最近,加拿大滑鐵盧大學的研究人員,發現了一種新的方法來制備設計蛋白,有可能使未來的生物技術和個性化醫學領域發生變革。這一研究結果發表在本月《PNAS》雜志。
在一系列的實驗中,Elizabeth Meiering教授與印度和美國的同事合作,制備了一種蛋白質,可經受多種生理和環境條件——試圖制備超穩定、高功能性蛋白質的科學家所面臨的一個挑戰性問題。延伸閱讀:中國科大在蛋白質設計領域取得進展。
蛋白質藥物可以被設計為,表現得像抗體并尋找特定的細胞。這種個性化的藥物只在附著于需要它們的地方,從而大大減少了癌癥和關節炎治療的副作用。例如,重磅炸彈藥物赫賽汀(Herceptin),目前用于治療幾種形式的乳腺癌,可靶定癌細胞表面上的HER2生長受體位點,并標記細胞,因此人體的免疫系統可以摧毀它們。
然而,設計一種能經受多種條件的蛋白質,是具有挑戰性的,而且可能是有風險的。蛋白質依靠其獨特的結構來執行它們的功能,這種結構的一個小變化,都可能導致過敏反應,甚至是一種致命的級聯免疫學反應。
Meiering教授說:“設計一個部分正確的蛋白質是不夠的——蛋白質的穩定性和功能性以及藥物作用,都需要它的完全正確。大多數天然蛋白質不是很穩定,化學家們發現,很難設計穩定的蛋白質。我們的工作是‘研究人員能夠設計和理解蛋白質’的一個真正轉變。”
傳統上,蛋白質設計者都專注于結構或功能,因為與每個屬性獨立地發揮作用,是具有挑戰性的。
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Meiering教授和她的同事們,利用生物信息學來,采用來自大自然的信息,將結構和功能引入設計過程。然后,他們分析了他們制備的蛋白質,并測量了折疊、功能性蛋白質去折疊和分解所用的時間。
Meiering教授說:“一個蛋白可以盡力地不穩定,但仍然非常緩慢地去折疊,這意味著它在很長一段時間仍然是折疊的和功能性的。”
使用生物物理和計算分析相結合,該團隊發現,可以通過這個蛋白質鏈回環到其折疊結構的程度,成功模擬這種動力學穩定性。因為它們穩定性的方式也是定量的,因此,當它不再需要時,蛋白質的穩定性可以調整到自然地分解。
這種不同的思維方式,將使研究人員能夠繼續向前,為具有挑戰性的應用(如生物傳感器和個性化療法),設計具有精確可控的穩定性的蛋白質。
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