BBC：人類首張蛋白質組草圖繪制完成

　　一個德國的團隊和一個美國印度聯合團隊將他們的蛋白組圖譜發表在了《自然》雜志上，他們的結果在公共網站上也可搜索到。

Figure 1蛋白（綠色）由中間的RNA（粉色）分子翻譯所得，RNA則由我們的基因復制所得

　　他們首次試圖建立起關乎每一個人的蛋白質數據庫。這些結果基于我們對基因組的了解---我們知道何種基因在何種組織中生產蛋白質。

　　研究共報道了17,000至18,000種蛋白質。其中一些來自曾經認為是非編碼的DNA片段。

　　在我們的每一個細胞中所包裹的超長DNA上，我們的基因只是其中的一部分，它包含用于生產蛋白質的指令和代碼。

　　“雖然我們對基因組已經有了不錯的了解，卻還不知道這將近20,000個能用來編碼的蛋白質基因中有多少能真正用以生產蛋白質。” 帶領德國團隊的慕尼黑工業大學Bernhard Kuester教授說。

意想不到的結果

　　為了找出答案，研究人員從人體組織的許多不同的樣品以及一些細胞系中提取所有蛋白質。接著將這些純化后的混合物中的蛋白切碎成小片段，利用質譜技術揭示組成每一個小片段的氨基酸序列。

　　憑借強大的計算資源及足夠的耐心，我們可以將這一批蛋白質片段與人類基因組進行比較，從而制作圖譜，以顯示哪些組織中的哪些基因被“表達”而產生蛋白。

　　Figure 2為了將組成人體的所有蛋白進行編排，研究人員使用了一系列的樣品，包括成體組織，胎兒組織和許多細胞系

　　“如果你喜歡這種說法，這是（人類蛋白質組的）第一份清單，” Kuester教授告訴BBC新聞記者，“就像十幾年前人類基因組的初稿那樣。”

　　并且正如人類基因組計劃的結果一樣，這些數據中包含了一些驚喜。

　　兩組團隊均發現了數百種意想不到的蛋白質，它們是由古基因（稱為“偽基因”）片段或者那些根本不認為是基因的DNA片段產生。

　　除了這些蛋白質的新成員之外，還有一些明顯的“缺席者”。“我們有充分的理由相信，數百個已知的，且已經被解析的基因，它們也許是多余的。” Kuester教授說。

　　美印團隊，由美國巴爾的摩約翰霍普金斯大學教授AkhileshPandey領導。他們的研究找到了一些證據，證明從基因組中我們只能預測全部蛋白質的84%。

超越遺傳學

　　Pandey教授告訴BBC，研究蛋白質本身與研究編碼它們的基因同樣重要。

　　說到研究特定基因的研究者如何利用這個新數據庫，他舉了一個例子：“他們可以觀察蛋白質的表達并且知道這個蛋白質的作用。比如說，如果一個蛋白質在胎兒腸道而非成人腸道中表達，那么他們或許應該考慮這個蛋白質可能參與了發育過程。”

　　組織依次分解的方法也可以幫助科學家們弄清藥物的作用及副作用。通過比較不同癌細胞系的蛋白質組，Kuester教授和他的團隊已經確定了一些蛋白質簇，這些蛋白質可以增強或減弱對癌癥藥物的敏感性。

　　Kevin Mills博士曾使用蛋白質組學研究了UCL兒童健康研究所的罕見病例，他認為在蛋白水平上觀察“超基因組學”并觀察它們如何變化非常重要。

　　“遺傳學不能告訴我們一切，” Mills博士說道，他并沒有參與上述兩項研究。“這的確是非常重要的。我們并不是靜止的——我們是不斷變化的，我們的蛋白質組也在持續地變化著。”

　　他們在會議上看到過彼此的工作，但Pandey教授和Kuester教授告訴BBC新聞，他們并不知道會同時發表結果。上周，他們發現他們的工作將同時在《自然》的封面上閃亮登場時，彼此通了一個電話。

　　“我們從未把這當成是爭奪冠軍的競賽，” Kuester教授說，“我的理解是，當時機成熟的時候，自然會有某個人去做。或許是某兩個人！”

　　Pandey教授將如今的聯合發表結果與人類基因組的初稿做了一個比較，那是2001年2月由兩個不同的團隊公布的。

Figure 3 Pandey教授（中）和他的團隊花了兩年的時間生成并分析了這些數據

　　“雖然兩個團隊得到了類似的基因數目，但他們的基因列表是很不同的，”他說。“我們的結果在一致性上要好很多，不過把兩份數據放在一起絕對是有益的。