國外田間高通量植物表型平臺FieldScan應用案例
隨著高通量植物表型測量技術的快速發展，越來越多的研究人員和育種家開始采用這一新興的技術進行研究。植物表型組學時代已經來臨！植物表型組學是一個跨學科的研究領域，它必須與基因組學、生物信息學、大數據計算相結合才能更好的為育種服務。由國際植物表型組織（IPPN）、歐盟植物表型組織（EPPN）和德國植物表型組織（DPPN）聯合進行的一項調查表明，田間表型、數據管理、費用、根系表型、非生物脅迫、行業標準、技術限制、生物信息學、通量等是制約植物表型組學發展的主要問題。 這其中，田間表型（Field Phenotyping）被公認為是植物表型研究和植物表型組學發展所遇到的最大挑戰！ 國際上第一個真正意義上的商業化高通量植物田間表型平臺是于2014年初在印度國際半干旱地區作物研究所（ICRISAT）投入正式運轉的FieldScan系統（視頻鏈接）。印度國際半干旱地區作物研究所FieldScan系統配置有8個PlantEye......閱讀全文
國外田間高通量植物表型平臺FieldScan應用案例
隨著高通量植物表型測量技術的快速發展，越來越多的研究人員和育種家開始采用這一新興的技術進行研究。植物表型組學時代已經來臨！植物表型組學是一個跨學科的研究領域，它必須與基因組學、生物信息學、大數據計算相結合才能更好的為育種服務。由國際植物表型組織（IPPN）、歐盟植物表型組織（EPPN）和德國植物表型
高通量植物表型平臺簡介
高通量植物表型平臺是植物表型組學、植物功能基因組學、現代遺傳育種研究的強大工具。利用高通量植物表型平臺可以快速獲取大量植株的各種信息。現代農業育種的一個主要方向就是性狀改良，獲得更大的果實/種子，更高的含油量（油料作物），更發達的根系等等。通過高通量植物表型平臺可以快速獲取大量植物表型信息。
溫室型高通量植物表型平臺概述
溫室型高通量植物表型平臺可以全自動、高通量對大量植株（從幼苗到成熟植株即可）進行成像的系統，可以選擇配置可見光（VIS）成像、近紅外（NIR）成像、紅外（IR）成像、熒光成像、根系近紅外成像、高光譜成像中的一種或多種，每個成像模塊包括頂部和側面兩個攝像頭，結合樣品旋轉裝置，就可以對植株進行3D形
野外型高通量植物表型平臺簡介
野外型高通量植物表型平臺可以高通量對大田中的農作物進行自動表型成像的系統。它可以在長40 m、寬10 m、高6 m的范圍內對植物進行表型分析。該系統可以配置可見光（VIS）成像、近紅外（NIR）成像、紅外（IR）成像、高光譜成像和激光3D成像，在田間對植物進行三維形態學分析。
實驗室型高通量植物表型平臺簡介
實驗室型高通量植物表型平臺可以全自動、高通量對大量小植株進行成像的系統，可以選擇配置可見光（VIS）成像、近紅外（NIR）成像、紅外（IR）成像、熒光成像或激光掃描3D成像（只適合高度15 cm以下的小植株）中的一種或多種。成像系統帶程控移動裝置，可以在X軸和Y軸上進行移動，并配有射頻或條形碼讀
PlantScreen植物表型應用——高通量種子萌發活力與表型監測
種子活力是種子發芽和出苗率、幼苗生長的潛勢、植株抗逆能力和生產潛力的總和（發芽和出苗期間的活性水平與行為），是種子品質的重要指標，具體包括吸漲后旺盛的代謝強度、出苗能力、抗逆性、發芽速度及同步性、幼苗發育與產量潛力。? ? ?種子萌發實驗無疑是最為直接有效的種子活力檢測方法。但一般的傳統方法需要人工
高通量基因分型檢測平臺及其應用案例
Agripheno?高通量基因分型檢測平臺包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar?模塊化內聯液體處理與分析系統、Soellex?高通量PCR水浴熱循環系統和Araya?內聯熒光檢測系統。Oktopure DNA提取儀采用磁珠的方法提取DNA，通量達到800個樣本/3小時。同時，適用于多
植物表型組學研究平臺建設及技術應用
在生物學和遺傳育種領域,表型是指構成生物體的全部特征，包括外觀、基本維度、形態和顏色,是基因型和環境因素互相作用的結果。表型采集分析是指以定性和定量的方式測量這些特征。表型組(phenome)則是指某一生物的全部性狀特征，不僅局限于農藝性狀，還包括植株所表現出來的生理狀態及生化組分。隨著許多重要作物
藻類表型分析技術應用案例
