反義技術——RNA干擾(RNAinterference,RNAi)
最近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在RNAi領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA干擾是由長的雙鏈 RNA分子發動的,該分子可以被Dicer enzyme加工成長度為21-23個核苷酸的RNA(見圖)。RNaseIII蛋白被認為是作為一個二聚體發揮作用,它對雙鏈RNA的兩個鏈都進行切割,酶切的產物3’末端互相重疊。然后這種小的干擾RNA分子(small interfering RNAs,siRNAs)摻入RNA誘導的沉默復合物(RNA- induced silencing complex,RISC),引導核酸酶降解靶RNA。 這種保守的生化機制可用于研究多種模式生物的基因功能,但是它在哺乳動物細胞中的應用受到阻礙,因為長的......閱讀全文
關于反義RNA的來源介紹
細胞中反義RNA的來源有兩種途徑:第一是反向轉錄的產物,在多數情況下, 反義RNA是特定靶基因互補鏈反向轉錄產物, 即產生mRNA和反義RNA的DNA是同一區段的互補鏈。第二種來源是不同基因產物,如OMPF基因是大腸桿菌的膜蛋白基因,與透性有關,其反義基因MICFZE則為另一基因。
反義RNA的概念和分類
反義RNA是指與mRNA互補后,能抑制與疾病發生直接相關基因的表達的RNA。它封閉基因表達,具有特異性強、操作簡單的特點,可用來治療由基因突變或過度表達導致的疾病和嚴重感染性疾病。根據反義RNA的作用機制可將其分為3類:Ⅰ類反義RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分編碼區,直接抑制翻譯,
反義RNA按作用機制分類
反義RNA是指與mRNA互補后,能抑制與疾病發生直接相關基因的表達的RNA。它封閉基因表達,具有特異性強、操作簡單的特點,可用來治療由基因突變或過度表達導致的疾病和嚴重感染性疾病。根據反義RNA的作用機制可將其分為3類:Ⅰ類反義RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分編碼區,直接抑制翻譯,
概述反義RNA的作用機制
反義RNA的分類和作用機制:下表總結了原核細胞內天然存在的11種反義RNA。這些反義RNA按其作用機制可經分為三大類。 調節水平 反義RNA 靶RNA 分類 功能 來源 轉錄后水平 micF RNA ompF mRNA 1A OmpF合成 染色體 oop RNA cⅡmRNA 1B 溶菌-
簡述反義RNA的穩定方法
[1]反義RNA3'端帶有莖環結構或類似ρ-不依賴性終止子結構時,可以穩定RNA分子; [2]Gorski等還發現在T4噬菌體的基因32mRNA的5'端上游的莖環結構及其附近的序列亦可穩定RNA分子。所以在設計反義RNA基因時,最好將產生3'及5'端這種二級結構
反義RNA的人工合成
既然反義RNA在原核生物中對基因表達起著重要的調控作用,那么人工設計在天然狀態下不存在的反義RNA來調節靶基因的表達,想必也是可能的。這已在不少實驗中得到證實。1.由于對靶mRNA的SD序列的上游區的結構了解甚少,因此,在要設計Ⅱ類反義RNA用于和靶mRNASD序列上游區結合,以期達到調節該mRNA
反義RNA的人工合成
1.由于對靶mRNA的SD序列的上游區的結構了解甚少,因此,在要設計Ⅱ類反義RNA用于和靶mRNASD序列上游區結合,以期達到調節該mRNA翻譯的目的是比較困難的。2.Ⅲ類反義RNA是和mRNA的起始處結合而形成類似ρ-不依賴性的轉錄終止子而使轉錄水平上抑制靶基因的表達。因此,要設法在靶mRNA上找
JACS:“量子點”助力RNA干擾技術
15年前,科學家發現了一種阻礙基因表達路徑的方法——RNA干擾(簡稱RNAi)。這項榮膺2006年諾貝爾獎的發現承載著醫學科學的迫切希望,它可以通過沉默基因來阻礙特定蛋白制造,從而達到疾病治療的效果。不過到目前為止,RNA干擾技術很難在活體細胞中取得應用。 圖片說明:由不同尺寸的相同物質構成的
反義RNA的分類和作用機制
反義RNA的分類和作用機制:下表總結了原核細胞內天然存在的11種反義RNA。這些反義RNA按其作用機制可經分為三大類。調節水平 反義RNA 靶RNA 分類 功能 來源轉錄后水平?micF RNA ompF mRNA 1A OmpF合成 染色體oop RNA cⅡmRNA 1B 溶菌-溶源?噬菌體sa
反義RNA的分類和作用機制
反義RNA的分類和作用機制:下表總結了原核細胞內天然存在的11種反義RNA。這些反義RNA按其作用機制可經分為三大類。調節水平 反義RNA 靶RNA 分類 功能 來源轉錄后水平?micF RNA ompF mRNA 1A OmpF合成 染色體oop RNA cⅡmRNA 1B 溶菌-溶源?噬菌體sa
反義RNA的主要功能
在原核生物中反義RNA具有多種功能,例如調控質粒的復制及其接合轉移,抑制某些轉位因子的轉位,對某些噬菌體溶菌-溶源狀態的控制等。下文僅舉數例。調控細菌基因的表達反義RNA對編碼CAP的基因的調控作用已如前述。這里再介紹一下micF RNA對ompF基因的表達的調控。ompF蛋白質是大腸桿菌的外膜蛋白
反義RNA的分類和作用機制
反義RNA的分類和作用機制:下表總結了原核細胞內天然存在的11種反義RNA。這些反義RNA按其作用機制可經分為三大類。調節水平 反義RNA 靶RNA 分類 功能 來源轉錄后水平?micF RNA ompF mRNA 1A OmpF合成 染色體oop RNA cⅡmRNA 1B 溶菌-溶源?噬菌體sa
高通量RNA干擾技術篩選DNA損傷實驗
