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  • 發布時間:2012-07-11 00:00 原文鏈接: LifeTech擴大突變篩查產品線

      Life Technologies公司近日宣布,它將擴大Ion AmpliSeq? 產品線,推出Comprehensive Cancer Panel和Inherited Disease Panel。這些獨一無二的分析板,再加上Ion AmpliSeq Designer V1.2、Ion AmpliSeq Library Kit 2.0和新的Ion Reporter?軟件,為研究人類疾病遺傳基礎的科學家奉上了一個完整的解決方案。

      全世界有數百萬個保存在生物樣本庫中的癌癥樣本有待分析。然而,利用新一代測序(NGS)來分析這些樣品也并非那么容易,因為通常只能分離出幾納克DNA,遠低于現有操作的需求量。此外,新一代測序產生了海量數據,需要生物信息學專家來解釋。而Ion Torrent最新推出的Ion AmpliSeq?和Reporter?產品則提供了全方位解決方案,以克服這些挑戰。

      Ion AmpliSeq? 技術突破了多重PCR的已知障礙,推出了一個開創性的流程,能實現數百個已知突變的快速測序及低頻率等位基因的檢測。利用10 ng DNA,只需一天,即可快速評估數百個關鍵突變。一管式流程如建立PCR反應般簡單,任何實驗室技術人員均可操作。利用即用或定制的TaqMan? assay,還可以輕松地對Ion AmpliSeq? 技術發現的變異進行正交驗證。

      去年10月,Ion Torrent推出了Ion AmpliSeq? Cancer Panel,它覆蓋了46個癌基因的相關區域。快速、DNA起始量低的步驟實現了FFPE樣品的篩選,而這些樣品無法用于其他的目標富集方法。同樣,不到 90分鐘的測序運行時間和單日流程能夠快速、平行評估數百個關鍵突變。(詳細報道:http://www.ebiotrade.com/newsf/2012-1/201214152040563.htm)

      如今,Ion Torrent又推出兩款新產品。Ion AmpliSeq? Comprehensive Cancer Panel 經過精心設計,可同時拷問多個基因家族中的編碼DNA序列(CDS)和剪接變異體。這種基于通路的基因選擇描繪出癌癥驅動基因的突變譜和藥物靶點,以及信號級聯、凋亡基因、DNA修復基因、轉錄調節因子、炎癥反應基因和生長因子基因,所有這些都在單個分析中。另外,此分析板靶定了Ion AmpliSeq? Cancer Panel聚焦的全部46個基因。

      在開展廣泛的變異研究之后,研究人員可選擇對此分析板上的一部分基因開展深入的體細胞突變分析。利用Ion AmpliSeq? Designer這一在線工具,研究人員只需輸入選擇的基因,在很短的時間內即可創建自定義的癌癥基因分析板。

      Ion AmpliSeq? Inherited Disease Panel則利用3個引物池共10,000多對引物,對328個基因的編碼外顯子進行擴增。這些基因與700多種遺傳疾病相關,包括神經肌肉疾病、心血管疾病、發育疾病和代謝疾病。這樣,無需進行費時費力的引物設計和靶序列選擇,即可在3.5小時內完成目標文庫的構建,在一天內完成突變的檢出。

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