長期以來人們一直很好奇,生物究竟如何從有限的基因演化出新功能的。大家廣泛接受的理論是,發生突變的基因繼續復制從而獲得了新功能,如果這一新功能有益,那么基因就會傳播開來。
“這個觀點并不新鮮,但我們將這個過程清晰的展示了出來,”文章共同作者,加州大學戴維斯分校的微生物教授John Roth說。
Roth說,此前人們很難想象這一過程,自然選擇非常殘酷,沒有被正向選擇的基因會很快消失。在這樣的條件下,新復制的基因如何能夠堅持到獲取新功能,從而得到正向選擇的青睞呢?
研究人員構建了一個模擬新基因演化的模型,“創新、擴增和分支”。在這一過程中,原始基因在自己主要功能之外先獲得了較弱的副功能。打個比方,就如一個汽車修理工額外發展了自己對電腦的興趣。如果環境改變使基因的副功能變得重要起來,正向選擇就會增加該基因的表達。對于之前那位汽車修理工而言,如果汽車行業不景氣或者IT產業蓬勃發展,他都可以進一步提升自己的計算機技術,從而謀得一個IT職位。
增加基因表達的通常途徑是大量復制該基因,然后自然選擇會對所有拷貝起作用。在正向選擇之下,這些基因拷貝逐漸累積突變并重組。一些基因拷貝的副功能增強,而其他拷貝則保持著原本的功能。新基因功能就此產生,最終細胞獲得兩個不同活性的基因。
研究人員用沙門氏菌測試了這一模型,該細菌攜帶一個合成組氨酸的基因,該基因的副功能是合成色氨酸。隨后研究人員去除了細菌中合成色氨酸的主要基因,并開始觀察。
研究發現最初的組氨酸合成基因拷貝數變得很高,這些擴增的拷貝累積了突變并獲得了不同的酶活性。自然選擇保留了原始基因的擴增和有益的突變拷貝,并使細菌喪失了那些沒什么建設性的拷貝。結果是,雖然一開始細菌無法合成色氨酸,但很快在3000代以內細菌就獲得了有效合成色氨酸的能力。
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