目前,將RNAi庫和基于細胞水平的高通量分析技術相結合對于我們鑒定藥物敏感性和抵抗性的新機制有非常廣闊的前景。舉例來說,已有研究者對全基因組進行RNAi篩選找出了導致非小細胞肺癌對紫杉醇敏感的基因。這項研究也證實了RNAi技術在發現影響癌癥細胞細胞有絲分裂的靶點上具有很大潛力。 Molecular
簡述RNA干擾技術對腫瘤病的治療
腫瘤是多個基因相互作用的基因網絡調控的結果,傳統技術誘發的單一癌基因的阻斷不可能完全抑制或逆轉腫瘤的生長,而RNAi可以利用同一基因家族的多個基因具有一段同源性很高的保守序列這一特性,設計針對這一區段序列的dsRNA分子,只注射一種dsRNA即可以產生多個基因同時剔除的表現,也可以同時注射多種d
Science關注:向著RNA開炮的反義新藥
來自Science網站的新聞報道,根據一項臨床試驗發布的結果,采用具有漫長、曲折歷史的一種方法策略,一種新藥似乎可以減輕克羅恩病(Crohn’s disease)的癥狀。這一以核苷酸作為基本構件的藥物是生物技術公司Celgene做出的一場豪賭,去年Celgene付出7.1億美元的巨款將這一藥物收
反義RNA的人工合成過程介紹
既然反義RNA在原核生物中對基因表達起著重要的調控作用,那么人工設計在天然狀態下不存在的反義RNA來調節靶基因的表達,想必也是可能的。這已在不少實驗中得到證實。1.由于對靶mRNA的SD序列的上游區的結構了解甚少,因此,在要設計Ⅱ類反義RNA用于和靶mRNASD序列上游區結合,以期達到調節該mRNA
反義RNA的人工合成方法
既然反義RNA在原核生物中對基因表達起著重要的調控作用,那么人工設計在天然狀態下不存在的反義RNA來調節靶基因的表達,想必也是可能的。這已在不少實驗中得到證實。1.由于對靶mRNA的SD序列的上游區的結構了解甚少,因此,在要設計Ⅱ類反義RNA用于和靶mRNASD序列上游區結合,以期達到調節該mRNA
關于反義RNA的基本信息介紹
反義RNA是指與mRNA互補后,能抑制與疾病發生直接相關基因的表達的RNA。它封閉基因表達,具有特異性強、操作簡單的特點,可用來治療由基因突變或過度表達導致的疾病和嚴重感染性疾病。根據反義RNA的作用機制可將其分為3類:Ⅰ類反義RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分編碼區,直接抑制翻
關于反義RNA的注意點的介紹
[1]長的反義RNA并不一定比短的反義RNA更為有效; [2]在原核生物中針對SD序列及其附近區域的反義RNA可能更有效; [3]在真核生物中,對應于5'端非編碼區的反義RNA可能比針對編碼區的反義RNA更有效; [4]盡量避免在反義RNA分子中出現自我互補的二級結構; [5]設
Science關注:向著RNA開炮的反義新藥
來自Science網站的新聞報道,根據一項臨床試驗發布的結果,采用具有漫長、曲折歷史的一種方法策略,一種新藥似乎可以減輕克羅恩病(Crohn’s disease)的癥狀。這一以核苷酸作為基本構件的藥物是生物技術公司Celgene做出的一場豪賭,去年Celgene付出7.1億美元的巨款將這一藥物收
RNA干擾的簡介
RNAi研究取得了突破性進展,被《Science》雜志評為2001年的十大科學進展之一,并名列2002年十大科學進展之首。由于使用RNAi技術可以特異性剔除或關閉特定基因的表達,所以該技術已被廣泛用于探索基因功能和傳染性疾病及惡性腫瘤的基因治療領域。
RNA干擾功能特點
1.高效性:Elbashir等在研究中發現分別為25 nmol/L與100 nmol/L的起始雙鏈RNA產生的結果是一樣的,只是高濃度起始的更有效些。將雙鏈RNA濃度降低到1.5 nmol/L時產生的基因沉默效果變化不大,只有當濃度降低到0.05 nmol/L時,沉默的效果才消失。Holen等也證實
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA干擾的概念
RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)誘發的、同源mRNA高效特異性降解的現象。基因沉默,主要有轉錄前水平的基因沉默(TGS)和轉錄后水平的基因沉默(PTGS)兩類:TGS是指由于DNA修
RNA干擾制備方法
化學合成許多國外公司都可以根據用戶要求提供高質量的化學合成siRNA。主要的缺點包括價格高,定制周期長,特別是有特殊需求的。由于價格比其他方法高,為一個基因合成3—4對siRNAs 的成本就更高了,比較常見的做法是用其他方法篩選出最有效的序列再進行化學合成。最適用于:已經找到最有效的siRNA的情況
RNA干擾的特點
1.高效性:Elbashir等在研究中發現分別為25 nmol/L與100 nmol/L的起始雙鏈RNA產生的結果是一樣的,只是高濃度起始的更有效些。將雙鏈RNA濃度降低到1.5 nmol/L時產生的基因沉默效果變化不大,只有當濃度降低到0.05 nmol/L時,沉默的效果才消失。Holen等也證實
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾的定義
RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)誘發的、同源mRNA高效特異性降解的現象。
RNA干擾的概念
RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)誘發的、同源mRNA高效特異性降解的現象。基因沉默,主要有轉錄前水平的基因沉默(TGS)和轉錄后水平的基因沉默(PTGS)兩類:TGS是指由于DNA修
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準