Cell雜志最受關注十篇文章（12月）

　　Cell創刊于1976年，現已成為世界自然科學研究領域最著名的期刊之一，并陸續發行了十幾種姊妹刊，在各自專業領域里均占據著舉足輕重的地位。 Cell以發表具有重要意義的原創性科研報告為主，許多生命科學領域最重要的發現都發表在Cell上。本月《Cell》前十名下載論文為：

　　1. Hallmarks of Cancer: The Next Generation

　　Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg

　　老牌明星論文，上榜無數次了，

　　由癌癥研究泰斗：Robert A.Weinberg完成的最新癌癥綜述是之前他的一篇文章“The Hallmarks of Cancer”的升級版――之前那篇文章介紹了腫瘤細胞的六大基本特征，被稱為腫瘤學研究的經典論文，到目前為止，這篇論文已經被引用了上萬次。

　　2011年3月，Robert A.Weinberg同樣是和Douglas Hanahan合作，完成長達29頁的論文，簡述了最近10年腫瘤學中的熱點和進展，包括細胞自噬、腫瘤干細胞、腫瘤微環境等等，并且將原有的腫瘤細胞六大特征擴增到了十個，這十個特征分別是：

　　自給自足生長信號(Self-Sufficiency in Growth Signals);抗生長信號的不敏感(Insensitivity to Antigrowth Signals);抵抗細胞死亡(Resisting Cell Death);潛力無限的復制能力(Limitless Replicative Potential);持續的血管生成(Sustained Angiogenesis);組織浸潤和轉移(Tissue Invasion and Metastasis);避免免疫摧毀(Avoiding Immune Destruction);促進腫瘤的炎癥(Tumor Promotion Inflammation); 細胞能量異常(Deregulating Cellular Energetics);基因組不穩定和突變(Genome Instability and Mutation)。

　　2. Transcriptional Silencing of Transposons by Piwi and Maelstrom and Its Impact on Chromatin State and Gene Expression

　　Grzegorz Sienski, Derya D?nertas, Julius Brennecke

　　來自奧地利維也納分子生物技術研究所的研究人員發現了轉座子和piRNA對染色質模式，以及基因表達的廣泛影響，對于未來深入探索這一沉默途徑，以及染色質狀態基因表達具有重要的意義。

　　研究人員發現了果蠅中，Piwi介導的沉默途徑的一種新作用因子：HMG蛋白Maelstrom，這一蛋白是Piwi沉默途徑中的必須元件。

　　研究人員通過全基因組分析發現了RNA聚合酶II的聚集，以及新合成RNA的輸入，以及在缺失Piwi或Maelstrom時轉座子穩定RNA水平之間的密切關聯，這表明piRNA介導的上百個轉座子的反沉默(trans-silencing，生物通譯)是在轉錄水平上拷貝的。

　　而且研究人員也指出Piwi對于轉座子和基因組環境中建立異染色質H3K9me3標記也十分重要，如果丟失Maelstrom，雖然只會輕微影響到轉座子 H3K9me3模式，但是卻會造成異染色質廣泛傳播，這說明Maelstrom具有與H3K9me3平行，或者處于下游的功能。

　　這些研究數據表明了轉座子和piRNA對染色質模式，以及基因表達的廣泛影響，對于未來深入探索這一沉默途徑，以及染色質狀態基因表達具有重要的意義。

　　3. Daddy Issues: Paternal Effects on Phenotype

　　Oliver J. Rando

　　4. Nuclear Aggregation of Olfactory Receptor Genes Governs Their Monogenic Expression

　　E. Josephine Clowney, Mark A. LeGros, Colleen P. Mosley, Fiona G. Clowney, Eirene C. Markenskoff-Papadimitriou, Markko Myllys, Gilad Barnea, Carolyn A. Larabell, Stavros Lomvardas

　　嗅覺受體基因的核聚集可控制單基因表達

　　5. Revisiting Global Gene Expression Analysis

　　Jakob Lovén, David A. Orlando, Alla A. Sigova, Charles Y. Lin, Peter B. Rahl, Christopher B. Burge, David L. Levens, Tong Ihn Lee, Richard A. Young

