蛋白合成交流群之如何選擇平臺分析實驗數據
Autodock、Autodock Vina與Dock6 A:有沒有關于分子對接結果解讀之類的文章呢，有些時候結果出來了不會分析不會看。 殷賦科技:《【文獻重現】D715-2441 抑制劑與PB2蛋白的結合模式研究》的最后就有分析，解讀無非就是看圖說話，再結合一些實驗數據、相關文獻進行拓展。 A:dock6也是開源的嗎，感覺autodock各種教程網上更多呢。 殷賦科技:開源啊，如果按照dock6官方教程去操作，非常麻煩，AutoDock相對好些，dock6安裝起來就比較麻煩，還必須在linux下；vina不用安裝，下載即用。 B:請問大神，autodock4可不可以做共價對接。 殷賦科技:http://autodock.scripps.edu/resources/covalentdocking。 C:windows系統能用autodock和vina嗎? 殷賦科技:可以啊。 ......閱讀全文
蛋白合成交流群之如何選擇平臺分析實驗數據
Autodock、Autodock Vina與Dock6 A:有沒有關于分子對接結果解讀之類的文章呢，有些時候結果出來了不會分析不會看。 殷賦科技:《【文獻重現】D715-2441 抑制劑與PB2蛋白的結合模式研究》的最后就有分析，解讀無非就是看圖說話，再結合一些實驗數據、相關文獻
蛋白合成之如何選擇平臺分析實驗數據？
Autodock、Autodock Vina與Dock6A:有沒有關于分子對接結果解讀之類的文章呢，有些時候結果出來了不會分析不會看。答:《【文獻重現】D715-2441 抑制劑與PB2蛋白的結合模式研究》的最后就有分析，解讀無非就是看圖說話，再結合一些實驗數據、相關文獻進行拓展。A:dock6也是
蛋白合成交流之如何從數據庫找合適的化合物？
體系相關A:http://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/這個網站的結果怎么比較啊?答:我還沒用過呢，只是在網上搜索到的。你那計算完了，有什么結果啊?A:答:沒有打分之類的東西?A:只給了結果，但沒看到這樣排序的依據。答:應該是最上面的是最合適的，那你下載下來就可以用
蛋白合成微信學術交流之如何從數據庫找合適的化合物
體系相關 A:http://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/這個網站的結果怎么比較啊? 殷賦科技:我還沒用過呢，只是在網上搜索到的。你那計算完了，有什么結果啊? A: 殷賦科技:沒有打分之類的東西? A:只給了結果，但沒看到這樣排序
微信學術交流群之關于蛋白的處理
Docking A:用的cdocker將晶體復合物的配體對接回原來的蛋白質重合度不好啊，rmsd也比較高，請問大家對接時受體蛋白加力場嗎? B:參數沒設置好吧。 C:要分析原因哦。 (1)是所有對接計算出來的pose都不好? (2) 還是打分最好的那個不好，打分差
微信學術交流群之靶標預測
靶標預測 A:有什么簡單的方法可以通過化合物的結構式預測該化合物可能的藥理毒理作用么，比如抗腫瘤，抗炎，抗神經等等。 B:反向找靶。 A:那就復雜咯，想簡單點，然后去做細胞實驗驗證。想著是不是可以通過計算機來預測哈子。 C:反向對接。 D:直接做激酶譜不就行了。
如何選擇PSI多肽合成儀？
多肽合成儀PSI100? 經濟型PSI200普及型PSI300小型PSI300M? 中型PSI400大型PSI500GMP型PSI600客戶定制應用范圍教學科研及小量生產高難度，超長肽工廠化生產任選合成范圍100mg~60g100mg~2g1g~40g5g~1kg~10kg通道數1~611111合成
如何選擇蛋白印跡實驗中的印跡膜
硝酸纖維素膜（NC膜）是蛋白和核酸雜交zui常用的印跡膜，是蛋白印跡實驗的標準固相支持物。在低離子轉移緩沖液的環境下，大多數帶負電荷的蛋白質會與硝酸纖維素膜發生疏水作用而高親和力的結合在一起，雖然這其中的機制還不是十分清楚，但由于硝酸纖維素膜的這個特性，而且易于封閉非特異性結合，從而得到了廣泛的
