三篇文章為蛋白質組學研究提供重要信息
由EMBL等處的研究人員公布的三篇文章對大規模蛋白質組學的數據分享和信息比較方面提出了新的方法見解，令這些數據能更易被科學家們分享使用，這些文章發表在8號和26號的《Nature Biotechnology》雜志上。 這三篇文章中的兩篇作為Perspectives papers公布在雜志上，可免費獲得，主要是提出了蛋白質組學和分子相互作用實驗的公布要求，并討論了這些方法的執行（mplementation），影響（impact）和益處（benefit）。最后一篇文章，公布在26號的雜志上，提出了這些標準如何不僅對于研究人員而言有幫助，而且也通過更詳細和完整的信息來源有利于更廣泛的交流。 原文檢索：Nature Biotechnology 25, 887 - 893 (2007) Published online: 8 August 2007 | doi:10.1038/nbt1329The minimum informati......閱讀全文
《自然方法學》：可視蛋白質組學
瑞士聯邦技術學院的研究人員開發出一種在問號鉤端螺旋體(Leptospira interrogans)這種病原體中定位蛋白復合物的新方法，稱為“可視蛋白質組學”。文章發表在本期的《自然-方法學》上。 活細胞中的生化進程分為多個功能單元，它們在細胞內有著特定的時間和空間分布。一般來說，這些單元
Nature年度技術：定向蛋白質組學
時近歲末，各大雜志接連進行了年終盤點，此前出版的《Nature》雜志也對2012年進行了回顧，評點了2012年的科技進展，科技政策以及重要人物，中國科學家王俊入選了人物篇。同時《Nature Methods》也盤點了今年與明年的技術熱點，選出了2012年度技術成果：定向蛋白質組學(targe
Nature方法：發布蛋白質組檢測新技術
在Fred Hutchinson癌癥研究中心癌癥蛋白質組學專家Amanda Paulovich博士領導下，一個國際科學家研究小組證實了大規模、標準化蛋白質檢測的可行性，這是驗證疾病生物標志物和藥物靶點的必要條件。 這項在線發表在12月8日《自然方法》(Nature Methods)
蛋白質組學牛人Nature發表重要成果
第一次結合兩種新興的大規模實驗技術：多通道質譜分析法和具有高水平自然遺傳多樣性的小鼠種群，哈佛醫學院(HMS)和Jackson實驗室(JAX)的研究人員解決了生物學和醫學中一個懸而未決的問題：遺傳變異是如何影響蛋白質水平的？ 蛋白質是構成所有細胞和生物結構與功能“零件表”的氨基酸鏈。因此，了解
Nature－Methods－|－朝思暮想：單細胞蛋白質組測序之夢
近期，Nature Methods 雜志技術編輯Vivien Marx發表文章 A dream of single-cell proteomics，探討了單細胞蛋白組學的發展，提出了該技術有可能會面對的問題和潛在解決方案。單細胞蛋白質組測序的夢想并不遙遠（Credit: S. Larochell
《自然》子刊專題：蛋白質組學中的質譜
涉及到蛋白質組學分析的研究人員都知道蛋白質組學研究的技術路線有兩條，一條是以雙向電泳加生物質譜的方法鑒定生物體系中各種蛋白的表達譜以及各蛋白表達程度的相對變化，另一條路線就是多維色譜與生物質譜相結合的稱之為鳥槍法的技術路線。其中質譜分析技術（Mass spectrometry，MS）是蛋白質組學常用
英國自然雜志《Nature》介紹
英國自然雜志《Nature》?www.nature.comNPG Nature Asia-Pacific?www.natureasia.com 出版：英國MacMillan.Ltd 創刊：1869年 刊期：周刊 定位：兼顧學術期刊和科學雜志，即科學論文具較高的新聞性和廣泛的讀者群。論文不僅要
蛋白質組和蛋白質組學分析
?隨著人類基因 組計劃研究成果的公布，人們對基因的認識逐漸清晰，但基因數量的有限性和基因結構的相對穩定性，與生命現象的復雜性和多樣性之間存在巨大反差。如何了解眾多的基因與危害人類身心健康的疾病之間的關系，對生命科學研究者來說仍是一項長期而艱巨的任務。因此，作為生命活動的直接承擔者――蛋白質，成為后基