藻類是藍藻門、綠藻門等一系列水生生物的總稱，誕生于數億年前，廣泛分布于地球的各個角落，不僅是生物學和生態學研究的極佳材料，而且在解決糧食安全、能源危機和環境污染等問題中扮演重要角色。???捷克科學研究院、悉尼大學、匈牙利科學研究院和鄧迪大學的研究者，使用FMT150研究碳脅迫對微擬球藻的影響[1]，
高通量小型植物光合表型測量系統
高通量小型植物光合表型測量系統是一款對小型植物自動進行頂部高通量光合表型高清成像（600萬像素）測量的系統，配備6種濾光片進行葉綠素熒光成像和反射光譜成像。能夠獲得用于表型分析的可見光成像、用于光合作用分析的葉綠素熒光成像、在近紅外區的NIR反射成像RNIR、反映葉綠素含量的葉綠素指數成像RCh
高通量小型植物光合表型測量系統的應用領域介紹
擬南芥和其它小型植株的光合作用和表型研究 光合作用機理研究，全葉片和整株植物的光合作用測量 環境脅迫對植物的影響 基因型篩選、突變株篩選 植物功能基因組學研究 脅迫損傷的早期檢測 植物病理學、毒理學、環境科學研究
FluorCam多光譜熒光成像技術應用案例——植物病害表型研究
1.?植物病害早期快速無損檢測由于次生代謝產物如多酚等與植物的病害脅迫應答機制緊密相關。因此最初，FluorCam多光譜熒光成像技術主要用于植物病害早期快速無損檢測，希望能在病害產生嚴重影響前就能發現感染（圖4）。? ? ??? ? ? ? ? ?圖1.?UV-MCF多光譜熒光成像早期研究，左：煙草
植物表型分析技術快訊—西紅柿表型與代謝組學研究案例
植物源蛋白水解物（PHs）是一類重要的生長刺激素，影響植物表型組及代謝組特征，進而促進植物生長和作物產量，尤其在缺水、鹽脅迫、重金屬等逆境條件下，這種促進作用更加突出。PSI植物表型組學研究中心首席科學家Klara Panzarova等，利用PlantScreen高通量表型分析平臺，就一種PH對
植物育種表型篩選技術方案與案例分享
表型篩選是在植物育種過程中將植物表現的優良性狀篩選出來，并最終能夠固定在植株上，從而培育出優良的品種。標準的生化檢測技術，如分光光度法或高效液相色譜，已被用于植物育種過程中的表型篩選。這些方法結果準確，但它們具有破壞性、耗時、勞動密集且繁瑣、成本高，并且不能滿足大規模篩選程序的需要。植物育種過程需要
PlantScreen高通量表型組學平臺研究葉片衰老
韓國大邱基礎科學研究所Jeongsik Kim、Pyung Ok Lim等，利用PlantScreen大型高通量表型組學研究平臺，對植物葉片衰老進行了系列研究（參見論文：Jae IL Lyu etc. 2017. High-throughput and computational study
高通量小型植物光合表型測量系統的技術原理
葉綠素a熒光作為光合作用研究的探針，是研究各種逆境脅迫（干旱、高溫、低溫、營養缺失、污染、病害等）對植物影響的強大工具，亦被廣泛用于篩選同一植物品種的不同基因型。葉綠素a熒光不僅能反映光能吸收、激發能傳遞和光化學反應等光合作用的原初反應過程，而且與電子傳遞、質子梯度的建立及ATP合成和CO2固定
植物表型成像系統植物表型和植物表型組學的概念
植物表型分析是理解植物基因功能及環境效應的關鍵環節，隨著植物功能基因組學和作物分子育種研究的深入，傳統的表型觀測已經成為制約其發展的主要瓶頸，而高通量的植物表型組分析技術和植物表型組學研究是解決這一困境的有效途徑。雖然植物表型組分析正在成為國內外研究的熱點，相關概念仍然較為模糊，阻礙了這一新興學
高通量表型分析平臺可視化評估大麥病害程度
背景表型是新植物栽培品種發展的瓶頸，該研究引入了一種新的高光譜表型分析系統，此系統將冠層測量的高通量與高空間分辨率和可控測量環境的優勢相結合。此外，測量的大麥生長在大容器（稱為Mini-Plots）中，這使得植物能夠在溫室實驗中形成田間表型，從而不受容器尺寸的影響。結果在接種白粉病后30天，通過Sp
高通量小型植物光合表型測量系統的技術參數
成像面積：24 cm x 24 cm 光照面積：30 cm x 30 cm 相機傳感器類型：CCD 相機分辨率：600萬像素，即2440 x 2440像素 光譜范圍：350-950 nm 鏡頭類型：高質量百萬像素鏡頭 光纖濾光片輪：6種高質量光學干涉濾光片，步進電機驅動 直角坐標機
簡介高通量小型植物光合表型測量系統的功能特性
利用直角坐標機器人實現X-Y-Z軸自動移動 測量范圍4.5m x 2m或6m x 3m 帶兩套潮汐式灌溉水培系統 能夠進行葉綠素熒光成像、葉綠素指數成像、花青素指數成像和可見光成像 配備控制電腦和分析電腦 配備控制軟件和分析軟件 配備NAS（網絡附屬存儲）系統
