GenomeAsia100K最新數據公布！探索亞洲人基因數據的秘密

　　目前已經測序的人類基因組序列中約有6%的樣本來自亞洲個體。而世界上約一半的人口是亞洲人。GenomeAsia 100K項目成立于2016年，由Macrogen、盆唐首爾大學醫院精準醫療中心、新加坡南洋理工大學、印度基因組分析企業MedGenome和美國羅氏集團子公司Genentech等組成，旨在對生活在亞洲的10萬人（64個國家或地區的219個群體）的基因組進行測序，在全球公開的亞洲人基因組數據中涵蓋最多的亞洲區域和人種。這意味著今后在開展亞洲人疾病研究的過程中，可不使用現有的歐洲人基因組數據庫，而是使用亞洲人基因組數據庫。Macrogen會長兼盆唐首爾大學醫院精準醫療中心講席教授徐正善（音譯）教授與南洋理工大學斯蒂芬·舒斯特教授（Stephan Schuster）擔任聯合研究負責人，領導此項研究。

　　研究團隊目前共分析并公開了1739人（印度598人、馬來西亞156人、韓國152人、巴基斯坦113人、蒙古100人、中國70人、巴布亞新幾內亞70人、印度尼西亞68人、菲律賓52人、日本35人、俄羅斯32人）的全長基因組，平均覆蓋率為36倍。近日發表在《自然》雜志上的初步研究中（The GenomeAsia 100K Project enables genetic discoveries across Asia），該聯盟報告了來自亞洲種群基因組數據的增加，有助于揭示以前未被重視的種群結構，并澄清了某些遺傳變異的含義。

　　GenomeAsia 100K項目涵蓋北方系蒙古部族到南方系印度尼西亞小島上的孤立部族，分析了亞洲人種的起源特性并成功構建基因組數據庫。這是為亞洲人以及世界上所有繼承了亞洲人遺傳特性的人種進行個性化診斷和治療的絕好機會，意義重大。研究人員集中于從偏遠和孤立的社區，以及從各種種姓和各種語言群體中收集樣本。

　　通過主群體分析、混合分析和其他分析，研究人員發現，他們的樣本在很大程度上反映了之前的亞洲人口結構研究。例如，他們報告說，印度、印度尼西亞和馬來西亞包括多個祖先群體和多個混合群體。但他們也發現，在人類學上被歸類在一起的印度、印度尼西亞和馬來西亞的某些種群與其地理鄰居的遺傳關系比與該人類學群中的其他種群的遺傳關系更為密切，這表明，這些群體中普遍存在的較深膚色可能是由于環境適應，而不是共同的祖先。

　　研究人員還發現了亞洲人群中有不同程度的來自古代丹尼索瓦人（Denisovans）的祖先，并估計美拉尼西亞人（Melanisians）和阿埃塔人(Aeta)中來自丹尼索瓦人（Denisovans）祖先的比例最高。

　　同時，研究人員報告說，這些新增加的亞洲基因組序列可以幫助醫學遺傳學研究。在他們的數據集中，將近四分之一的涉及蛋白質改變的變異體沒有出現在公開的數據庫中，如外顯子集合聯盟（ExAC）、gnomAD、1000基因組計劃、NHLBI-GO外顯子測序計劃（ESP）和dbSNP。這些數據庫通常用于篩選出罕見遺傳病研究中可能不會致病的常見等位基因。當研究人員將新獲得的數據集添加到gnomAD中，以篩選來自印度的“在年輕時患糖尿病的成年人”（MODY）項目的一組外顯子時，研究人員可以將要追蹤的候選變體數量減少兩倍。根據他們新增的數據集，他們發現了NEUROD1中的一個常見多態性，在過去被認為與疾病相關但可能是良性的。

　　研究還發現了許多過往研究不曾發現的遺傳特性，并有望揭示各亞洲民族對主要藥物的反應差異。例如，心血管疾病患者常用的抗凝血劑法華林（Warfarin）對某些患者反應良好，但對于具有特定遺傳變異的患者來說，可能會引起過敏等藥物副作用。研究結果提示，韓國人、中國人、日本人或蒙古人等北亞人后裔中影響法華林敏感性的變異更為常見。

　　“關于亞洲人的基因組信息越多，就越能夠分析出亞洲人罹患某些疾病的風險是否更高、對某些藥物的反應是否更好。”徐正善教授表示，“我們今后將致力于成功完成10萬名亞洲人基因組大數據，激活韓國國內外亞洲人相關疾病和藥物基因組研究工作，奠定實現亞洲人個性化精密醫學的基礎。”

　　南洋理工大學教授Stephan Schuster指出，“了解人們的基因背景是能夠實踐個性化醫學的重要組成部分。。。精確醫學要做到精確，你必須準確地知道自己是誰。。。亞洲人的遺傳特性比我們預期的要多得多...GenomeAsia 100K項目將為幫助世界各地的亞洲人過上健康的生活發揮出重要的作用。”

　　“我們之所以在一生當中患上不同的疾病或者能夠將彼此區別開來就是因為遺傳性差異。”聯盟聯合研究負責人、印度MedGenome公司最高科學負責人Andrew S. Peterson博士表示，“了解這些個體差異是發現創新新藥的重要線索。”

　　Macrogen進一步宣布，計劃根據這些數據開發一個直接面向消費者的基因檢測服務，將過去以研究者為中心構建的“基因組超市”擴展為以醫療團隊為中心的服務，按國家或地區、人種提供專業化臨床診斷服務的“全球臨床基因組超市（Global Clinical Genome Supermarket, GCGS）”，并應用于亞洲人個性化臨床診斷和治療，藉此正式打入全球臨床診斷市場。