實驗概要
Dellaporta,Wood 和 Hicks (1983) 法分離植物總基因組DNA,通過實驗掌握SDS法從植物葉片提取DNA 的原理和方法。
主要試劑
提取緩沖液 [ 詳細信息:100mM Tris.Cl,;50mM EDTA; 500mM Nacl;40mmol/L 巰基乙醇,隨用隨加。]
液氮
異丙醇
TE緩沖液
無水乙醇
70%乙醇
KAC [ 詳細信息: 5mol/L KAC。]
主要設備
移液器
冷凍高速離心機
臺式高速離心機
水浴鍋
陶瓷研缽
離心管 [ 詳細信息:離心管,50ml,有蓋。]
離心管 [ 詳細信息:離心管,5ml 和 1.5ml規格。]
小玻棒 [ 詳細信息:小玻棒,彎成鉤狀的。]
實驗步驟
1. 將2g經去淀粉處理的新鮮植物組織置于液氮中速凍,用研缽磨成細粉.
2. 將冷凍粉末轉移至一50mL 離心管中并加入15mL提取緩沖液。輕輕旋轉混勻。
3. 加入1mL 20% SDS,混勻,65°C保溫10min 并不時輕輕旋轉混勻(要點1)。
4. 加入5mL 5mol/L KAC,混勻后冰上放置20-30min(要點2)。
5. 25000g,4°C離心20min。
6. 上清用雙層Miracloth紗布過濾,轉移至一干凈的50mL離心管中,加入10mL異丙醇,輕輕顛倒混勻,-20°C放置40min沉淀核酸。
7. 2000 g,4°C 離心20min,去上清,晾干沉淀5min。
8. 用700uL 50TE 緩沖液溶解沉淀并轉移至一 Eppendorf 管中(要點3)。
9. 加入7uL RNase A 貯液,37°C保溫1h。
10. 加入75 uL 3mol/L KAc,輕彈混勻,離心15 min沉淀不溶性雜質。
11. 將上清轉移至一裝有500uL 異丙醇的干凈管中,輕輕混勻,室溫下放置5min。
12. 微量離心機離心15min沉淀DNA,去上清并用500uL 70%乙醇清洗沉淀。再次離心5min,用巴斯德玻璃吸管吸去乙醇。
13. 沉淀物溶解于200uL TE 緩沖液中,4°C保存。
注意事項
1. 將SDS溶液加入到化凍的提取物中時,可能會有沉淀析出,要保證析出的SDS重新溶解,以及 65°C保溫時提取物混合均勻。
2. 在高濃度(>1 mol/L)的鉀離子存在的情況下,十二烷基磺酸鈉(SDS)會與蛋白或多糖結合變成不溶性的十二烷基磺酸鉀復合物,這類復合物通常呈絮狀,必須要經較高轉速離心和Miracloth紗布過濾予以去除。
3. 若沉淀難于重新溶解,可在65°C加熱10min。
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