PLoSGenet：何新建等模式植物擬南芥研究獲進展
2014年1月22日，北京生命科學研究所何新建實驗室在《PLOS Genetics》雜志在線發表題為“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA methylation loci”的論文，該論文報道了模式植物擬南芥中的兩個組蛋白甲基化酶的同源蛋白SUVH2和SUVH9參與招募RNA聚合酶V并調控RNA介導DNA甲基化的機制。 植物中RNA介導DNA甲基化引起的轉錄沉默參與維持轉座元件和DNA重復序列的穩定。在RNA介導DNA甲基化過程中，植物特異存在的依賴DNA 的RNA聚合酶IV和V產生的非編碼RNA具有關鍵作用，可以通過順式作用介導DNA甲基化。因此，研究這兩個聚合酶在染色質上的定位機制，有助于理解 RNA介導DNA甲基化作用的位置特異性。何新建實驗室以前的研......閱讀全文
鋅指蛋白ZFP217通過介導m6A－mRNA甲基化導致肥胖的原理
過去三十年來，全球肥胖和2型糖尿病的發病率有所上升，而脂肪組織是肥胖相關疾病的重要因素，因此，控制脂肪細胞分化和成熟可能是治療肥胖相關疾病的一個有希望的策略（1）。為了闡明轉錄和表觀遺傳調控在脂肪形成中的作用，并確定一個主要的關鍵調控因子和途徑（1，2），人們做了大量的努力，然而，轉錄后調控在脂肪形
載體蛋白介導的易化擴散
運輸過程是通過載體蛋白發生可逆的構象變化實現的。載體蛋白是膜上與物質運輸有關的穿膜蛋白，對所運輸的物質具有高度選擇性，當載體蛋白一端表面的特異結合部位與專一的溶質分子結合，引發載體蛋白空間構象改變，將運送的溶質分子從結合的一側轉運到膜的另一側；變構的載體蛋白對被轉運物質的親和力同時發生改變，于是被轉
內含肽介導的蛋白連接
通過改變裂解條件以及對內含肽進行適當修飾，可以生物合成c端帶有硫酯鍵或N端帶有半光氨酸的蛋白質分子。兩種蛋白質混合以后，硫酯鍵和半光氨酸利用“自然化學連接”(native chemical ligation)的原理進行自發的連接反應，在硫酯和半光氨酸之間形成肽鍵，從而將兩種蛋白質連接起來。自然化學連
通道蛋白介導的易化擴散
運輸過程借助于穿越脂雙分子層的通道蛋白完成。通道蛋白中心是親水性小孔，不同種類的通道蛋白可分別運輸離子，水等小分子。主要運輸離子的通道蛋白也稱為離子通道，對離子具有高度親和力和高度選擇性。離子通道運輸速率高，每秒運輸離子數量多達幾百萬個，載體蛋白每秒運載的分子數目則不足一千個。某些離子通道蛋白星關閉
通道蛋白介導的易化擴散
運輸過程借助于穿越脂雙分子層的通道蛋白完成。通道蛋白中心是親水性小孔，不同種類的通道蛋白可分別運輸離子，水等小分子。主要運輸離子的通道蛋白也稱為離子通道，對離子具有高度親和力和高度選擇性。離子通道運輸速率高，每秒運輸離子數量多達幾百萬個，載體蛋白每秒運載的分子數目則不足一千個。某些離子通道蛋白星關閉
載體蛋白介導的易化擴散介紹
運輸過程是通過載體蛋白發生可逆的構象變化實現的。載體蛋白是膜上與物質運輸有關的穿膜蛋白，對所運輸的物質具有高度選擇性，當載體蛋白一端表面的特異結合部位與專一的溶質分子結合，引發載體蛋白空間構象改變，將運送的溶質分子從結合的一側轉運到膜的另一側；變構的載體蛋白對被轉運物質的親和力同時發生改變，于是被轉
G蛋白介導的信號轉導途徑
G蛋白可與鳥嘌呤核苷酸可逆性結合。由γ亞基組成的異三聚體在膜受體與效應器之間起中介作用。小G蛋白只具有G蛋白?亞基的功能，參與細胞內信號轉導。信息分子與受體結合后，激活不同G蛋白，有以下幾種途經：（1）腺苷酸環化酶途徑 通過激活G蛋白不同亞型，增加或抑制腺苷酸環化酶（AC）活性，調節細胞內cAMP濃
G蛋白介導的信號轉導途徑
G蛋白可與鳥嘌呤核苷酸可逆性結合。由γ亞基組成的異三聚體在膜受體與效應器之間起中介作用。小G蛋白只具有G蛋白?亞基的功能，參與細胞內信號轉導。信息分子與受體結合后，激活不同G蛋白，有以下幾種途經：（1）腺苷酸環化酶途徑 通過激活G蛋白不同亞型，增加或抑制腺苷酸環化酶（AC）活性，調節細胞內cAMP濃
未正確折疊蛋白介導的細胞凋亡
在真核生物體內，為正確折疊蛋白反應(unfolded protein response，UPR)是細胞對抗內質網應激的一種重要的自我保護機制。當細胞中出現長時間或高強度的UPR時，三種內質網上的跨膜蛋白PERK、IREI、ATF6在發揮修復作用的同時，也可以同時啟動由ERS介導的三種細胞凋亡途徑。P