研究人員利用“機器學習”幫助鑒定磷酸化位點
EMBL的歐洲生物信息學研究所（EMBL-EBI）的研究人員創建了迄今為止最大的參考磷酸化蛋白質組，將近120000個人類磷酸化位點。為了識別最重要的成員，他們使用了一種機器學習方法，能夠根據功能重要性對其進行排名。 蛋白質是細胞的核心分子機器，可以通過類似于分子開關的蛋白質修飾來調節。磷酸化
Nature：蛋白質組學揭示新冠治療靶標－抑制病毒復制！
新冠肺炎已迅速在全球蔓延，對全球公共衛生造成嚴重威脅并對全球經濟造成嚴重影響。目前針對新冠主要是一些支持性和對癥治療，因此迫切需要開發抑制SARS-CoV-2感染或復制的療法。盡管SARS-CoV-2與其他冠狀病毒有相似之處。但目前仍然缺乏對SARS-CoV-2感染機制的理解以及針對新冠的潛在治
EMBL科學家發布新熒光標記技術
歐洲分子生物學實驗室EMBL的科學家們在12月8日的《Nature Methods》上發表了一種新標記技術，為人們揭示了小鼠神經系統的更多細節。研究者們可以在此基礎上很方便的使用各種人工標記，拓展自己的研究范圍，提高熒光成像的分辨率。“這一技術能幫我們看到之前看不清楚的細節，”這項研究的領導者，EM
蛋白質組與蛋白質組學簡介2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合，然后將DNA從被修飾的堿基處切割，電泳分離，結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾，不能切斷，可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白
蛋白質組與蛋白質組學簡介1
一、蛋白質組概念：一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表
中國學者Nature－Biotechnology發表蛋白質組學分析新技術
來自中科院計算技術研究所的研究人員發表了題為“Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine”的文章，公布了新一代開放式搜索算法Open-p
蛋白質組學大爆發，2021年10月Nature同期4篇
????近年來蛋白質組技術應用取得飛速發展，高水平研究成果風起云涌，層出不窮。僅2020年，國際頂級期刊Cell，Nature ，Science累計發表75篇蛋白質組學、及蛋白質修飾組學技術相關研究成果，在生命科學、醫學與農業科學領域接連取得重大突破。????2021年10月27日，Nature同期
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
三篇文章為蛋白質組學研究提供重要信息
由EMBL等處的研究人員公布的三篇文章對大規模蛋白質組學的數據分享和信息比較方面提出了新的方法見解，令這些數據能更易被科學家們分享使用，這些文章發表在8號和26號的《Nature Biotechnology》雜志上。 這三篇文章中的兩篇作為Perspectives papers公布在雜志上，可免
Nature：對抗自然界的“殺手”
近幾十年，兩棲類在全球范圍內出現了種群數量快速下降，主要元兇之一是兩棲動物壺菌病。該病由真菌壺菌（chytrid fungus）引起，是一種新出現的急性的只感染兩棲動物的致死性傳染病，是目前全球兩棲動物多樣性的最大威脅。 但是7月10日Nature雜志上的一篇文章卻表明，面對這種惡性殺手，動物
Nature擴展教科書，基因功能研究的新層面
就像一個管弦樂隊中的音樂家們，他們擁有相同的樂譜，卻在不同的間隔時間內開始和結束演奏。細胞也擁有相同的基因，卻在基因組中的不同位點啟動和完成對它們的轉錄。來自歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的研究人員，第一次描述了由于這樣的起點和終點變化所導致的信使RNAs (mRNAs)驚人的多樣性。他們
