《自然方法學》：可視蛋白質組學
瑞士聯邦技術學院的研究人員開發出一種在問號鉤端螺旋體(Leptospira interrogans)這種病原體中定位蛋白復合物的新方法，稱為“可視蛋白質組學”。文章發表在本期的《自然-方法學》上。 活細胞中的生化進程分為多個功能單元，它們在細胞內有著特定的時間和空間分布。一般來說，這些單元是相互作用蛋白形成的復合物。定量質譜常常用于確定蛋白復合物的組成，但這種方法需要多個細胞的裂解液，但這樣一來，空間信息就損失了，特定細胞的特有性質也就看不見了。 低溫電子斷層掃描術(cryoET)是一種三維觀察細胞的成像技術。在目前可實現的分辨率下，它能鑒定并定位冰凍含水標本中的大蛋白復合物。這是通過模板匹配來實現的，將代表特定蛋白復合物的信號與cryoET收集的信號聯系起來。多個蛋白復合物的結構特點組合，就有可能描述出特定細胞的立體蛋白質組結構，這個過程就稱為“可視蛋白質組學”。這種方法已經應用到無細胞系統中，它在完整細胞中的......閱讀全文
蛋白質組學技術的功能介紹
“讀”，在字典里的意思是識取、讀取，放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。 自2003年4月14日人類基因組計劃（HGP）宣告完成以來，基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據，但實際上絕大
魯克在－timsTOF－4D蛋白質組學和表觀蛋白質組學平臺上擴展
在蛋白質組論壇| EuPA 2022，布魯克公司（納斯達克股票代碼：BRKR）宣布擴展了更深層次的蛋白質組學和表觀蛋白質組學覆蓋的能力，包括使用創新的 TIMScore 算法增強磷酸肽分析，該算法現在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平臺的一部分。新的 TIMScore 算法利用機器學
基因組學與蛋白質組學兩大巨頭建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日聯手推出OneOmics? 計劃，其目的是在云計算環境中結合新一代蛋白質組學（NGP）和新一代測序（NGS）的工具。作為此計劃的一部分，Illumina的應用商店BaseSpace將托管AB Sciex的SWATH? 蛋白質組學云工具，這使得BaseSp
Cell提出一個新“組學”：蛋白質代謝小分子互動組學
科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學（protein-metabolite interactomics）。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學，現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。 基因組學針對的是生物體基因的系統分析，而蛋
蛋白質組學之逆襲，深度注釋基因組
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完
人類蛋白質組計劃2.0和蛋白質組學驅動的精準醫學
“如果說抗生素的發明引發了第一代醫學治療技術革命，影像學和分子醫學的發展引發了第二代醫學診斷技術革命，那么，由蛋白質組學驅動的精準醫學，勢必帶來精確診斷與精準治療統一的第三代醫學革命。人類蛋白質組計劃2.0將在國際范圍部署建立蛋白質組學驅動的精準醫學技術體系和行業標準，進一步提升對重大、疑難疾病
蛋白質組學研究的策略和范圍
蛋白質組學一經出現，就有兩種研究策略。一種可稱為“竭澤法”，即采用高通量的蛋白質組研究技術分析生物體內盡可能多乃至接近所有的蛋白質，這種觀點從大規模、系統性的角度來看待蛋白質組學，也更符合蛋白質組學的本質。但是，由于蛋白質表達隨空間和時間不斷變化，要分析生物體內所有的蛋白質是一個難以實現的目標。另一
蛋白質組學驅動精準醫學加速發展
近日，中國醫學科學院在2024年中國醫學發展大會上發布了《中國21世紀重要醫學成就》，“創建蛋白質組學體系”成為本年度入選的3項重要醫學成就之一。中國科學院院士賀福初、西湖大學教授管坤良（開展相關研究時任職于復旦大學）、中國科學院院士樊嘉、中國科學院院士趙國屏等首創國際領先的蛋白質組學研究體系，不僅
定量蛋白質組學的技術發展
