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  • 發布時間:2021-08-17 17:00 原文鏈接: CASMS分論壇:多組學整合與大數據

      分析測試百科網訊 美國東部時間2021年8月9日-13日,首屆美國華人質譜學會(CASMS)學術研討會暨展覽會在Gather.Town隆重舉行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分論壇中,哈沃德醫學院Steven Gygi博士、太平洋西北國家實驗室(PNNL)Weijun Qian博士、貝勒醫學院Bing Zhang博士、上海藥物研究所Minjia Tan博士、圣裘德兒童研究醫院Junmin Peng博士帶來精彩報告。分析測試百科網作為大會支持媒體,為您帶來全程跟蹤報道。

      報告人:哈沃德醫學院Steven Gygi博士

      報告題目:The BioPlex Networks: Proteome-Wide Protein-Protein Interaction Networks in Two Cell Line

      報告介紹了一個強大的高容量AP-MS平臺,并用它創建了兩個細胞系特異性的人類相互作用組蛋白質組圖譜。這兩個圖譜極大地擴展了對人類蛋白質相互作用的理解,揭示了成千上萬種新的蛋白質相互作用。兩個圖譜之間共享的交互作用定義了一個高置信度、實驗復制的核心人類交互組模型。細胞系特異性相互作用傾向于反映每個細胞系的獨特生物學特性,同時增加人們對蛋白質相互作用景觀的理解范圍。

      無論是單獨觀察還是共同觀察,細胞系特異性人類相互作用組蛋白質組圖譜為人類蛋白質組組織提供了獨特而有力的見解。

      報告人:太平洋西北國家實驗室(PNNL)Weijun Qian博士

      報告題目:Discovery of Autoimmune Signatures of Progressive Pancreatic Beta Cell Dysfunction in a Pre-Symptomatic Type 1 Diabetes Patient Using Single Islet Proteomics

      近單細胞或空間組學工具可能在詢問早期疾病組織中的細胞異質性方面發揮重要作用。

      目前對T1D前供體進行的供體內胰島異質性研究說明了這種方向的潛力。

      總體數據仍處于初步階段。需要更多捐贈者的數據才能對T1D進展進行更全面的分析。

      報告人:貝勒醫學院Bing Zhang博士

      報告題目:Proteogenomics Drives Therapeutic Hypothesis Generation for Precision Oncology

      報告指出綜合通路特征為靶向治療和免疫治療提供了新的見解;蛋白質組學分析能夠系統鑒定癌癥相關蛋白和磷酸化位點;蛋白質基因組整合優先考慮拷貝數驅動因素和新抗原候選。

      報告人:、上海藥物研究所Minjia Tan博士

      報告題目:Integrative Proteomic Characterization of Tumor Samples Identifies New Therapeutic Opportunities

      肺腺癌(LUAD)和肺鱗狀細胞癌(LUS)是非小細胞肺癌的主要類型。LUAD約占肺癌的50%,對非吸煙患者的診斷大幅增加。LUAD治療面臨的挑戰有無靶向治療、靶向治療中的原發性/獲得性耐藥、早期診斷和治療困難。

      報告介紹了早期LUAD的蛋白質組學特征等。研究指出綜合多組學分析更好地反映掃描生物學和臨床教學,靶向蛋白PTM串擾可能是一種有效的治療方法。

      報告人:圣裘德兒童研究醫院Junmin Peng博士

      報告題目:The Proteomics Landscape of Alzheimer's Disease

      Alzheimer's Disease是最常見的癡呆癥,美國第六大死因。目前美國有580萬AD患者,到2050年全世界將有1億。2020年護理成本為3050億美元。神經退行性疾病中有蛋白質聚集,蛋白質組學是Alzheimer's Disease的關鍵。

      報告介紹了AD中的剪接功能障礙、AD病例的蛋白質組分析、改變蛋白質/基因的優先順序、AD發病機制:平衡模型等。

      關于Multi-omics Integration and Big Data的演講人介紹,請見:http://casms.org/?action=content&id=62

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