Nature－|－僅隔兩周，蛋白質組再揭腫瘤新靶點
繼兩周前，nature上發表了利用蛋白質組學發現胰腺癌治療靶點和診斷標志物的突破性成果后（添加該文鏈接）。5月2日，又一篇卵巢癌新靶點的文章在nature上重磅發表！！還是那個蛋白質組，卻是腫瘤領域又一重要新發現！！！ 腫瘤轉移一直是困擾癌癥治療的一大問題。5月2日，來自芝加哥大學的Er
復旦大學等處發表Nature文章－解析肝癌蛋白質組學研究
肝癌是全世界造成癌癥死亡的第三大殺手，更是有中國特色的一種癌癥。誘發肝癌的因素很多，包括病毒、環境和遺傳因素的共同作用。在我國，肝癌發生的最大危險因素之一是乙肝病毒感染。 來自復旦大學附屬中山醫院，軍事醫學科學院的研究人員發表了題為“Proteomics identifies new ther
Nature－|－僅隔兩周，蛋白質組再揭腫瘤新靶點
繼兩周前，nature上發表了利用蛋白質組學發現胰腺癌治療靶點和診斷標志物的突破性成果后（添加該文鏈接）。5月2日，又一篇卵巢癌新靶點的文章在nature上重磅發表！！還是那個蛋白質組，卻是腫瘤領域又一重要新發現！！！ 腫瘤轉移一直是困擾癌癥治療的一大問題。5月2日，來自芝加哥大學的E
Nature發布大規模癌癥蛋白質基因組學研究重要成果
基于來自癌癥基因組圖譜(TCGA)計劃的數據，一個多機構科學家小組完成了首個大規模的乳腺癌“蛋白質基因組學”（ proteogenomic）研究，將一些DNA突變與蛋白質信號聯系到一起，并幫助確定了一些驅動癌癥的基因。 這項研究旨在通過蛋白質和它們的修飾來更好地認識癌癥。發表在5月25日《自然
《自然》：首個甲蟲基因組問世
一個國際科研團體將在3月27日的《自然》雜志上發表他們的最新研究成果——首個甲蟲全基因組序列。新測序的甲蟲中文名稱為赤擬谷盜(red flour beetle)，學名為Tribolium castaneum，是農業上的一大害蟲。因此，它也成為第一種進行基因組測序的害蟲，這對農業除害具有重要意義。
《自然》：葡萄基因組測定完成
葡萄成為人類完成基因測序的第一種水果作物和第四種開花植物 ?一項由法國科學家領導的最新研究捍衛了法國作為“葡萄酒之都”的榮譽，他們完整測定了一種葡萄的基因組。葡萄也由此成為人類完成基因測序的第一種水果作物和第四種開花植物（其它3種分別是小麥、擬南芥和白楊木），這有望加深科學家對開花植物進化過程的理解
Nature：基因組的“氣味”
問問你身邊的十個人，他們是如何尋找自己的伴侶的，也許你會得到十份不同的答案。不過也許他們都錯了，一項最新的研究指出，嗅覺系統具有超乎想象的敏感性，能精確鑒別遺傳上的相關性，這表明這種能力能為同類識別，伴侶選擇，以及其它社會相互聯系類型提供必要的信息。 許多方面的動物行為都需要了解
Nature：水母基因組之謎
太平洋側腕水母的基因組中缺少很多常見基因。 櫛水母基因序列草圖的發表揭示了一種與眾不同的神經系統。 櫛水母（comb jelly）——或櫛水母門動物（ctenophore）——看起來就像微小的迪斯科球，它們利用特殊的纖毛推動自己在海洋中游動，并且用粘性觸手來捕獲更微小的獵物。圣奧古斯丁佛羅里達大
Nature公布小麥基因組
利物浦大學、加州大學戴維斯分校等9所研究機構合作對小麥基因組進行了測序，他們的研究將于十一月二十九日在Nature雜志上發表，有望幫助人們增加小麥產量，培育更適應環境變化的品種。 到2050年，世界人口預計會從七十億增加到九十億，在可用耕地越來越少的情況下，要滿足全球對糧食持續增長的需求，
打開盲盒：AlphaFold2預測了人類全蛋白質組－將免費開放
翹首以盼8個月的 AlphaFold2 的論文與源碼發布后一周，今天 DeepMind 再度公布關于 AlphaFold2 的重磅信息：用 AlphaFold2 完全預測了人、大腸桿菌、果蠅、斑馬魚等21種生物的全蛋白質組內35萬個蛋白質結構！這項工作發表在了本周出版的Nature上。 Hol