外顯子組測序在某些臨床領域正成為新興的一線診斷方法,但對于大多數成人疾病,它在診斷上的作用尚未得到驗證。這其中就包括慢性腎病。據統計,全球每十個人中就有一個受到慢性腎病的困擾。
近日,美國哥倫比亞大學的腎臟科主任Ali Gharavi領導的研究團隊在《新英格蘭醫學雜志》上發表文章稱,外顯子組測序有望診斷出相當一部分的慢性腎病病例。
“我們的研究結果支持了外顯子組測序在不同類別的腎臟疾病中的診斷作用,并強調了基因檢測有望指導患者參與相關的臨床試驗和靶向治療,這也鼓勵了其他各科開展類似研究,”作者在文中寫道。
研究人員對兩個隊列開展外顯子組測序,總共覆蓋了3,300多名慢性腎病患者。結合他們的診斷分析,外顯子組測序在307名患者(9.3%)中發現了有診斷意義的變異。其中,一名不幸的患者攜帶了與39種單基因疾病相關的改變。
研究團隊從這些患者中檢測到66種單基因疾病,從先天性腎病到“不明原因的腎病”。在這些患者中,2,187名患者在哥倫比亞大學醫學中心接受治療,并能夠提供家族史及其他臨床信息。分析發現其中34名患者(1.6%)帶有醫學上可行動的變異。
“對于幾名患者,我們通過DNA檢測獲得的信息改變了我們的臨床策略,因為每一種基因診斷都有其自身的潛在并發癥,在選擇療法時必須認真考慮,”Gharavi教授談道。
研究人員解釋說,目前的研究表明,外顯子組測序的診斷率往往隨著臨床疾病和對象而波動,這促使人們去分析各種慢性腎病的外顯子組序列。
“慢性腎病存在多種遺傳原因,而治療方法因病而異,”Gharavi說。“不過許多遺傳類型比較少見,傳統方法很難檢測到。”
考慮到這一點,Gharavi和他的同事就對3,315名患有慢性腎病的個體開展分析。他們利用Roche或Integrated DNA Technologies的試劑盒來捕獲蛋白編碼序列,然后用Illumina的儀器進行測序。其中,281個病例之前被分類到“不明原因的腎病”。
在此次的分析中,307名患者在外顯子組序列數據的幫助下獲得了診斷。研究人員共發現206例常染色體顯性疾病、42例常染色體隱性疾病、54例X連鎖疾病以及5例多個分子診斷結果的病例。
對于之前被分類到“不明原因腎病”的281個病例,外顯子組序列數據使得48個病例獲得了分子診斷結果。診斷率達到17.1%。
“我們的結果表明,基因檢測可用于腎臟疾病的個性化診斷和管理。腎臟科醫生應當考慮將其納入這些患者的診斷檢查中,”Gharavi說。
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