青島能源所在植物miRNA合成調控領域取得進展
在不同的生長發育階段和受到外界生物、非生物脅迫時,生物體需要精細地調控基因的表達水平。近年來,microRNA (miRNA)在基因精細調控中的作用越來越被重視。miRNA在真核生物中普遍存在,是21-24個核苷酸的非編碼小RNA分子, 通過負調控mRNA靶基因的轉錄后表達水平影響動植物的生長發育和疾病發生等多種生物學過程。在植物中,miRNA 參與調控器官的形態建成、生長發育、種子大小和生物產量、以及抵御外界生物(如病、蟲等)和非生物(如干旱、溫度、鹽堿、貧瘠等)脅迫。研究調控miRNA合成代謝的分子機制,對于改善農作物以及能源植物的產量品質和環境適應性具有非常重要的生物學意義。然而植物miRNA是如何產生的,以及在不同的環境條件下如何精細調控基因的表達水平并不十分清楚。 近年來,調控miRNA合成的研究已成為小RNA領域的一個研究熱點,許多重要的調控因子相繼得以鑒定。miRNA首先由MIR基因利用RNA 聚合酶2轉錄......閱讀全文
高通量快速驗證miRNA靶基因
盡管現在人們可以越來越準確地預測microRNA的沉默效果,但還是需要高通量而且準確的直接驗證技術來驗證microRNA的沉默效果。microRNA 這個在生物科學史上具有重要意義的小分子,在2008年又一次成為了世人矚目的焦點。microRNA通過與目標mRNA的3’UTR區域結合來阻止其翻譯
miRNA-mimics-miRNA-inhibitor
miRNA mimics 是模擬生物體 內源的miRNAs,運用化學合成的方法合成,能增強內源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化學修飾的專門針對細胞中特異的靶miRNA的抑制劑。近年來人工合成的miRNA(artificial miRNA,amiRNA)已經成功應用于沉默預期靶
如何預測和鑒定miRNA的靶基因
免疫沉淀當然,確定miRNA與mRNA之間的互作,我們還有更直接的方法,那就是從實驗上尋找物理相互作用。我們可以利用RNA誘導沉默復合物(RISC)中的Argonaut(AGO)蛋白的抗體進行免疫共沉淀(co-IP)。目前更先進的方法是通過紫外線照射以交聯復合物,然后開展深度測序以鑒定發現的RNA,
miRNA海綿—長效抑制miRNA
miRNA海綿隨著研究的深入,已知miRNA的數量與日俱增,目前Sanger miRBase數據庫中收錄的人miRNA已達721條。不過,大部分miRNA的功能仍是未知數。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同樣如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困
miRNA海綿—長效抑制miRNA
隨著研究的深入,已知miRNA的數量與日俱增,目前Sanger miRBase數據庫中收錄的人miRNA已達721條。不過,大部分miRNA的功能仍是未知數。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同樣如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困難得多。為什么
miRNA研究
一、miRNA研究的基本問題和研究方法二、miRNA研究的綜合解決方案1. miRNA微陣列芯片服務Agilent miRNA 芯片(21.0)?Affymetrix miRNA 4.0 芯片2. miRNA測序服務??miRNA-seq文庫構建流程??miRNA測序數據分析流程3. miRNA R
研究人員利用基因編輯技術靶向miRNA基因改良大豆抗病性
大豆作為糧食與經濟作物,在田間生產常受多種病害侵襲,導致其產量損失。microRNA是植物基因表達調控的核心分子,通過介導靶基因沉默及phasiRNA生成,在生長發育與抗病應答中發揮作用。其中,miR2118家族作為保守的phasiRNA觸發器,在單子葉作物中功能已證實,但大豆中生物學功能尚未明確。
miRNA--克隆實驗
實驗方法原理 在細胞中表達的 RNA 除了我們所熟悉的 mRNA 以外,還有大量不編碼蛋白質的非編碼 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非編碼 RNA 在細胞中起著非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 維持著基因的表達,還有一部分則起著調控基因表達的作用。實驗材料 寡核
