“六谷”豐登？——首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰 中國農科院供圖 中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研究所、深圳農業基因組研究所等單位聯合，完成首個中國菰染色體水平基因組組裝，并通過共線性分析和轉錄組測序鑒定到中國菰落粒性相關基因。該研究為中國菰落粒性基因編輯提供了候選靶點，有助于加速中國菰落粒性的定向馴化改良。相關研究成果發表于《通訊—生物學》（Communications Biology）。 論文通訊作者、煙草所副研究員閆寧介紹，中國菰具有生物量大、耐深水、灌漿成熟快、籽粒蛋白質含量高和抗稻瘟病等優良性狀，由于未......閱讀全文
“六谷”豐登？——首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ? ??中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研
“六谷”之一菰米首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ??? ? 中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水
首個豆科綠肥作物染色體水平基因組組裝完成
?紫云英? ? ? ?中國農科院供圖近日，中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所肥料及施肥技術團隊完成了首個豆科綠肥作物——紫云英的染色體水平參考基因組組裝，并利用比較基因組學解析了紫云英共生結瘤的遺傳基礎。該研究填補了豆科綠肥作物基因組學研究的空白，為豆科植物與根瘤菌共生提供了新的見解。相關研究成
首個種業大語言模型“豐登”發布
4月28日，中國農業大學生物學院教授王喜慶團隊聯合上海人工智能實驗室、崖州灣國家實驗室發布首個種業大語言模型“豐登”（SeedLLM）。種業大語言模型“豐登”。中國農業大學供圖“豐登”集成了先進的人工智能技術（書生·浦語2.0）與大數據分析，通過深入學習我國迄今發布的科研文獻、科技書籍、種企報告和歷
Cell：染色體水平油松基因組組裝和甲基化研究取得進展
近期，北京林業大學生物科學與技術學院聯合安諾優達在國際知名期刊Cell（IF：41.582）在線發表了題為“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章，研究者對油松進行了
水稻近緣種北美沼生菰首個近完整基因組組裝完成
近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與生物合成創新團隊聯合院華東中心等單位，完成首個北美沼生菰接近完整基因組的組裝，為菰屬作物遺傳改良、功能基因解析和關鍵生物過程研究提供了寶貴的資源。相關研究成果發表在《作物學報》（The Crop Journal）上。作為栽培稻的重要野生近緣種，北美沼生菰是
學者發表紫苞芭蕉和朝天蕉首個染色體水平基因組
近日，中國科學院華南植物園副研究員黃慧潤、研究員王崢峰團隊在國家自然科學基金項目的資助下，研究結合Oxford Nanopore和Hi-C測序技術成功組裝并發表了紫苞芭蕉和朝天蕉的首個染色體水平基因組。相關成果在線發表于《園藝研究》（Horticulture Research）。紫苞芭蕉和朝天蕉的花
首個合成酵母基因組中最后一條染色體創建完成
據最新一期《自然·通訊》雜志報道，包括澳大利亞麥考瑞大學在內的國際科學家團隊，在合成生物學領域取得了重大成就，成功完成了世界上首個合成酵母基因組中最后一條染色體的創建，拼上了最后一塊“拼圖”。釀酒酵母的彩色掃描電子顯微照片。科學家從釀酒酵母中創建了世界上第一個合成真核基因組和一個新發現的tRNA新染
首個家雞基因組圖譜繪制完成
西南大學教授徐洛浩課題組以中國特有家雞品系胡須雞為材料，在國際上率先繪制出首個家雞全基因組圖譜。2月13日，相關研究成果以《家雞基因組完成圖的演化分析》為題，發表在美國《國家科學院院刊》上。這是繼去年人類基因組完成圖公布以來，首個發表的脊椎動物基因組完成圖，也是基因組完成圖譜繪制技術首次在經濟動物中
染色體水平冬瓜參考基因組發布
近日，廣東省農業科學院蔬菜研究所發布了染色體水平冬瓜參考基因組。相關研究發表于Scientific Data，廣東省農業科學院蔬菜研究所副研究員羅文龍和副研究員閆晉強為該論文共同第一作者，廣東省農業科學院蔬菜研究所研究員江彪為通訊作者。廣東省農業科學院蔬菜研究所于2019年對黑皮大冬瓜B227進行基
首個蕨類植物基因組測序完成
蕨類植物是地球上最多樣化的植物種群之一，也是僅有的沒有完成基因組測序的主要植物種群。2018年7月18日，美國康奈爾大學研究人員在《自然-植物》期刊上發表了其完成蕨類植物基因組測序的結果。 蕨類植物的基因組較大，可以擁有多達720對染色體，包含多達1480億個堿基對的DNA序列（Gb）。相比之
我國完成首個魚類基因組測序項目
記者8月5日從深圳華大基因研究院獲悉，中國水產科學研究院黃海水產研究所和深圳華大基因研究院已聯合完成半滑舌鰨全基因組測序和組裝，繪制了半滑舌鰨全基因組序列圖譜。這是我國完成的第一個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜，使半滑舌鰨成為世界上第一個測定了全基因組序列的鰈形目魚類。 據了解
研究發布首個高質量染色體水平的哀牢髭蟾參考基因組
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中國兩棲類（2019）將其歸為Leptobrachium ailaonicum的同物異名] 俗稱“胡子蛙”、“深山角怪”，屬兩棲綱、無尾目、角蟾科，是中國特有種。該物種具有多個
研究發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