以質譜為基礎的定向蛋白質組學研究領域的發展歷程并不短，早在上個世紀70年，三重四極桿質譜儀就已經出現，并在80年代首次在發表的文章中，證明可以被用來檢測肽段。 過去幾年間，更廣泛的范圍內定向質譜技術的應用迅速攀升，而且新方法，新工具，新資源和新一代方法，也令更多研究領域的科學家們能利用到這項技
大連化物所蛋白質組學研究取得進展
蛋白質甲基化是一種非常重要的翻譯后修飾現象，其甲基供體為S-腺苷甲硫氨酸（SAM）。由于甲基化可發生在氨基酸殘基的N-,O-和S-中心，并且N-中心甲基化還存在不同狀態，同時甲基化對分離行為影響非常細微，限制了對蛋白質甲基化組的解析。常規基于抗體的研究策略僅捕獲了部分N-中心甲基化的信息。中國科
蛋白質組學幫你找到衰老的秘密
最近，研究人員發現，正常的和病理性的多肽組學變化，可能會增進我們對于衰老分子機制的理解。蛋白質組學分析與治療相結合，可能會影響病理性衰老。 這是第一次有研究人員成功地在分子水平上展示了正常衰老和病理性衰老之間的差異。在一項最大的蛋白質組衰老研究中，德國Leibniz衰老研究所 ——Fritz
蛋白質組學技術分析方法及概括
1 蛋白質組學概述“蛋白質組”一詞的英文是Proteome，它是proteins 和genome 兩個詞的組合，意思是proteins expressed by a genome，即為基因組表達的蛋白質[1]。蛋白質組的概念是1994 年由Wilkins首先提出，并在1995 年7月的“Electr
安捷倫科技資助定量蛋白質組學研究
安捷倫科技通過都柏林國立大學 Newman 獎學金計劃 資助定量蛋白質組學研究 2010 年 5 月 12 日，加利福尼亞州圣克拉拉市和愛爾蘭都柏林市 — 安捷倫科技公司(紐約證交所：A)和都柏林國立大學(University College Dublin, UCD)今日宣布 Ben
蛋白質組學的主要功能
蛋白質組學集中于動態描述基因調節，對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定，鑒定疾病、藥物對生命過程的影響，以及解釋基因表達調控的機制.作為一門科學，蛋白質組研究并非從零開始，它是已有20多年歷史的蛋白質(多肽)譜和基因產物圖譜技術的一種延伸.多肽圖譜依靠雙向電泳(Two-dimensionalgele
蛋白質組學解鎖木薯保鮮新技能
木薯是熱帶和亞熱帶地區的重要作物，與馬鈴薯和甘薯并稱為世界三大薯類作物。當然，在中國大部分地區，我們最常見到的木薯，應該是這個樣子出現的：好，看完美食我們接著聊。木薯雖然不錯，但是采后很容易變質，難以貯存。這在吃貨界顯然是不可以忍受的事！還好，大批科學家上線，希望找到讓木薯更容易保存的方法。最近，就
蛋白質組學牛人Nature發表重要成果
第一次結合兩種新興的大規模實驗技術：多通道質譜分析法和具有高水平自然遺傳多樣性的小鼠種群，哈佛醫學院(HMS)和Jackson實驗室(JAX)的研究人員解決了生物學和醫學中一個懸而未決的問題：遺傳變異是如何影響蛋白質水平的？ 蛋白質是構成所有細胞和生物結構與功能“零件表”的氨基酸鏈。因此，了解
實質等同性（蛋白質組學）實驗
實驗材料：ESI-MS ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?MALDI - MS? 試劑、試劑盒：提取緩沖液儀器、耗材：SDS- 聚丙烯酰胺凝膠電泳 ? ? ???實驗步驟：眾所周知，在實驗室內和實驗室間難
實質等同性（蛋白質組學）實驗
實驗材料ESI-MSMALDI - MS試劑、試劑盒提取緩沖液儀器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝膠電泳實驗步驟眾所周知，在實驗室內和實驗室間難以保證雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳的重復性。在我們實驗室，強制性地要求嚴格遵守標準操作程序（sop ) , 以確保不同的操作者可以獲得可重復的分離結果。小麥白面粉樣品
董孟秋·科學：蛋白質組學新技術
來自美國斯克利普斯研究所（Scripps Research Institute）Salk生物研究院，加州大學圣地亞哥分校的研究人員利用一種蛋白定量分析新方法對長壽命線蟲進行了研究，發現了能延長和縮短壽命的蛋白。這對于進一步豐富蛋白定量研究方面來說意義重大。這一研究成果公布在《Science》雜志上。