泛素化介導葉綠體蛋白降解新途徑
為了應對全球氣候變化帶來的頻繁逆境脅迫，全面而清晰地了解植物面對脅迫反應的不同調控機制具有重要的意義。在植物抗逆研究中，研究發現非生物脅迫會抑制植物的光合作用，影響葉綠體的穩定性并誘導葉綠體的降解，葉綠體降解進而會引發植物早衰，最終影響作物產量。葉綠體是為植物提供能量來源的重要細胞器。植物葉綠體內部
揭秘Piezo蛋白介導機體觸覺的分子機制
我們的身體能夠感知多種機械刺激，我們的觸覺能夠有效區分微風吹過皮膚的感覺和疼痛的按壓感，而其它系統則能夠檢測到肌肉的伸展，甚至血壓；我們感知這些東西的能力需要一種外力，其能夠在遍布機體不同組織的感覺神經元細胞的微小末梢轉化為電信號，其中兩個相關蛋白：Piezo1和Piezo2離子通道就能夠通過允
關于內含肽介導的蛋白連接的介紹
通過改變裂解條件以及對內含肽進行適當修飾，可以生物合成c端帶有硫酯鍵或N端帶有半光氨酸的蛋白質分子。兩種蛋白質混合以后，硫酯鍵和半光氨酸利用“自然化學連接”(native chemical ligation)的原理進行自發的連接反應，在硫酯和半光氨酸之間形成肽鍵，從而將兩種蛋白質連接起來。自然化
染色質重塑因子PKL在RNA介導的DNA甲基化中的功能
5月31日，《基因組生物學》（Genome Biology）雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心張蘅研究組題為The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation
組蛋白甲基化修飾研究再獲突破
日前，復旦大學徐彥輝課題組在組蛋白甲基化修飾研究領域獲得新進展，相關成果發布在《分子細胞》上，該項研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助。 組蛋白甲基化修飾是一種非常重要的表觀遺傳修飾，參與調節異染色質形成、X染色體失活、基因印記及DNA的損傷修復等多種生命過程。關于組蛋白去甲基化酶的研究是
谷氧還蛋白介導活性氧平衡調控木薯抗旱
木薯是一種重要的熱帶作物，是非洲等熱帶地區的主要糧食作物之一。其塊根碳水化合物含量高達38%，且含有多種維生素，是全球10億多人口的主要食物來源。木薯在種植過程中，其苗期和塊根形成期與熱帶地區的旱季重疊，干旱對木薯的產量和品質有非常大的影響。因此，鑒定木薯重要的抗旱基因、提高栽培木薯對干旱的適應性，
水生所揭示Smad蛋白介導BMP信號的調控機制
BMP蛋白是一類形態發生素(morphogen)，對胚胎早期發育的背腹軸向決定起著關鍵作用，其功能喪失將導致腹側發育的嚴重缺陷。BMP信號由3類受體型Smad——Smad1、Smad5、Smad8 (Smad9)來介導。然而，這些受體型Smad是如何在胚胎發育早期進行精細調控，在整體水平上調
斷裂型內合肽介導的蛋白質環化
環化蛋白質具有3個明顯的特性：①提高穩定性和活性，這是由于環化的蛋白質可以減少非折疊狀態的構象熵值；②折疊速度快，這是因為其減少了折疊途徑的數目的緣故；③對N端和C端特異性的蛋白酶具有抗性，因此能改善在體內的穩定性。由于以上特性，環化蛋白質在蛋白質工程和醫藥工業中備受重視。以IMPACT～TWIN(
發現介導癌細胞關鍵生命活動的蛋白質
蛋白質是生命的組成部分——在細胞內，蛋白質結合成大型的大分子復合物，即蛋白質的聯合體，它們相互協作以完成特定的功能。大量的癌癥研究集中在尋找這些蛋白質復合物的抑制劑。像mTOR和ATR這樣的激酶，以及像端粒酶這樣在腫瘤中過度表達的酶，都屬于這類復合物。 有一些蛋白質(稱為伴侶蛋白和共同伴侶蛋白
關于G蛋白介導的信號轉導途徑的介紹
G蛋白可與鳥嘌呤核苷酸可逆性結合。由γ亞基組成的異三聚體在膜受體與效應器之間起中介作用。小G蛋白只具有G蛋白?亞基的功能，參與細胞內信號轉導。信息分子與受體結合后，激活不同G蛋白，有以下幾種途經： （1）腺苷酸環化酶途徑 通過激活G蛋白不同亞型，增加或抑制腺苷酸環化酶（AC）活性，調節細胞內c
植物所發現蛋白構象改變介導開花新機制
