新技術！蛋白DNA交互作用在單分子水平迎來重要突破！
ChIP-seq、ATAC-seq等都是常見的研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具，但這些傳統方法都無法獲得每一個大片段DNA分子上蛋白結合的真實狀態，無法進行DNA復雜結構域蛋白-DNA交互作用的分析，使得蛋白-DNA交互作用在單分子水平的研究受到限制。 近日，華大基因唐沖博士團隊在bioRxiv發表重要科學論文“Long-range single-molecule mapping of chromatin modification in eukaryotes”。該文章介紹了一種基于構建葡萄球菌蛋白A-甲基轉移酶融合重組蛋白，對抗體結合的組蛋白修飾、DNA結合蛋白附近的DNA進行特異性定點甲基化修飾，并通過長讀長測序，獲得高精度的、DNA單分子水平上的組蛋白修飾及DNA結合蛋白序列信息。 文章發表在bioRxiv上 值得注意的是，幾近同期，來自美國斯坦福大學的研究者也在同一期刊上發表類似技術的相關研究結果“DiM......閱讀全文
新技術！蛋白DNA交互作用在單分子水平迎來重要突破！
ChIP-seq、ATAC-seq等都是常見的研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具，但這些傳統方法都無法獲得每一個大片段DNA分子上蛋白結合的真實狀態，無法進行DNA復雜結構域蛋白-DNA交互作用的分析，使得蛋白-DNA交互作用在單分子水平的研究受到限制。 近日，華大基因唐沖博士團隊在bi
細胞用量大幅減少，新技術提升單分子DNA測序水平
美國格拉德斯通研究所團隊開發了兩種新的單分子分析工具，可將所需的DNA量減少90%至95%。該研究成果發表在最新一期《自然·遺傳學》雜志上，展示了這些工具如何幫助科學家解決他們以前無法回答的生物學問題。 單分子分析的黃金標準方法通常需要至少150000個人類細胞，其中包含數百萬個單個DNA分子
細胞用量大幅減少，新技術提升單分子DNA測序水平
美國格拉德斯通研究所團隊開發了兩種新的單分子分析工具，可將所需的DNA量減少90%至95%。該研究成果發表在最新一期《自然·遺傳學》雜志上，展示了這些工具如何幫助科學家解決他們以前無法回答的生物學問題。單分子實時測序示意圖。圖片來源：《自然·遺傳學》單分子分析的黃金標準方法通常需要至少150000個
單分子尺度研究領域取得重要突破
近日，松山湖材料實驗室生物界面團隊與納米生物材料團隊合作，在單分子尺度研究領域取得重要突破，首次揭示了質子化調控的pHLIP（pH低插入肽）構象轉變及跨膜動力學過程。相關成果已發表于《美國化學學會納米雜志》（ACS Nano）。 質子化驅動pHLIP構象變化及插膜動力學過程示意圖。研究團隊供圖
在單分子水平揭示藥物分子硫黃素T的微觀機制
該研究工作在單分子水平揭示藥物分子硫黃素T以寡聚態與靶點胰淀素蛋白結合，并從能量角度闡明分子識別過程中硫黃素T分子選擇性寡聚化的微觀機制。 選擇性寡聚化是自然界中廣泛分布的進化規律之一。在亞分子水平，兩條、三條或四條a-螺旋鏈受分子間相互作用的精細調控，平行或反平行排列形成的螺旋卷曲，構成了蛋
SR成像技術還能用于在單分子水平研究蛋白動態組裝過程
SR成像技術還能用于在單分子水平研究蛋白動態組裝過程 細胞對外界刺激信號的反應起始于胞膜，在胞膜上受體蛋白之間發生動態的集合，用來調節細胞的反應活性。像HIV這種有被膜病毒也是在細胞膜上完成病毒顆粒組裝過程的病毒，也是利用了細胞的物質轉運機制。盡管現在蛋白組裝的物理模型還遠遠沒有完成，但研究人員知
分子遺傳學詞匯單鏈DNA結合蛋白
中文名稱：單鏈DNA結合蛋白外文名稱：Single-stranded DNA-binding protein定義：單鏈DNA結合蛋白（Single-stranded DNA-binding protein，縮寫SSB或SSBP）又稱單鏈結合蛋白，是專門負責與DNA單鏈區域結合的一種蛋白質，為DNA復
中國科大在單分子磁體領域取得重要進展
近日，中國科學技術大學楊上峰教授團隊在單分子磁體領域取得重要進展，合成了首例含有鏑-鏑(Dy-Dy)共價鍵的雙金屬富勒烯，獲得了具有強反鐵磁耦合的高性能單分子磁體，其阻塞溫度為目前報道的所有通過4f電子直接耦合的多核單分子磁體中的最高值。相關研究成果以“Short Didysprosium Cova
