Nature發布基因組研究指南

　　測序人類全基因組比以往任何時候變得更快速、更便宜，使得比較患者與無特定疾病人群基因組一類的研究激增。臨床醫生和從事某種疾病遺傳貢獻研究的研究人員往往會遇到一些似乎與疾病相關的變異，但卻發現另外一些攜帶相同突變的人群并不罹患這種疾病或影響程度較輕。

　　醫生要怎樣找到真正引起疾病的遺傳變化?發表在周四《自然》(Nature)雜志上的一篇開放性文章為從事罕見遺傳變異效應研究的研究人員提出了一些指導準則。這些建議的焦點集中于幾個關鍵的領域，例如研究設計，基因水平和變異水平上的意義、數據庫以及對于診斷的意義。

　　文章的共同作者、埃默里大學Marcus自閉癥中心副主任、兒科副教授Chris Gunter博士是2012領先基因組研究人員研討會的組織者之一。這一由美國國家人類基因組研究所發起的研討會促成了這篇文章。

　　“我們中有幾個人注意到，一些研究發布了有關特異序列與疾病之間關系的錯誤結論，我們非常擔心這將轉化為不恰當的臨床決策。”

　　Gunter說，醫生有可能基于一些錯誤的結果來制定測試或治療，而它們并沒有真正得到一種遺傳變異與疾病之間的關聯支持。這篇文章可能有助于避免這樣的不恰當決策。

　　由27名研究人員組成的這一研究小組提出了兩個步驟來確定一種遺傳變異引起了疾病：對來自于所有資源、支持該變異在特定疾病或狀況下起作用的證據進行評估后，再進行詳細的統計分析。此外，他們強調要優先考慮科研技術和基礎設施開發，包括鼓勵研究人員共享遺傳和臨床數據。

　　文章中引用了一個與自閉癥相關的實例。研究人員在比較有無自閉癥個體的基因組時在TTN基因中發現了4個獨立的變異。TTN基因編碼了已知最大的一種肌蛋白(titin);相比其他基因的變異，TTN基因變異有可能只是在它的邊界內。不進行適當的統計學校正，研究人員有可能會得出錯誤的結論，認為在自閉癥研究中值得進一步地調查TTN。

　　作者們指出，許多的DNA變異“有可能顯示一個潛在令人信服的故事：這一變異有可能是如何影響性狀的，但很少突變真正具有因果效應。因此，利用諸如這篇Nature文章中這樣的基于證據的指導準則至關重要。

　　“我們相信對于其他領域想從事人類基因組研究、需要一個確定起點來調查遺傳效應的科學家和臨床醫生們，這些指導準則將尤為有用，”Gunter說。