農林RNA測序助力玉米籽粒Dek10突變體研究
呼吸作用是線粒體最重要的代謝。其中，線粒體中5個和呼吸相關的復合物起到了重要影響。很多呼吸鏈相關蛋白都是由線粒體基因組編碼的。這些RNA會受到細胞核內諸如pentatricopeptide repeat (PPR) 蛋白的轉錄后修飾。玉米defective kernel 10(dek10) 是一個典型的籽粒變小發育遲緩的突變體。通過圖位克隆發現，dek10編碼了一個定位于線粒體的E族PPR蛋白。測序表明dek10突變體是由于nad3-61，nad3-62和cox2-550位點的C-U變化導致的。這些位點的變化導致Nad3顯著下降，Cox2蛋白的缺失。有趣的事，復合物I并沒有變化，但是NADH脫氫酶活性顯著下降。復合物IV的含量顯著下降。轉錄組測序與透射電鏡（TEM）分析表明，nad3和cox2對線粒體功能密切相關。這些結果表明，E族PPR蛋白dek10對nad3和cox2的位點編輯至關重要，而這在植物發育過程中是必不可少的。......閱讀全文
我國創建世界上最大轉座子插入資源庫
不知你有沒有注意到，從菜市場買回來的玉米，有的是黃燦燦的，有的卻像個大花臉，中間夾雜著紫色、白色的玉米粒？ 其實，這是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活躍的轉座子，它們就像一支“小畫筆”，跳到哪個基因上，就會抹去那里本來的“顏色”。因此導致籽粒顏色變化有一部分是轉座子運動產生的。 轉座
dek35編碼PPR蛋白影響玉米籽粒的線粒體nad4基因內...（二）
dek35影響nad4內含子1的剪切由于PPR蛋白可以與對應的線粒體或者葉綠體RNA互作，因此研究人員對dek35突變體胚乳以及野生型胚乳的線粒體轉錄本進行了分析。研究人員使用特異的引物擴增了線粒體cDNA，在35個基因中，只有nad4的成熟轉錄本在dek35中顯著下降（圖5）。進一步研究發現，na
助力地方發展，浙江農林大學開化研究院揭牌
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498084.shtm4月6日，浙江農林大學開化研究院揭牌成立。浙江農林大學將以全校服務浙江省開化縣全域，為將該縣打造中國式現代化山區縣樣板提供人才科技支撐。 ???揭牌儀式現場 浙江農林大學供圖去
PNAS：新測序方法助力癌癥研究
在去年圣誕節期間的加拿大落基山脈冰攀之旅中，兩位來自華盛頓大學的年輕研究人員：Michael Schmitt和Jesse Salk突發奇想，談到了一個簡單但功能強大，可用于檢測癌細胞，獲得更好結果的新方法――如果他們能降低DNA測序中的錯誤率，那么就可以更好的檢測出這些細胞中的變異，這種改進
六項中國學者成果同登Nature子刊中國即將成為基因大國？
在最新刊出的著名遺傳學雜志Nature Genetics在線版上，同時發表了六項中國學者的最新研究成果，分別是乙肝患者患上肝癌的關鍵易感基因玉米籽粒油份遺傳結構分析，iPS細胞重編程過程的一個主要障礙，西瓜基因組草圖，甜橙基因組草圖，以及大熊貓種群歷史與適應研究。國內遺傳學基因研究在國際上的
玉米Proline－responding－1(pro1)突變在蛋白合成和細胞周期調控
上海大學生命科學學院、上海市能源作物育種及應用重點實驗室的研究人員證實，玉米Pro1基因(Zm P5CS2)的突變造成了突變體細胞中脯氨酸(proline)合成受阻，從而導致proline積累的減少。突變體中proline的缺乏引起了相應的轉運RNA(tRNApro AGG)空載形式(uncha
上海生科院最新PNAS文章
4月19日，《美國科學院院刊》（PNAS）雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所巫永睿研究組題為Gene duplication confers enhanced expression of 27-kDa γ-zein for endosperm modification
籽粒機收玉米“魯單608”通過國家品種審定
近日，農業農村部發布品種審定公告。山東省農科院玉米所高產育種創新團隊育成的早熟、耐密、抗倒、籽粒機收玉米新品種“魯單608”通過國家審定。 “魯單608”? ?山東省農科院供圖 ? ? 玉米是我國第一大糧食作
籽粒機收玉米“魯單608”通過國家品種審定
近日，農業農村部發布品種審定公告。山東省農科院玉米所高產育種創新團隊育成的早熟、耐密、抗倒、籽粒機收玉米新品種“魯單608”通過國家審定。“魯單608”? ?山東省農科院供圖? ? 玉米是我國第一大糧食作物。生產上玉米收獲多采用果穗機收或人工收獲方式，籽粒機收（直接在田間脫粒機收）占比不到5%，
