【Cell綜述】從癌癥基因組到精準腫瘤學

　　迅速發展的基因組技術讓有限的腫瘤活檢材料獲得更廣泛的分子分析,從而促進更廣泛地實施個性化癌癥治療。以基因組為基礎通過不同腫瘤的患者分類化目前還不太可能取代在解決臨床需要時對組織來源的考慮，包括開發和實施新的合理目標的腫瘤療法。

　　1是否要再分類

　　在本綜述的討論中考慮以基因組為基礎的病人分類,要解決的問題是以組織來源為基礎的分類是否能在日益以基因組為中心的人類腫瘤研究治療中保持相關性。其中涉及兩個問題，首先患者個性化的基因組圖譜分析是由能最優化地引導臨床治療，實現精準腫瘤學的愿景。其次腫瘤時應該基于組織來源的基礎分類，還是應該基于基因組特征取代更新原分類方法。

　　在該綜述的分析和建議下，考慮從最初的理性的針對性的療法獲得的經驗教訓來看，新興的腫瘤基因組信息的使用，可以加快臨床開發新型的藥物，并優化目前的治療方法。

　　2基因組信息的作用

　　基因指導臨床實驗設計的可行性是公認的。在幾個腫瘤類型中，致癌基因突變被腫瘤衍生DNA測序可靠地鑒定。在臨床實驗中，突變陽性的患者對靶向藥物的反應已經進行了評估。從目前的進展來看，顯然基因組信息在指導成功開發新的靶向藥物中是有用的。越來越全面的腫瘤基因組分析表明，類似的活化突變是來源于不同的組織類型的腫瘤，指出了潛在的共同治療不同起源腫瘤中的漏洞。

　　在不同腫瘤類型中找到的驅動突變相對頻率較低，所帶來臨床研究和藥物開發所面臨的挑戰已經提示是否考慮對腫瘤活檢進行更廣泛的基因組分析，甚至取代傳統的組織學為基礎的癌癥診斷。目前病理分類的重點仍然是明顯的解剖組織來源，但傳統病理分類體系可以對重要的新信息快速反應。

　　3白血病的綜合信息分類例子

　　一個比較復雜的例子是由前體B細胞急性淋巴細胞白血病（ALL）。在過去的30年中，在細胞表面標志物方面積累了不少新的信息，最近，增加了細胞遺傳學，遺傳基因和來自大量的表觀遺傳的信息。雖然組織學在評估中的重要性有所減弱，其結果是基于各種信息融合的非常有價值的分類方案。通過流式細胞儀檢測細胞表型，細胞遺傳學和基因表達譜能區分白血病為不同的亞型。在更詳細的基因組圖譜，這些亞組顯示特定的基因突變和表觀遺傳模式的富集。而這些在不同的臨床治療中表現出對傳統的和有針對性的治療獨特的反應。

　　積累的經驗表明，對一個給定的腫瘤類型的綜合分析最有可能為有用的分類提供一個堅實的基礎。通過整合表達、測序和表觀遺傳信息，對能夠鑒定清楚的亞型有合理的預期。作為白血病的案例，是特別急需要表觀基因的分析。簡單的基于序列的表觀遺傳學分析方法可以在更廣泛的疾病的臨床應用中提供必要的信息。

　　4目前的研究進展帶來的需求

　　最近在臨床實驗中，新的努力包括深度測序正在進行中，以建立全面的腫瘤遺傳分析。在適當患者人群中基因組信息快速響應的潛在回報似乎是令人信服的。

　　作為起始步驟，從幾百個常規的已經標注的基因開始，這些數據集能同時解決一些有價值的目標。首先最重要的是所產生獨特的數據將使個別患者，特別是已發展的疾病和選擇有限的做出臨床決定。二，數據將提供相關的遺傳信息，以評估相伴隨的診斷。第三，這種方法將為試點研究提供豐富的機會來解決比如樣本采集和處理、數據質量、數據存儲、匯報給臨床醫生和病人，研究的數據共享和花費等問題。

　　已有的研究進展讓大家相信，靶向藥物的存在和腫瘤衍生基因組的信息，提高了精準腫瘤治療的機會。實現精準治療路徑關鍵的第一步是建立一個系統性的有效報告體系，有足夠的激勵以確保基礎的廣泛取樣和出現的臨床經驗。

　　癌癥患者將大大得益于全面的基因組分析獲得更好的治療，這似乎是不容爭辯的。使用這些信息和合理的靶向藥物將提供前所未有的機會，以匹配正確的患者和正確的治療。基因譜系和組織特異性下的臨床反應可能是藥物特異的，在很大程度上，將需要通過嚴格的臨床評價。按照癌癥的基因缺陷通過組織特性進行再分類還是不成熟的。鑒于這一現實，對適應基因組學和表觀遺傳分析提出了更迫切的需要。