LC-FTIR的接口方法基本上可分為流動池法和流動相去除法兩大類。
（一）流動池接口
流動池是LC-FTIR的定型接口，其工作原理為：首先經液相色譜分離的餾分隨流動相順序進入流動池，同時FTIR同步跟蹤，依次對流動池進行紅外檢測，然后對獲得的流動相與分析物的疊加譜圖作差譜處理，以扣除流動相的干擾，獲得分析物的紅外光譜圖，進而通過紅外數據庫進行計算機檢索，對分析物進行快速鑒定。
LC-FTIR的聯用，流動池的設計非常重要，必須同時兼顧色譜的柱外效應要盡量小而光譜的被測物要適當多兩方面的要求。液相色譜分為正相色譜和反相色譜，流動相不同，吸收強度各異，應選擇最佳體積的吸收池方能獲得令人滿意的聯機檢測結果。流動池主要有以下幾種類型：
1.平板式透射流動池
這種流動池的結構如圖11-6-13所示。用于正相色譜時，窗片材料為KBr以及ZnSe等；反相色譜中為AgCl或ZnSe晶片。流動池的體積和程長由位于兩窗片間的聚四氟乙烯墊片的厚度和孔的大小調節。通常，這種池的程長在0.2-1mm間，內體積在1.5-10μl之間。
2.柱式透射流動池
該種流動池是為正相細內徑柱而設計的，其結構見圖11-6-14。