如何選擇蛋白印跡實驗中的印跡膜？
硝酸纖維素膜（NC膜）是蛋白和核酸雜交最常用的印跡膜，是蛋白印跡實驗的標準固相支持物。在低離子轉移緩沖液的環境下，大多數帶負電荷的蛋白質會與硝酸纖維素膜發生疏水作用而高親和力的結合在一起，雖然這其中的機制還不是十分清楚，但由于硝酸纖維素膜的這個特性，而且易于封閉非特異性結合，從而得到了廣泛的應用。目
細胞周期分析實驗中如何選擇合適的細胞周期蛋白？
在細胞周期分析實驗中選擇合適的細胞周期蛋白，需要考慮以下幾個因素：研究目的：明確您想要探究的細胞周期特定階段或細胞周期調控的具體方面。例如，如果關注 G1 期到 S 期的轉換，Cyclin D 和 Cyclin E 可能更合適；若重點是 G2 期到 M 期的進展，Cyclin B 則是較好的選擇。細
如何選擇數據記錄儀？
如果您需要選擇一款數據記錄儀，您需要首先確定數據記錄應用中每個組成元素的性能需求。根據您需要測量物理量的類型、數據分析和表示的需求，您對于數據記錄儀的選擇可能會有很大的不同。下面是選擇一款數據記錄儀時考慮到的問題的一些例子。 我需要進行溫度測量，而且測量精度十分重要 我需要記錄頻率非常高的信
電轉染小課堂之如何選擇波形
歡迎大家訂閱電轉染小課堂，本期我們來分享如何選擇電穿孔的波形，各波形需要設置的參數有哪些？以及兩種波形之間的轉換 Part 1 方波 方波脈沖是指電壓瞬間升至預設電壓，保持電壓放電，然后瞬間終止放電。一般哺乳動物細胞電轉染時選擇方波脈沖，有較高的轉染效率和細胞存活率。選擇方波時，有以
電轉染小課堂之如何選擇波形
歡迎大家訂閱電轉染小課堂，本期我們來分享如何選擇電穿孔的波形，各波形需要設置的參數有哪些？以及兩種波形之間的轉換Part 1?方波方波脈沖是指電壓瞬間升至預設電壓，保持電壓放電，然后瞬間終止放電。一般哺乳動物細胞電轉染時選擇方波脈沖，有較高的轉染效率和細胞存活率。選擇方波時，有以下參數要進行考慮：場
蛋白質合成實驗
實驗步驟 材料無菌細胞培養，如 1X104～ 1X106 個細胞，24 孔板3H-亮氨酸。無血淸培養基中 2 MBq /ml (～50uCi/ml) (特異活性并不重要，因為它將由培養基中的亮氨酸濃度決定）非無菌SLS 或 SDS，1% (35m mol/L ) 溶于 0 .3 mol/L NaOH
蛋白質合成實驗
實驗步驟 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 材料 無菌 細胞培養，如 1X104～ 1X106 個細胞，24 孔板 3H-亮氨酸。無血淸培養基中 2 MBq /ml (～50uCi/ml) (特異活性并不重要
蛋白質合成實驗
實驗步驟 材料 無菌 細胞培養，如 1X104～ 1X106 個細胞，24 孔板 3H-亮氨酸。無血淸培養基中 2 MBq /ml (～50uCi/ml) (特異活性并不重要，因為它將由培養基中的亮氨酸濃度決定） 非無菌 SLS 或
蛋白質合成實驗
實驗步驟材料無菌細胞培養，如 1X104～ 1X106?個細胞，24 孔板3H-亮氨酸。無血淸培養基中 2 MBq /ml (～50uCi/ml) (特異活性并不重要，因為它將由培養基中的亮氨酸濃度決定）非無菌SLS 或 SDS，1% (35m mol/L ) 溶于 0 .3 mol/L NaOH三
如何選擇最佳實驗
原子吸收光譜分析中影響測量條件的可變因素多，在測量同種樣品的各種測量條件不同時，對測定結果的準確度和靈敏度影響很大。選擇最適的工作條件，能有效地消除干擾因素，可得到最好的測量結果和靈敏度。 1、吸收波長(分析線)的選擇：通常選用共振吸收線為分析線，測量高含量元素時，可選用靈敏度較低的非共振線為分
實驗室液相色譜儀之凝膠色譜儀如何選擇？
凝膠色譜屬于液相色譜，它是按被分析混合物不同組分分子大小的不同進行分離的，多用于高聚物的分析。它以液體做活動相，以多孔固體做固定相，其中孔是有一定尺寸限制的，而且大小不一。 它的分離過程是在裝有多孔固定相的色譜柱中進行的。當尺寸大小不同的分子通過色譜柱時，可占據的窨體積也不同。對活動相分子
免疫球蛋白如何合成？