Nature：用于蛋白質分析的單分子DNA技術
George Church 及同事開發出用于并行蛋白相互作用分析、借助用于蛋白功能分析的單分子DNA方法的一個“單分子相互作用測序”(SMI-seq)技術。 SMI-seq的工作原理是，通過核糖體顯示或酶結合將蛋白耦合到DNA識別符或“條碼”上。 這些條碼化的蛋白然后在水溶液中被一起分析，并
單分子水平下觀察對轉運蛋白的功能和工作機制
就能一艘能夠幫助乘客過河的船一樣，轉運蛋白（transporters）能運輸物質跨越細胞膜，這一過程對于從細菌到人類等多種有機體細胞的健康功能至關重要，此前研究人員僅能通過與這些轉運蛋白一起發揮作用的成百上千個轉運蛋白的行為中推斷出其功能，近日，一項刊登在國際雜志Nature上的研究報告中，來自
我國科學家在單分子精密測量方面取得重要進展
精確測定分子的化學結構、識別其化學物種一直是表面科學的核心問題，即使在單個分子層次上，分子結構、電子態及其激發態、化學鍵振動、反應動力學行為等多維度的內稟屬性也表現出顯著的特異性。分子多維度內稟參量的精密測量是一個極具挑戰性的前沿問題。 在國家重點研發計劃“納米科技”重點專項支持下，我國科
單原子存儲和單分子邏輯開關技術獲突破
《科學》：超高密度存儲設備及分子級計算機指日可待 ?美國IBM公司在最新一期《科學》雜志上發表了兩份研究報告，公布了其在單原子存儲技術和單分子邏輯開關研究方面取得的技術突破。這是納米技術領域兩項最新的重大科學成就。?在第一份報告中，IBM科學家描述了在測量單個原子的磁各向異性特性方面取得的重大進展。
我國學者在單分子水平實現光場和電場對偶氮苯分子調控
偶氮苯分子作為光致變色分子，在紫外和可見光的照射下，可實現順式與反式之間的相互轉化。利用分子電路在單分子水平研究偶氮苯分子的異構化，不僅能實時觀測單個分子對外界刺激的響應，研究其動力學過程，同時也有望實現單分子開關、單分子存儲器等應用，實現器件微型化。 最近，中國科學院物理研究所/北京凝聚態物
分子遺傳學詞匯單鏈DNA
中文名稱：單鏈DNA外文名稱：single－stranded DNA定義：大部分DNA以雙螺旋結構存在，但一經熱或堿處理就會變為單鏈狀態。
Science：單分子實時觀測DNA復制
由于DNA長鏈常常出現單個堿基的缺失或是損傷，因此DNA損傷相當常見，每天每個細胞大約有100萬個分子損害。這些損傷可以造成DNA復制過程停滯，從而導致細胞死亡。為了避免它，細胞利用幾個信號通路來繞過損傷繼續DNA復制過程。近日來自西班牙巴塞羅那大學的研究人員利用一些單分子操縱技術在體外重現了其
郭雪峰課題組在單分子檢測研究領域取得重要進展
單分子檢測技術是一種在單分子層次上揭示組裝基元/生物分子間相互作用的精妙方法，能夠提供隱藏在系綜實驗中的分子結構與功能之間的豐富信息，因而被廣泛應用于單個相互作用事件的動力學研究。針對傳統的單分子熒光檢測手段可能遇到的問題，如需要熒光標記、具有光漂白以及時間分辨率不足的問題，最近北京大學化學與
新技術實現對單分子的超快操縱
對于實驗科學而言，新材料、新方法、新表征的發展是相關研究領域取得關鍵突破的重要保障。為此，研之成理特此開設“新思路專欄”，深入介紹“新材料、新方法、新表征”相關的研究進展，希望給科研人員帶來一絲啟發與幫助。??? 前言??? 掃描探針技術可以運用原子級別精確的力在表面上構建功能性原子、分子結構，
我國木材DNA識別新技術研究獲突破
日前，中國林業科學研究院木材工業研究所(簡稱“中國林科院木材所”)研究員殷亞方率領的木材解剖學研究組，近期在國際木材科學領域重要學術期刊IAWA Journal(國際木材解剖學家協會期刊)2012年33卷第4期發表了最新研究成果――“Comparative analysis of two D
稀土單分子磁體弛豫研究重要進展
中科院長春應用化學研究所稀土資源利用國家重點實驗室唐金魁、張洪杰研究員等在稀土單分子磁體弛豫研究方面取得重要進展，相關成果發表在國際著名化學期刊《美國化學會志》（J. Am. Chem. Soc., 2010, 132, 8538）上。 近年來，由分立的、從磁學意義上講沒有相
科研人員在單分子水平實現光場和電場對器件的調控
