Duke大學的研究人員對HIV衣殼蛋白的關鍵區域進行了結構分析,即gp41的近膜端外部區MPER(membrane proximal external region)。文章于一月十三日提前發表在美國國家科學院院刊PNAS雜志的網絡版上。
為了控制HIV的傳播,數十年來人們一直在嘗試開發HIV疫苗,而這項新研究為此提供了寶貴的信息。
“開發HIV疫苗非常困難,主要是因為這種病毒特別善于躲避免疫系統,”文章的作者之一,Duke大學的Bruce Donald教授說。
在HIV病毒與宿主細胞融合的時候,會發生劇烈的結構變化。衣殼蛋白復合體是HIV上的突出結構,主要負責感染宿主細胞。長期以來,人們一直將這一復合體作為疫苗開發的靶點,特別是其中的gp41蛋白三聚體,以及與之緊密聯系的gp120蛋白。
研究人員認為,gp41中的一個特殊區域(MPER)就是HIV病毒的致命弱點。“首先,這一區域相對保守,”文章的資深作者,Leonard Spicer教授說。在不同的病毒亞型之間,存在著相似的區域。對于像HIV這樣多變的病毒來說,成功的疫苗必須能夠作用于上述保守區域。“第二,MPER區域包含特殊的氨基酸序列,允許許多重要的廣泛中和性抗體結合,”Spicer說。這些抗體能夠在HIV患者體內與病毒結合,使其失活。
在HIV病毒與宿主細胞融合時,衣殼蛋白發生的轉變至少有三個階段。其融合前和融合后狀態比較穩定,已經被人們深入研究過了。但衣殼蛋白真正與宿主細胞發生接觸的中間階段是動態的。正是由于這種不穩定性,人們一直難以用傳統的結構分析技術進行研究,例如X射線晶體衍射和核磁共振技術NMR。
現在,研究人員通過蛋白工程、NMR和特殊軟件解決了這一問題。文章的第一作者Patrick Reardon設計了包含HIV MPER的蛋白,該蛋白能夠與細胞膜相互作用,模擬gp41在中間階段的行為。這種蛋白足夠穩定,可以用于結構分析。
在此基礎上,研究人員捕捉到了MPER三聚體的近天然狀態。不過對于該蛋白來說,還有比結構精確更重要的事,那就是能夠與廣泛中和性抗體結合。
“這項研究中最重要的,就是確保設計的蛋白能與相應抗體相互作用。結果我們成功做到了這一點,”Reardon說。最后,研究團隊利用新軟件進行數據分析,驗證了他們獲得的蛋白結構。
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