長鏈非編碼RNA測序服務助力揭開lncRNA神秘面紗
2012年12月18日，華大基因科技服務有限公司(簡稱“華大科技”)在國內推出長鏈非編碼RNA測序(lncRNA-Seq)服務。該技術突破了常規研究方法效率低、研究范圍受限的瓶頸，可一次性獲得樣本中幾乎全部的lncRNA序列，不僅可以對已知lncRNA進行定量分析，還可對 novel lnc
植物所破解優質蛋白玉米育成之謎
2020年1月7日，《自然-通訊》（Nature Communications）在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心巫永睿研究組和上海交通大學農業與生物學院王文琴研究組合作的題為Long-read sequencing reveals genomic structural variati
我國學者證明Opaque2可以調控玉米高效灌漿
1月31日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心巫永睿研究組在Plant Biotechnology Journal 雜志上在線發表題為Transactivation of Sus1 and Sus2 by Opaque2 is an essential supplement to sucrose
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日，中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》（英文版）（Science Bulletin）上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑，是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日，中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》（英文版）（Science Bulletin）上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑，是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯
植物表型成像系統助力研究促進玉米增產基因
玉米主要用作動物飼料，也可供人類食用，一小部分用于生產生物燃料。世界范圍內，玉米年種植面積達1.8億公頃，年產量接近10億噸，是全球種植量最大的農作物。由于全球變暖以及極端天氣狀況對農業影響范圍越來越廣，研究新型玉米品種對保障充足的玉米產量極為重要，而通過選取促生長基因，育種者可以培育出改良的農作物
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日，中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》（英文版）（Science Bulletin）上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑，是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯分析（GWAS）是通過推斷
新技術縮短玉米穗腐病抗性育種時間
近年來，玉米穗腐病已成為威脅我國玉米生產的主要病害之一，其病原真菌主要是鐮孢菌。已有研究表明，小麥、玉米中存在鐮孢菌的抗性基因。其中，玉米中的ZmFER1基因可能具有鐮孢菌病害抗性育種開發價值。 近日，中國農業科學院作物科學研究所玉米基因編輯育種研究團隊，通過基因編輯靶向編輯玉米內源基因創制的
在玉米全基因組水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遺傳基礎
近期，中國農業大學國家玉米改良中心楊小紅團隊在國際學術期刊Plant Biotechnology Journal上在線發表了題為“Genetic basis of kernel starch content decoded in a maize multi-parent population”的
河南大學最新文章解析玉米遺傳突變
報道：干旱脅迫嚴重影響作物產量, 其所造成的損失幾乎是其他自然災害的總和。來自河南大學生命科學學院的研究人員近期利用自主性Mutator轉座子玉米材料與玉米自交系材料雜交，獲得了F1插入誘變群體, F1自交得F2群體，并進行了深入的突變體分析鑒定，為深入開展玉米抗旱育種提供了實驗材料。