miRNA克隆實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 在細胞中表達的 RNA 除了我們所熟悉的 mRNA 以外,還有大量不編碼蛋白質的非編碼 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非編碼 RNA 在細胞中起著非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 維持著基因
miRNA克隆實驗
在細胞中表達的 RNA 除了我們所熟悉的 mRNA 以外,還有大量不編碼蛋白質的非編碼 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非編碼 RNA 在細胞中起著非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 維持著基因的表達,還有一部分則起著調控基因表達的作用。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主
Nature發布miRNA重要發現:脂肪細胞的miRNA信號
脂肪細胞并不簡單,Joslin糖尿病中心的科學家發現這種細胞并不只是靜靜的待在我們身體中,而且能釋放出激素和其它信號蛋白,影響多種組織,其中一種竟然是miRNA。利用脂肪細胞研發基因治療方法,也許能用于治療肝臟或其它器官的代謝疾病,還有癌癥等。 這一研究成果公布在2月15日的Nature雜志上
MicroRNA(miRNA)的概念
MicroRNA(miRNA):是含有莖環結構的miRNA前體,經過Dicer加工之后的一類非編碼的小RNA分子(~21-23個核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白質復合物)在動物和植物中廣泛表達。因之具有破壞目標特異性基因的轉錄產物或者誘導翻譯抑制的功能,miRNA被認為在調控發
miRNA的qPCR檢測
測序技術的引入促使miRNA研究領域進入快速發展階段,然而qPCR仍是驗證測序數據的重要標準。本文將為您介紹使用qPCR進行miRNA分析的基本要點,希望能幫助新人快速入門。什么是miRNA?miRNA是一類小的非編碼RNA,能夠與RNA誘導沉默復合物(RISC)結合,通過作用于mRNA,進而介導轉
mirna-pcr電泳多久
一般是根據PCR產物大小和所用電壓來決定時間的吧一般溴酚藍跑到膠的1/3處就可以了。電壓大,就時間短,第一次跑,還是在邊上觀察著點吧,分子小,時間不長的。
如何設計miRNA-mimics
miRNA mimic能模擬細胞中內源性成熟miRNA的高水平表達,以增強內源性miRNA的調控作用,是miRNA功能研究的一大利器。miRNA mimic是一種簡單高效的miRNA研究工具,只需用轉染試劑包裹即可轉染進入細胞,無需構建載體的繁瑣操作,無需病毒防護方面的擔憂,用轉染對照即可觀察其轉染
人類基因組“primiRNA”剪切位點圖譜繪制
人體的基因表達是一個復雜的過程,那么多的基因不可能都總是持續表達。指揮基因表達的功臣之中就包括幾種RNA分子。MicroRNA(miRNA)是一類真核生物內源性的小分子單鏈RNA,它是一種古老的、生死攸關的基因調節因素,30-60%的哺乳動物蛋白質編碼基因都受miRNA的調控(主要是基因沉默調控
miRNA-qPCR-Detection-Primer-Set(miRNA檢測試劑盒)實驗說明
一、概述1、介紹microRNA(miRNA)是一類有大約22 個核苷酸組成的非編碼小分子RNA,其廣泛存在于真核生物中。miRNA 在個體發育的不同時期及不同組織中有不同的表達模式,都表明了其在發育和分化中起有重大的調控作用。迄今為此,對miRNA 的檢測方法主要有Northern B
miRNA-qPCR-Detection-Primer-Set(miRNA檢測試劑盒)實驗說明
一、概述 1、介紹 microRNA(miRNA)是一類有大約22 個核苷酸組成的非編碼小分子RNA,其廣泛存在于真核生物中。miRNA 在個體發育的不同時期及不同組織中有不同的表達模式,都表明了其在發育和分化中起有重大的調控作用。迄今為此,對miRNA 的檢測方法主要有Northe
miRNA研究之RNA標記
RNA標記RNA標記是將標記物(如放射性同位素、熒光素或酶)共價地連接到RNA,通過檢測標記物,進而實現對RNA鑒別和檢測的目的。RNA標記在分子探針領域應用廣泛,在疾病診斷方面也很有前景。 理想的RNA標記方法應符合以下要求:1. ?操作簡單,靈敏度高2. ?不影響堿基配對的特異性3. ?不影響R
