• <table id="4yyaw"><kbd id="4yyaw"></kbd></table>
  • <td id="4yyaw"></td>
  • 發布時間:2012-10-30 00:00 原文鏈接: JVI:昆蟲利用siRNA而非miRNA抵御病毒侵染

      棉鈴蟲(Helicoverpa armigera),是夜蛾科昆蟲的一種,寄主植物有20多科200余種,其中大部分為重要栽培作物,是棉花的主要害蟲之一。棉鈴蟲單核衣殼核多角體病毒(HaSNPV)是一種桿狀病毒,能專一性地感染棉鈴蟲,作為生物殺蟲劑已得到廣泛應用。

      

      近日澳大利亞昆士蘭大學的研究人員對棉鈴蟲免疫系統是如何應答并抵御HaSNPV侵染的機制進行研究,并將研究成果發表在Journal of Virology的10月刊上*。研究人員首先通過對感染HaSNPV的棉鈴蟲進行小RNA深度測序(LC Sciences,聯川生物美國母公司提供技術服務),發現大量small read(約20個核苷酸)可比對至HaSNPV基因組,并且這些Read比對到病毒基因組熱點區的特定開放閱讀框(ORF)上,這些ORF大部分為結構基因和輔助晚期基因。隨后,利用miRDeep在HaSNPV基因組上預測可做為pre-miRNA的潛在莖環結構。通過分析小RNA序列與潛在莖環結構的比對結果,Read count,負義鏈數量,雙鏈堿基配對數量以及其他參數,研究人員判定所有預測的莖環結構都不符合pre-miRNA的特征。在排除這些小RNA是 miRNA的可能性后,這些小RNA被認定是由Dicer-2,昆蟲中參與RNAi應答的主要酶,加工產生的病毒短干擾RNA(v-siRNA)。

      上述研究表明,昆蟲中RNAi途徑在抗RNA病毒應答過程中發揮著主要作用。應答過程為剪切雙鏈RNA基因組或復制過程中產生的中間體成為v-siRNA,然后通過降解病毒轉錄本以達到抵御病毒侵染的目的。

      *:Jayachandran B, Hussain M, Asgari S. (2012) RNA interference as a cellular defense mechanism against the DNA virus, baculovirus. J Virol [Epub ahead of print].

      獲取更多用戶研究案例,請訪問www.lc-bio.com或撥打免費咨詢熱線800-857-1452。

      關于聯川生物

      聯川生物作為國內最早提供第二代測序技術服務的公司之一,擁有經驗豐富的技術團隊和一流的生物信息學專家組,可以為研究人員提供包括microRNA測序,數字基因表達譜測序,降解組測序,轉錄組測序等在內的全轉錄組水平的第二代測序技術服務。聯川生物以您的研究需求出發,為您提供“從數據到科學發現”的個性化測序服務,全力加速您的研究工作。同時,也為您提供基于μParaflo?微流體定制化芯片平臺的microRNA表達譜差異分析,提供可靠標準化的數據分析結果。我們是全球首家提供最新Sanger miRBase 19.0版(2012/08發布)microRNA表達譜芯片檢測服務的公司。


    相關文章

    研究提出基于基因組淺層測序的維管植物物種鑒定新方案

    標準DNA條形碼憑借通用引物適配性強和測序成本低等優勢,廣泛應用于生物多樣性保護與溯源等領域。針對近緣種、雜交頻繁及近期輻射演化的復雜類群,標準DNA條形碼因序列變異度有限,分辨率不足,難以滿足精準鑒......

    利用騾子DNA繪成馬和驢完整參考基因組

    美國肯塔基大學馬丁·加頓農業、食品與環境學院團隊利用一頭雌性騾子的DNA,繪制出迄今最完整的馬和驢參考基因組,使科學家能夠進一步解析過去難以測序和組裝的著絲粒、端粒等復雜DNA區域,為研究染色體功能、......

    我國學者在基因組三維結構演化領域取得新進展

    在國家自然科學基金項目(批準號:32125009、32430017)等資助下,西安交通大學葉凱團隊在基因組三維結構演化領域取得新進展。研究團隊創建了染色質長距離互作捕捉計算方法和跨物種分析手段,首次勾......

    量子計算機首次加載完整基因組

    自21世紀初具有里程碑意義的人類基因組解碼工作完成以來,DNA測序技術迎來了爆發式發展。傳統計算機已難以滿足海量的數據與激增的算力需求,這推動人們尋求替代方案。如今,量子計算距離實用又近了一步。科學家......

    南亞人基因組揭示喝牛奶的起源

    南亞地區的人們以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品為食。現在,這一地區正幫助解開一個長期存在的謎題:人類是如何獲得消化牛奶的能力的。一項針對印度、巴基斯坦和孟加拉國現代及古代人類基因組的研究表明,一種能......

    基因組研究證實:南部非洲智人曾半隔離生活數十萬年

    一項發表在最新一期《自然》雜志上的研究,通過對生活在10200至150年前的南非個體基因組進行分析,證實了在南部非洲,一群智人在半隔離的狀態下生活了數十萬年。這是迄今規模最大的對非洲古代DNA的研究,......

    因美納推出5堿基解決方案以驅動多組學發現,開啟基因組與表觀基因組的同步洞察

    ? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......

    許瑞明研究組合作揭示人逆轉座子LINE1靶向整合基因組的重要機制

    人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......

    高精度完整基因組助橡膠育種駛入“快車道”

    橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......

    小麥野生近緣種基因組“密碼”被破解

    記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......

  • <table id="4yyaw"><kbd id="4yyaw"></kbd></table>
  • <td id="4yyaw"></td>
  • 调性视频