過1萬例中國患者泛實體腫瘤體細胞突變情況，包含了25個癌種100多個腫瘤亞型，并首次發現，64%的中國癌癥患者具有臨床上可用藥的潛在基因突變。這對選擇患者進行分子靶向治療的臨床試驗具有重要意義，也可以幫助制藥企業快速篩選藥靶，明確臨床適應癥，制定新藥研發的策略，加速新藥上市。

填補亞洲癌癥人群大規模泛癌種臨床基因組學數據

癌癥的發病率和死亡率仍然是全球公共衛生面臨的主要挑戰。根據國家癌癥中心數據顯示，中國每年新發癌癥人群超過400萬人，每年有超過200萬人死于癌癥。近年來，隨著精準醫學的發展，癌癥正在向基因組學、精準腫瘤學、個體化診療等方向快速發展。

而癌癥的發生發展受到基因、年齡、環境、習慣、地域等多個因素的影響。西方人群在這一領域的研究已取得了長足的進步，發現了一系列在癌癥發生發展中發揮驅動作用的癌癥相關基因。

亞洲癌癥人群有著自己的“特色”，但遺憾的是，國內一直缺乏大規模的系統性的臨床基因組數據。

鑒于此，研究團隊收集了超過萬例亞洲癌癥患者的樣本，覆蓋100多種癌癥亞型，通過二代測序（NGS）技術對這些腫瘤樣本進行全面測序和對比分析，并與已發表的最大的癌癥基因組研究——美國紀念斯隆凱特琳癌癥中心（MSK）的隊列進行了比較。

“我們從基因層面將中國人群與西方人群突變特征的異同進行了系統分析和全面對比，全面闡述了東西方癌癥患者的不同基因組特征，研究填補了亞洲癌癥人群大規模癌癥基因組學對比研究的空白。”王銘輝表示，該研究為中國精準治療的國際實時接軌提供了重要基礎證據。

為了保證測序結果的一致性，據該研究論文作者之一、至本醫療的生物信息負責人陳惠表示，所有二代測序通過均由至本醫療負責，盡可能地排除流程不一致造成的分析偏差，從而提供高質量的數據分析基礎。

為接軌國際精準治療提供重要基礎證據

據了解，該研究共包含了31個民族的癌癥患者樣本，包含了25個癌種100多個腫瘤亞型。主要腫瘤類型是非小細胞肺癌、結直腸癌、肝細胞癌、胃癌、食管癌、軟組織肉瘤、肝內膽管癌、胰腺癌、肝外膽管癌和乳腺癌。

“我們研究對癌癥的基因組與中國癌癥患者臨床特征進行了系統的整合和大規模研究，主要集中在多個臨床特征（年齡、性別、腫瘤分期、吸煙史、治療和樣本類型）的相關性關聯上。”王銘輝說，總的來講，臨床特征相關的基因組差異分布在結直腸癌和肺癌中。

比如，早期非小細胞肺癌的女性非吸煙者EGFR突變較多，而晚期非小細胞肺癌的男性吸煙者TP53、CDKN2A、PIK3CA和KRAS突變較多。

而針對于東西方人群泛癌種的腫瘤組織體細胞基因組在各癌種中的發生率的情況，研究結果顯示，具有極大的相似性，只有少數幾個具有顯著差異。比如，在肺腺癌群體中，中國肺腺癌患者的EGFR突變和TP53突變頻率比西方人群更高，而KEAP1突變相比西方患者較低。

“這個結果說明癌癥基因組特征無國界，種族之間差異很小，但在個別癌種上，中西方癌癥人群的基因突變還是有顯著差異。這為中國癌癥精準治療與先進的國際診療技術實時接軌提供了重要依據。”陳惠說。

期待更多患者得到個體化精準診療

值得一提的是，該研究首次發現，64%的中國癌癥患者具有臨床上可用藥的基因突變。按照中國每年400萬新增癌癥人群計算，這意味著，每年有超過250萬的中國癌癥患者可以通過基因檢測對癥用藥，選擇適合的靶向/免疫藥物，延長生存期，獲得更高的生活質量。

并且，研究還是第一次大規模的泛癌種腫瘤突變負荷（TMB）分析，分析了TMB在泛癌種人群中的分布，表明中國肺癌患者有很高比例可以從免疫治療中獲益。

對此，研究人員在具體對比前，把所有能夠獲得的東西方數據集都有的臨床因素進行收集，然后拿統計學均衡處理后的數據集進行對比。

“該研究為癌癥醫學提供了高度可靠的數據集和資源。而精準數據是個體化診療的基石，比如不同的性別、年齡結構、生活習慣、發病部位、分子結構。我們把這些信息串聯在一起，就可以找到最適合服務中國患者的個體化精準診療方案，提高癌癥患者的五年生存率。”至本醫療數據中心負責人王傲迪說。