我國學者揭示玉米籽粒與植株發育調控新機制
近日，從河南農大傳來消息，該校湯繼華教授團隊和中國農科院李文學團隊合作，揭示了Urb2基因在玉米籽粒發育中的關鍵作用及其調控機制。相關研究成果發表在最近出版的國際著名期刊《新植物學家》雜志上。圖片來源于網絡 玉米籽粒發育是一個非常復雜的生物學過程，受到成百上千的基因調控，籽粒性狀作為影響玉米產
Nature：史上最大型RNA測序研究成果
來自日內瓦大學醫學院的研究人員領導一個歐洲科學家小組，發布了一張人類功能性遺傳變異的綜合圖譜。這一研究發表在9月15日的《自然》(Nature)和《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上，提供了有史以來RNA水平上最大的人類基因組與基因活性關聯數據集。 了解每
單細胞RNA測序，眾多研究都pick它
多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。 多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。單細胞測序的最初動力來自癌癥研究，可幫助人們了解腫瘤異質性和腫瘤微環
研究揭示玉米胚乳早期發育新機制
4月8日，The Plant Cell 在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所巫永睿研究組題為Maize VKS1 Regulates Mitosis and Cytokinesis during Early Endosperm Development 的研究論文。該研
大豆突變體基因定位測序方法的改良
隨著新一代測序技術的發展和全基因組測序（Whole Genome Sequencing, WGS）成本的不斷下降，基于WGS的分離群體分組分析（Bulk Segregation Analysis，BSA）已經成為快速定位候選基因的常規工具，但已報道的方法依然有待完善。例如，依賴于自交系雜交的QT
新型DNA測序方法助力干細胞分化研究
生物醫學領域的一個重要研究課題是解釋為何擁有完全相同DNA的細胞會分化成不同的功能細胞。美國的一支聯合研究小組近日發現，環繞DNA的染色質蛋白在這一過程中扮演了重要角色。《自然》網站日前預先發表了相關論文。染色質蛋白的功能不僅僅限于包裹基因物質，它們可以影響DNA雙螺旋的各個部分的打開和關閉狀態，從
在全基因組水平上解析玉米籽粒淀粉含量的遺傳基礎
玉米是全球最重要的農作物之一。淀粉為玉米籽粒的主要組分，約占籽粒干重的70%，不僅是影響籽粒產量的重要因素，還為食品生產和工業加工如造紙業、醫藥行業、生物燃料等領域提供原料。因此，解析玉米籽粒淀粉含量的遺傳基礎，對高產優質玉米新品種的培育意義重大。 近日，中國農業大學國家玉米改良中心楊小紅團隊
雙RNA測序技術
在發表于《自然》（Nature）雜志上的一篇研究論文中， 由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現，采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術，可以揭示出兩者轉錄譜的改變。該研究小組描繪了他們的技術、該技術如何更多地幫助了解細菌感染機制，以及在研究中獲得的重要發現
科研人員創制玉米穗腐病抗性育種技術
近日，中國農業科學院作物科學研究所玉米基因編輯育種研究團隊通過基因編輯靶向編輯玉米內源基因創制了一種突變體，并發現其在多環境下對玉米擬輪枝鐮孢穗腐病具有明顯抗性，為抗病育種提供了重要的種質材料與育種技術基礎。近日，相關研究結果在線發表于《植物生物技術》（Plant Biotechnology J
科學家揭示玉米簇生花序如何影響產量
花序的分枝數目在一定程度上決定了籽粒數目，進而影響籽粒產量。近日，美國《國家科學院院刊》在線發表了華中農業大學玉米團隊教授張祖新和美國加州大學伯克利分校教授Sarah Hake的合作成果。該成果揭示了Fascicled ear1位點兩個基因的拷貝數變異可調控玉米花序分生組織細胞命運，并闡述了花序
應用Arraystar－ChIRP測序和RNA測序于糖尿病性腎病研究
美國德克薩斯大學安德森癌癥研究中心Farhad R. Danesh教授主要從事腎臟病理的基礎與臨床研究。近期，其實驗室通過Arraystar RNA-seq發現lncRNA分子——Tug1在糖尿病小鼠體內低表達。表達譜芯片及Arraystar CHIRP-seq等證明，Tug1能夠直接結合PGC