博普特田間植物表型產品和解決方案在精準農業方向...1
? ? ? 隨著氣候變化、人口增長，對育種和農學研究人員提出了巨大挑戰，隨著自動化技術、機器視覺技術、生物信息技術等的發展，對野外生長植物進行迅速、準確、高通量無損傷的進行多源、多尺度、多性狀表型分析，變的尤為迫切。除了傳感器技術，傳感器獲取數據的解讀更加重要，法國Hiphen團隊源自法國農業科
表型分析技術在藻類研究的應用案例分析
表型（Phenotype）是基因組（Genome）和環境(Environment)共同作用的結果，近年來，隨著高通量測序技術的快速發展，基因組的研究更加簡單快速，然而由于植物表型本身的復雜性以及動態變化的特性，表型研究滯后于基因組研究[1]。目前表型研究主要集中在植物/作物領域，在藻類領域，表型組學
llumina高通量測序平臺的應用
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發，利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結（reversible terminator）”，實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
llumina高通量測序平臺的應用
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發，利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結（reversible terminator）”，實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
博普特田間植物表型產品和解決方案在精準農業方向...2
高通量的表型分析直接影響三個方面：更精確的遺傳篩選、鑒定新的遺傳變異以及改進對目標群體環境因子的篩選，進而較好做遺傳決策。植物田間高通量表型分析也間接影響育種規模以及育種周期。下圖是法國農業科學院Fred教授提出的田間表型研究不同遙感傳感器的總結，實際上在科研中，田間多種傳感器結合也得到了深度應用和
博普特田間植物表型產品和解決方案在精準農業方向...3
地面維度：溫室多光譜表型系統（帶閃光燈）???Airphen?相機同時可配備閃光燈，專用于溫室應用。Airphen相機可以完全同步控制閃光燈。該特征能提供穩定光照條件（無陰影），進行長期值守和無間斷測量（日以繼夜）。所獲得數據可直接由CLOVERFIELD進行處理。地面維度：植物表型機器人平臺Air
移動式激光雷達LiDAR植物表型成像平臺
植物表型受基因和環境因素決定和影響，反映植物結構及組成、植物生長發育過程及結果的全部物理、生理、生化特征和性狀。植物表型分析的精確實現有助于農作物基因型與育種工作。植物表型分析對高效且低成本的表型獲取技術需求強烈。作物表型測量技術發展的滯后已成為當前育種領域的發展瓶頸,高通量的精確表型測量有助于加速
llumina高通量測序平臺的應用（二）
3、可逆化學阻斷技術測序??????? 利用邊合成邊測序(Sequencing?by?synthesis)的原理，加入改造過的DNA聚合酶和帶有4種熒光標記的dNTP。這些核苷酸是“可逆終止子”，因為3’羥基末端帶有可化學切割的部分，每個循環它只容許摻入單個堿基。去除其他多余的dNTP后，用激光掃描
llumina高通量測序平臺的應用（一）
Illumina公司的新一代測序儀Genome?Analyzer最早由Solexa公司研發，利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結（reversible?terminator）”，實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收購了
植物表型分析系統—植物表型的名詞解釋
“植物表型是指能夠反映植物細胞、組織、器官、植株和群體的結構及功能特征的物理、生理和生化性質，其本質實際是植物基因圖譜的時序三維表達及其地域分異特征和代際演進規律”。這是目前所見最精辟的定義。 那么什么是高通量植物表型的？高通量植物表型技術是從器官、個體到群體水平上高通量、自動化獲取產量、抗性