偶氮苯分子作為光致變色分子，在紫外和可見光的照射下，可實現順式與反式之間的相互轉化。利用分子電路在單分子水平研究偶氮苯分子的異構化，不僅能實時觀測單個分子對外界刺激的響應，研究其動力學過程，同時也有望實現單分子開關、單分子存儲器等應用，實現器件微型化。 最近，中國科學院物理研究所/北京凝聚態物
單鏈DNA結合蛋白的功能簡介
單鏈DNA結合蛋白（Single-stranded DNA-binding protein，縮寫SSB或SSBP）又稱單鏈結合蛋白，是專門負責與DNA單鏈區域結合的一種蛋白質，為DNA復制、重組和修復所必需的成分。 防止兩條互補單鏈再次結合為雙螺旋，維持單鏈狀態。防止單鏈區域形成鏈內二級結構。
Nature子刊：新技術攻克單分子測序大問題
來自冷泉港實驗室(CSHL)的一位定量生物學家及同事們開發出了一種混合錯誤校正新方法攻克了單分子測序的重大問題，可將長讀(long reads)的準確度提高到99.9%。這一研究成果發布在7月1日的《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上。 領導這一研究的是冷
我國學者在仿生催化和有機小分子催化領域獲重要突破
在國家自然科學基金項目 (項目編號：21672148、21472125) 等資助下，上海師范大學資源化學教育部重點實驗室趙寶國課題組受L-蘇氨酸醛縮酶(L-threonine aldolase)催化甘氨酸與醛之間的羥醛縮合(aldol reaction)的啟發，提出和實現了以羰基化合物（醛或酮）
Nature重大突破：破解蛋白的新技術
來自美國能源部(DOE)勞倫斯伯克利國家實驗室(Berkeley Lab)的研究人員發表了一項飛躍性的成果，能令科學家們更深入的了解蛋白質之類的大分子在溶液中的結構狀態。研究人員利用X射線(SAXS)或中子(SANS)SAS小角散射實驗數據，開發出了一套新指標，這將能令所需時間縮減達20倍。
Nature重大突破：破解蛋白的新技術
來自美國能源部(DOE)勞倫斯伯克利國家實驗室(Berkeley Lab)的研究人員發表了一項飛躍性的成果，能令科學家們更深入的了解蛋白質之類的大分子在溶液中的結構狀態。研究人員利用X射線(SAXS)或中子(SANS)SAS小角散射實驗數據，開發出了一套新指標，這將能令所需時間縮減達20倍。
QSI與弗吉尼亞大學合作，在ASMS2024上展示單分子檢測突破
弗吉尼亞大學分子生理學和生物物理學系助理教授Gloria Sheynkman博士將在2024年6月2日至6日舉行的美國質譜學會（ASMS）年會上與QSI合作開發的海報。QSI研究部主任Brian Reed博士將在2024年6月1日至4日舉行的歐洲人類遺傳學學會（ESHG）年會上發表演講。由Glori
四氫嘧啶在分子水平的應用
四氫嘧啶，這個聽起來頗為復雜的名詞，其實是一種具有神奇功能的化合物。它被譽為“耐鹽菌萃取液”，學名四氫甲基嘧啶羧酸，是從玻利維亞烏尤尼鹽沼中的高嗜鹽菌中提取而來。這種氨基酸衍生物在分子水平上的應用，已經引起了科研和工業領域的廣泛關注。 在分子水平上，四氫嘧啶展現出了對酶和DNA的穩定作用。酶是
北大學者Nature－Biotechnology公布DNA測序重要突破
一種全新概念的測序方法 北京大學生物動態光學成像中心，北京未來基因診斷高精尖創新中心等處的研究人員發表了題為“Highly accurate fluorogenic DNA sequencing with information theory–based error correction”的文
測序牛人發布蛋白單分子測序技術
人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋白質是幾乎所有生命過程的主要執行者。 現在，美國亞利桑納州立大學Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事，在納米孔DNA測序技術的基礎上，開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用
石墨烯等離子超介質可使藥檢達單分子水平
據物理學家組織網1月14日(北京時間)報道，一個由英國曼徹斯特大學和法國艾克斯—馬賽大學人員組成的研究小組，開發出一種新型的等離子超介質探測設備，利用了奇點光學中超常相位拓撲的性質，能通過簡單的光學系統就看到單個分子，并在幾分鐘內分析出它的成分，藥物檢測精確度提高了3個數量級，可用于人體藥檢、機