micro-RNA(miRNA)綜述1
RNA一度被認為僅僅是DNA和蛋白質之間的“過渡”,但越來越多的證據清楚的表明,RNA在生命的進程中扮演的角色遠比RNA我們早前設想的更為重要。RNA干擾(RNA interference)的發現使得人們對RNA調控基因表達的功能有了全新的認識,更因為可以簡化替代基因敲除而成為研究基因功能的
micro-RNA(miRNA)綜述3
未來要解決的問題miRNAs在多個物種中廣泛被發現,而且在進化上高度保守。這些“小玩意兒”留給我們一大堆謎團:miRNA的確切功能是什么?它的目標靶是什么?作用機制是什么?也許需要對植物或者線蟲的基因組進行miRNAs突變株的篩選,在果蠅中可以用targeted- disruption缺失miR
micro-RNA(miRNA)綜述2
miRNA的作用方式最早被發現的兩個miRNAs――lin-4 and let-7被認為是通過不完全互補結合到目標靶mRNA3'非編碼區端,以一種未知方式誘發蛋白質翻譯抑制,進而抑制蛋白質合成,阻斷mRNA的翻譯。多個果蠅miRNAs也被發現和他們的目標靶mRNAs的3'非編碼區
miRNA引物設計流程介紹
MiRNA的命名原則可以大致歸納如下: 一個系統命名包含三部分內容,即物種,microRNA類別,序號。三者間用短線連接。物種一般用三個小寫字母表示,如hsa,mmu和rno分別代表人,小鼠和大鼠。MicroRNA類別是指所命名的microRNA是pre-miRNA還是mature miR
小分子RNA(miRNA)簡介
一、什么是小分子RNA( MicroRNA)?? ? MicroRNA (miRNA) 是一類長度約為20-24個核苷酸長度的具有調控功能的非編碼RNA。 miRNA 主要參與基因轉錄后水平的調控。這些miRNA基因首先在細胞核內轉錄成原始miRNA轉錄本(primary transcrip
Isolation-of-microRNA-(miRNA)
實驗概要? ? ? ? This protocol utilizes the powerful guanidine isothiocyanate–phenol:chloroform extraction method which allows the rapid isolation of t
miRNA引物設計流程介紹
MiRNA的命名原則可以大致歸納如下:一個系統命名包含三部分內容,即物種,microRNA類別,序號。三者間用短線連接。物種一般用三個小寫字母表示,如hsa,mmu和rno分別代表人,小鼠和大鼠。MicroRNA類別是指所命名的microRNA是pre-miRNA還是mature miRNA。pre
植物內源激素油菜素內酯負調控miRNA靶基因的翻譯抑制
植物體內非常重要的小分子非編碼RNA——miRNA在翻譯水平介導的靶標基因抑制是一種非常保守的基因沉默機制。在模式植物擬南芥中,miRNA被裝載到其效應分子ARGONAUTE1(AGO1)蛋白上,以堿基互補配對的方式與其靶標mRNA結合,最終誘導細胞質中靶基因mRNA的切割,或者在內質網中抑制靶
汪陽明組“miRNA與sgRNA聯姻”打造基因編輯體系控制新平臺
miRNA是一類長度約22個堿基的核糖核酸分子,廣泛表達于植物,動物以及病毒中。miRNA通過與Argonaute (AGO)等蛋白形成RNA誘導沉默復合物(RNA Induced Silencing Complex,RISC),在轉錄后水平抑制基因表達【1,2】。其表達譜呈現細胞特異性【3】,
BMC-Plant-Biology測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱,堿,鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究,將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日,華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代高通
二代測序鑒定鋁脅迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上種植面積最廣的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能夠更好地適應自然環境的脅迫如干旱,堿,鹽脅迫。對野生大豆的性狀進行系統研究,將有助于栽培大豆的遺傳改良。近日,華南農業大學亞熱帶農業生物資源保護與利用國家重點實驗室年海教授領銜的課題組聯合使用第二代