人類基因全測序完成！最后的Y染色體的組裝和分析完成
《自然》23日發表的兩篇論文公布了人類Y染色體的組裝和分析，Y染色體也是最后完成全測序的人類染色體。這項全球100多名科學家參與的研究填補了當前Y染色體參考的諸多空白，帶來了對不同人群演化和變異的見解。人類Y染色體由于結構復雜一直很難測序和組裝。超過一半的Y染色體在當前的人類參考基因組組裝中缺失，導
龍井茶樹染色體級別基因組組裝成功
? ?龍井43 ?? 中國農科院供圖 近日，《自然—通訊》在線發表了我國科學家在茶樹全基因組組裝和茶樹起源演化研究上取得的重要突破。該項研究由中國農業科學院茶葉研究所（以下簡稱茶葉所）和中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）主導并攜手中國科學院昆明動物研究所（以下簡稱昆
昆明動物所首個高質量染色體水平的哀牢髭蟾參考基因組
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中國兩棲類（2019）將其歸為Leptobrachium ailaonicum的同物異名] 俗稱“胡子蛙”、“深山角怪”，屬兩棲綱、無尾目、角蟾科，是中國特有種。該物種具有多個
我國科學家公布世界首個藏羚染色體水平高質量基因組
14日，記者從中國科學院西北高原生物研究所獲悉，該研究所張同作研究員聯合青海大學魏青副教授等團隊，成功組裝了藏羚染色體級別的基因組，首次獲得藏羚染色體水平的高質量基因組和注釋信息，為藏羚的適應進化遺傳機制、保護遺傳學研究及進一步探索物種遷徙行為的遺傳機制提供了重要基因組資源。相關結果發表在《自然》旗
－首個越南人基因組圖譜繪制完成
越南科學家日前首次成功繪制出一名越南人的基因組圖譜。 越通社報道說，來自河內國家大學下屬科技大學的研究小組1月16日公布了這份基因組圖譜繪制與分析的初步結果。 該研究組主任黎士榮表示，2013年年底，研究小組收到一名越南人的基因組數據，在此基礎上對其進行分析排序，成功繪制出基因組圖譜
迄今最連續的人類基因組組裝完成
英國《自然·生物技術》雜志29日在線發表了一項基因組學研究成果：英國科學家團隊利用一個口袋大小的納米孔測序裝置，從頭組裝出人類基因組，這是迄今為止最連續的人類基因組組裝，而且只用了單一測序技術。這項研究同時成功地分析了過去最先進的測序方法也分析不出的人類基因組區域。 理解和解讀人類基因組是現代
我國科學家完成大蒜基因組測序和組裝
近日，中國農業科學院麻類研究所南方蛋白飼料植物資源開發與利用團隊聯合有關高校和企業，歷時4年完成了大蒜基因組的測序和組裝工作。相關研究成果在線發表在《分子植物》上。 據課題組成員劉頭明研究員介紹，大蒜是重要的蔬菜作物之一，我國大蒜的年播種面積達到1000萬畝以上。大蒜具有膨大的鱗莖，富含大
海洋所首次完成仿刺參基因組測序和組裝
日前，我國科學家在國際上首次完成仿刺參基因組測序和組裝，對刺參生物學和遺傳育種研究具有重要科學意義，將對我國刺參產業發展產生重要推動作用。 該成果由中國科學院海洋研究所研究員楊紅生團隊和相建海團隊共同完成，在天津生物芯片技術公司的技術支撐下，突破了刺參復雜基因組測序和組裝技術瓶頸，采用新一代測
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
象腿蕉（Ensete glaucum）是芭蕉科中耐寒的蕉類植物，原產于中國云南和東南亞地區，具有觀賞、飼用和藥用價值。中國科學院華南植物園教授John Seymour Heslop Harrison帶領的研究團隊，采用單分子納米孔、Illumina測序策略，結合染色體構像捕獲技術，發表了首個象腿蕉染
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊，在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者，華
Nature：首個中國人基因組測序完成
11月6日最新一期《自然》雜志以封面文章形式發表了由深圳華大基因研究院完成的首個中國人基因組序列研究成果（定名“炎黃一號”）。 深圳華大基因研究院院長汪建介紹說，這一長達7頁的長篇論文描繪了第一個亞洲人的全基因組圖譜，測序數據總量達到1177億堿基對，基因組平均測序深度達到36倍，有效覆蓋率高
首個石榴端粒到端粒參考基因組圖完成
近日，中國農業科學院鄭州果樹研究所（以下簡稱鄭果所）特色漿果與干果種質改良課題組在國際期刊《植物生物技術雜志》（Plant Biotechnology Journal）上發表研究論文，該研究組裝了首個石榴端粒到端粒（T2T）參考基因組圖，揭示了控制石榴果皮顏色和籽粒硬度等重要經濟性狀形成的遺傳機
昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
研究人員完成棗和酸棗單倍型基因組組裝
近日，西北農林科技大學林學院紅棗團隊黃建研究員課題組以我國制干棗主栽品種‘駿棗’和著名“秦藥”代表清澗酸棗為研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多種先進測序技術以及多種組裝策略完成了棗和酸棗T2T gap-free和T2T gap-free單倍型基因組的組
ITER－TAC1項目首個超導接頭完成組裝連接
近日，隨著12號縱場磁體線圈終端盒與過渡饋線間（TF12 CTB-CFT）超導接頭第三次絕緣固化結束，由中國科學院合肥物質科學研究院等離子體物理研究所TAC1團隊全面負責的ITER現場首個超導饋線接頭的組裝連接工作完成，這是ITER主機裝配集成的又一重要節點。 超導接頭是超導饋線、磁體的核心部
世界首個梅花全基因組重測序研究完成
日前，北京林業大學張啟翔教授領銜的國家花卉工程技術研究中心，與青島華大基因研究院、深圳華大生命科學研究院以及賓夕法尼亞州立大學等單位通力合作完成了首個梅花全基因組重測序研究，構建完成了世界首張梅花全基因組變異圖譜，“梅花花部性狀的遺傳結構”（The genetic architecture of