　　研究人員報道，在當前許多各種不同的生物學研究中，用于產生和理解全局基因表達分析數據的常見假設能夠導致關于基因活性和細胞行為方面嚴重缺陷性的結論。

　　今天對基因表達數據的大多數理解都依賴于一種假設：用來分析的所有細胞擁有類似的mRNA總量，其中mRNA大約占細胞RNA中的10%，作為蛋白合成的藍圖發揮作用。然而，一些細胞，包括惡性癌細胞，要比其他細胞產生幾倍多的mRNA。傳統的全局基因表達分析通常忽略這些差別。

　　這篇新研究在研究表達高水平c-Myc的癌細胞的基因表達時揭示出這種缺陷。已知c-My是一種基因調節物，在惡性癌細胞中高度表達。當比較表達高水平c- Myc的細胞和表達低水平c-Myc的細胞時，他們吃驚地發現不同的基因表達分析方法能夠產生顯著性的不同結果。進一步的研究揭示出在含有高水平c- Myc的和低水平c-Myc的細胞中存在顯著性的不同，不過這些不同利用常見使用的實驗方法和分析方法來掩蓋掉。

　　6. MED12 Controls the Response to Multiple Cancer Drugs through Regulation of TGF-β Receptor Signaling

　　Sidong Huang, Michael H?lzel, Theo Knijnenburg, Andreas Schlicker, Paul Roepman, Ultan McDermott, Mathew Garnett, Wipawadee Grernrum, Chong Sun, Anirudh Prahallad et al.

　　研究人員發現了引起對許多癌癥藥物耐受的一個關鍵基因。這一研究揭示了一個生物標記物，可以預測對于癌癥藥物的反應，提供了一種基于它們的遺傳標記治療耐藥性腫瘤的新策略。

　　研究小組開發了一種篩查方法鑒別哪些基因抑制賦予了非小細胞肺癌細胞對crizotinib的耐藥性。他們發現了癌癥中發生突變的一種基因MED12，它的抑制不僅可導致對crizotinib耐藥，而且造成了用于治療各種類型癌癥的其他靶向性藥物和化療的耐受。

　　研究人員還發現MED12抑制是通過增強轉化生長因子β受體(TGF-betaR)這一與細胞生長和死亡相關的蛋白質信號引起了耐藥性。在MED12缺陷細胞中抑制TGF-betaR信號，可使它們恢復對藥物的反應。結果表明當前在臨床試驗中測試的TGF-betaR抑制劑或可對抗MED12突變癌癥患者的耐藥性。

　　7. Facilitators and Impediments of the Pluripotency Reprogramming Factors" Initial Engagement with the Genome

　　Abdenour Soufi, Greg Donahue, Kenneth S. Zaret

　　一個科學家小組開展了一些細致的檢測研究，更深入地了解了iPS細胞的形成機制，并找出了Yamanaka的重編程程序效率低下的原因。研究揭示了iPS細胞形成的一些細胞障礙，如果克服它們可以大大提高iPS細胞生成的效率和速度。

　　這些研究提供了詳細的見解，重編程因子如何與分化細胞染色質相互作用，啟動它們沿路向干細胞轉變，研究還鑒別了染色質中一個重要的結構性障礙，重編程因子必須克服這一障礙才能結合DNA。這一知識將有助于提高重編程的效率，這對于未來的治療應用非常重要。

　　8. FOXP2 and Human Cognition

　　Philip Lieberman

　　9. SnapShot: Telomeres and Telomerase

　　Andrea J. Berman, Thomas R. Cech

　　10. Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic and Adult Fibroblast Cultures by Defined Factors

　　Kazutoshi Takahashi, Shinya Yamanaka

　　這篇是今年諾貝爾生理/醫學獎得主山中伸彌的代表作，這篇論文中，山中伸彌等人首先用4個干細胞轉錄因子OCT4、SOX2、KLF4和c-MYC, 通過體細胞重編程將小鼠成纖維細胞轉化成具有胚胎干細胞特征的iPS細胞。這才有了其后的iPS陸續研究成果。