開花是高等植物進入生殖發育的重要標志，受關鍵基因以及組蛋白修飾的精確調控，甾醇類激素(BRs)和赤霉素(GAs)參與其中，但激素信號分子與蛋白質構象的瞬時改變如何聯動調控開花尚不清楚。 中科院植物研究所種康研究組及其合作者發現，BRs信號途徑中核心轉錄因子BZR1通過直接抑制組蛋白去甲基化
ApoE4顯著惡化tau蛋白介導的神經退化
2017年9月23日/生物谷BIOON/---在將近25年之前，人們鑒定出一種ApoE4基因變異體是阿爾茨海默病的一種主要風險因子，這種變異體讓一個人患上這種神經退行性疾病的幾率增加了高達12倍。然而，人們并不清楚為何這種變異體是如此危險。當ApoE4蛋白存在時，β-淀粉樣蛋白（Aβ）團塊在大腦
PLoS－Genet：何新建等模式植物擬南芥研究獲進展
2014年1月22日，北京生命科學研究所何新建實驗室在《PLOS Genetics》雜志在線發表題為“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
組蛋白修飾與DNA甲基化之間的關系
在引起基因沉默的過程中，沉默信號(DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重新裝配)是如何進行的?誰先誰后?這是一個“雞和蛋”的問題，目前仍處于研究階段，還沒有定論。研究發現DNA甲基化和組蛋白乙酰化是一個相互促進、加強的過程，如許多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG結合蛋白—
Science－|－抗逆突破！泛素化介導葉綠體蛋白降解新途徑
為了應對全球氣候變化帶來的頻繁逆境脅迫，全面而清晰地了解植物面對脅迫反應的不同調控機制具有重要的意義。在植物抗逆研究中，研究發現非生物脅迫會抑制植物的光合作用，影響葉綠體的穩定性并誘導葉綠體的降解，葉綠體降解進而會引發植物早衰，最終影響作物產量。 葉綠體是為植物提供能量來源的重要細胞器。
研究揭示喹諾酮抗性蛋白介導的細菌耐藥機制
細菌抗生素耐藥性是預防傳染病的重大威脅，通常是由質粒轉移或基因突變引起的。當細菌暴露于抗生素環境中會通過提高細菌的突變率篩選出適應抗生素環境的基因突變，結果導致臨床環境中耐藥菌株的出現。質粒驅動抗生素抗性基因的水平轉移，引發細菌耐藥性的產生。此外，質粒和細菌染色體之間的相互作用會影響抗生素抗性的
Nature研究首次證明自噬可介導核內蛋白降解
????? "自噬"這個詞從字面意思來看就是自己吃自己，對于細胞來說就是不需要的細胞內成分被細胞自身降解的過程，關于自噬的研究已經有很多，但是最近一項發表在國際學術期刊Nature上的最新研究首次發現自噬可以介導細胞核內物質的降解，并且細胞核內發生的自噬在對抗癌癥發生方面發揮一定作用，該項工作由
Science－|－抗逆突破！泛素化介導葉綠體蛋白降解新途徑
為了應對全球氣候變化帶來的頻繁逆境脅迫，全面而清晰地了解植物面對脅迫反應的不同調控機制具有重要的意義。在植物抗逆研究中，研究發現非生物脅迫會抑制植物的光合作用，影響葉綠體的穩定性并誘導葉綠體的降解，葉綠體降解進而會引發植物早衰，最終影響作物產量。 葉綠體是為植物提供能量來源的重要細胞器
Science－|－抗逆突破！泛素化介導葉綠體蛋白降解新途徑
為了應對全球氣候變化帶來的頻繁逆境脅迫，全面而清晰地了解植物面對脅迫反應的不同調控機制具有重要的意義。在植物抗逆研究中，研究發現非生物脅迫會抑制植物的光合作用，影響葉綠體的穩定性并誘導葉綠體的降解，葉綠體降解進而會引發植物早衰，最終影響作物產量。 葉綠體是為植物提供能量來源的重要細胞器
蛋白質DNA相互作用的甲基化和尿嘧啶干擾分析法—甲基化
實驗方法原理在甲基化干擾實驗中，探針通過將鳥嘌呤N-7及腺嘌呤N-3位用硫酸二甲酯 (DMS)進行甲基化而產生。這些甲基化的堿基可被哌啶特異性切割。實驗材料含有蛋白質結合位點的DNA片段試劑、試劑盒TE 緩沖液 pH 7.5 ?8.0硫酸二甲酯（DMS)DMS反應緩沖液DMS終止緩沖液10 mg m
兩篇PNAS：蛋白納米孔檢測DNA甲基化
兩個獨立的研究團隊利用通道蛋白實現納米孔測序，成功鑒別了5-甲基胞嘧啶和5-羥甲基胞嘧啶。這兩篇文章發表在同一期的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 基因組所蘊含的編碼信息，包括DNA序列和核苷酸修飾兩個部分。其中，動態的DNA甲基化模式，是基因表達的重要調控者，與細胞分化、胚胎發育和癌癥