COVID19檢測小貼士

發布時間：2020-02-24 16:06 原文鏈接： COVID19檢測小貼士

　　為了支持新型冠狀病毒（COVID-19）的檢測及疫苗研發工作，美國疾病預防控制中心（CDC）和中國政府都已完成了新型冠狀病毒基因組的測序并將結果提交至US NCBI GenBank?數據庫 [1]。近日，IDT收到了來自世界各地研究人員關于新型冠狀病毒檢測試劑盒的詢問，以下是部分簡要說明。

　　美國疾病預防控制中心

　　美國疾病預防控制中心檢測試劑盒* 靶向COVID-19核衣殼蛋白基因（N-基因）上的不同位點。該試劑盒中的3組引物/探針必須與靶向人RNase P基因的內部對照同時運行。每個患者樣本共需進行4次qPCR檢測。

　　1.該檢測試劑盒采用一步法qPCR反應（即逆轉錄和后續qPCR反應在同一步驟中完成）；

　　2.所有3次N-基因檢測只有在Cq<35時方可視為陽性結果；

　　3.RNase P內部對照反應是關鍵。Cq >35表示樣本提取不佳，需要重復實驗；

　　敬請查閱最新的美國疾病預防控制中心 COVID-19 RT-PCR檢測方法實驗室指南，獲取相關文檔及實驗方案。

　　與其他檢測試劑盒的比較

　　世界衛生組織（WHO）

　　世界衛生組織實驗方案不同于美國疾病預防控制中心實驗方案。世界衛生組織建議需進行3次qPCR反應來確認是否感染COVID-19。盡管這是一套完整的實驗方案，但沒有美國疾病預防控制中心檢測方法來得快，因為它需要連續進行3次檢測，且必須觀察到陽性結果才能進行下一次檢測。該實驗方案按如下順序進行檢測：

　　1.冠狀病毒E-基因

　　2.RdRP基因：針對SARS 冠狀病毒和其他蝙蝠相關冠狀病毒

　　3.RdRP基因：針對COVID-19

　　中國疾病預防控制中心

　　中國疾病預防控制中心檢測試劑盒建議采用2組引物/探針。第1組靶向ORF 1ab，第2組用于確認COVID-19的N-基因。

　　對照組

　　初步的電子模擬分析表明，搭配使用 IDT N-基因陽性對照組模板**與美國疾病預防控制中心檢測試劑盒，與使用中國疾病預防控制中心、泰國衛生部以及HKU的引物/探針組進行類似實驗獲得的結果相符。當然，這是基于電子模擬研究，建議用戶在自己的實驗室中對所選試劑盒進行驗證。