免疫球蛋白是由B淋巴細胞在抗原的刺激下轉化為漿細胞，產生可以與相應抗原發生特異性結合的抗體。 當人體遭遇外來病原體，如病毒或細菌時，免疫系統中的B淋巴細胞會識別這些病原體，并被激活。激活后的B淋巴細胞會轉化為漿細胞，漿細胞是專門負責產生抗體的細胞。每個漿細胞都會產生一種特定的抗體，這些抗體能夠
蛋白質組數據的多元分析實驗
儀器、耗材?掃描儀圖像分析軟件Excel 程序多元數據分析的軟件實驗步驟 用 Progenesis、Excel 和 The? Unscrambler 對 2D 凝膠進行多元分析。3.1 確定研究方案后建立蛋白的 2D 凝膠在本章節中不再闡述，但要確定染色方法以便進行凝膠的定量分析（見注釋 1 )。3
蛋白質組數據的多元分析實驗
儀器、耗材掃描儀圖像分析軟件Excel 程序多元數據分析的軟件實驗步驟用 Progenesis、Excel 和 The? Unscrambler 對 2D 凝膠進行多元分析。3.1 確定研究方案后建立蛋白的 2D 凝膠在本章節中不再闡述，但要確定染色方法以便進行凝膠的定量分析（見注釋 1 )。3.2
蛋白質組數據的多元分析實驗
儀器、耗材：掃描儀 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?圖像分析軟件 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Exc
海洋藻類之選擇方向性分析
光在水中會急速衰退，因此，無論在海洋還是在內陸水體中，扎根生長的大型維管束植物只能在沿岸帶的淺水區域中生存。在海洋中，絕大多數初級生產者必須漂浮在真光層中，為此，它們必須維持盡可能大的比表面積。當然，微小的體積還有利于提高細胞的受光面積，也能增加對CO2的吸收。因此，提高浮力的選擇壓力趨向于選擇小的
理性分析數據中心給排水如何選擇電伴熱帶
理性分析數據中心給排水如何選擇電伴熱帶，是北京中海華光電伴熱通過鋪天蓋地的電伴熱各種材料、電伴熱各種廠家、電伴熱各種的應用方案，在客觀公正的理性分析它，是通立在我公司16年的電伴熱應用技術總結下，生成這樣的寶貴經驗，當你在看諸多的電伴熱選用不知所措之時，能找到中海華光的這種交流是你緣份。我們簡知進入
苔蘚物種監測數據分析中如何選擇合適的統計方法？
在苔蘚物種監測數據分析中選擇合適的統計方法，需要考慮以下幾個關鍵因素：研究問題和目標首先明確想要回答的具體問題，例如是比較不同地點苔蘚物種的多樣性，還是探究苔蘚物種與環境因素的關系，或者是分析時間序列中苔蘚物種的變化趨勢等。不同的研究問題需要不同的統計方法。數據類型確定數據的性質，是分類數據（如苔蘚
如何選擇蛋白印跡成像與定量分析技術
——western blot技術在蛋白定量分析中的選擇應用 蛋白質印跡(western blot)，它是根據抗原抗體的特異性結合檢測復雜樣品中的某種蛋白的方法。western blot 是在凝膠電泳和固相免疫測定技術基礎上發展起來的一種新的免疫生化技術。由于免疫印跡(western blo
質譜實驗質量控制之數據質控
質譜實驗的QC方法包括：樣品準備、液相色譜、質譜采集以及譜圖質量等。前兩期關于質譜污染物的防控，大部分是屬于樣品準備階段的質控工作。質控專題共分三期內容：1. 質譜污染的來源與防控篇2. 質譜原始數據中的污染物信息篇3. 質譜數據質控篇——Quic軟件介紹點擊目錄鏈接可以回顧往期，本期質控專題進行到
單細胞測序基準數據集如何選擇？
選擇單細胞測序基準數據集時，可以考慮以下幾個關鍵因素：?1. 研究目的和問題 ? ?- 明確您的具體研究目標，例如是關注特定細胞類型的分類、細胞發育軌跡分析還是差異表達基因檢測等，選擇與研究問題相關的數據集。?2. 細胞類型和組織 ? ?- 確保數據集包含您感興趣的細胞類型和組織來源。如果您
如何選擇蛋白晶體結構？
在使用殷賦云計算平臺的時候，有不少用戶對于如何選擇蛋白晶體結構存在疑問。本篇就這個話題做一些經驗分享。任何標準都有一個適用范圍。我們在這里只討論用于分子對接的蛋白晶體結構的選擇原則和方法。1. 確定蛋白種屬在實驗當中，研究人員通常使用動物模型（如小鼠）來研究人源蛋白。這樣做有許多原因，比如：1） 無