質譜和蛋白質組學：擊中目標
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)?? 作者：Nathan Blow?? 分析測試百科? 譯 ??? 近年來，質譜儀大幅提高了動態范圍和靈敏度，使研究者們在疾病生物標志物的發現和驗證方面，更從容地面對挑戰。 ??? 在2008年6月的美國質譜大會（ASMS）
蛋白質組學的標準化(上)
Tim Wehr 由于人類基因序列的建立已經接近完成，人們認識到生物科學屆的下一項任務將是表征基因組的產物——其中絕大部分是蛋白質。作為正在興起的研究領域，蛋白質組學將其研究目標定位于：鑒定和測量在一個細胞或組織中的所有蛋白質，這樣做的預期是，將能發現那些能夠成為疾病生物標志物(bioma
蛋白質組學的標準化(下)
蛋白質組學信息學研究組 蛋白質組學信息學研究組的任務是教育蛋白質組學研究實驗室最大程度地應用和實踐生物信息學方法，向精確和復雜的蛋白質組學數據分析方向發展。iPRG積極地支持和參與開發和提高新的算法、軟件工具以及蛋白質組信息學戰略，目標是向全體會員教育和介紹這些新技術。iPRG已經發起了兩
實質等同性（蛋白質組學）實驗
實驗材料ESI-MSMALDI - MS試劑、試劑盒提取緩沖液儀器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝膠電泳實驗步驟眾所周知，在實驗室內和實驗室間難以保證雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳的重復性。在我們實驗室，強制性地要求嚴格遵守標準操作程序（sop ) , 以確保不同的操作者可以獲得可重復的分離結果。小麥白面粉樣品
蛋白質組學技術分析方法及概括
1 蛋白質組學概述“蛋白質組”一詞的英文是Proteome，它是proteins 和genome 兩個詞的組合，意思是proteins expressed by a genome，即為基因組表達的蛋白質[1]。蛋白質組的概念是1994 年由Wilkins首先提出，并首次在1995 年7月的“Elec
外泌體及其蛋白質組學研究
外泌體是什么？ 外泌體（Exosome），是一種能被大多數細胞分泌的微小膜泡，具有脂質雙層膜結構，直徑大約40-200 nm。外泌體存在于體液中，包括血液、唾液、尿液和母乳等，不同組織來源的外泌體在內容物組成和功能方面存在差異，這種差異受到細胞外基質和微環境的動態調控。越來越多的證據表明，宿主
ThermoFisher推出Proteome－Discoverer蛋白質組學軟件
Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白質組學研究的突破性生物軟件 質量信息學平臺提供了強大的分析、開放和靈活架構，易于使用的界面 2008年5月30日，圣何塞，服務科學，世界領先的賽默飛世爾科技公司，今天宣布將在ASMS 2008（第56屆美國質譜大會）上
蛋白質組學研究系列儀器及軟件
人體內真正發揮作用的是蛋白質，蛋白質扮演著構筑生命大廈的“磚塊”角色，隨著破譯生命密碼的人類基因組計劃進入尾聲，一個以蛋白質和藥物基因學為研究重點的后基因組時代已經拉開序幕，蛋白質將是今后的重點研究方向之一。然而，蛋白質的分離和鑒定非常費時，目前測定蛋白質的技術遠遠落后于破譯基因組的工具，最好的實驗
蛋白質組學概念的起源和發展
蛋白質組學的誕生和發展，離不開多學科和技術的逐漸交叉融合。這些學科技術包括（但不限于）基因組學、生物化學、分析化學、自動化、基于電磁場的精密質譜儀、信號處理、數理統計和計算機科學。近年來，分子醫學、大數據技術和人工智能的發展，進一步加速推動了蛋白質組學的成長，使之在精準醫療領域展示出越來越大的應
定量蛋白質組學的優勢有哪些？
質譜方法比抗體方法更先進的一個原因，就是已經開發出了一種新的定向分析技術，比生產一個新的抗體要快得多，并大大減少了檢測特異性方面的問題（抗體方法存在交叉反應的問題）。 雖然抗體方法在低豐度蛋白的檢測方面更加靈敏，但是質譜技術的一個明顯優勢就是能在單個實驗中檢測多種蛋白，比如說，系統生物學研究人
第一屆全國代謝組學及蛋白質組學雙星峰會
繼測序之后，基于質譜技術的代謝組學及蛋白組學于生命科學研究領域發展迅速。應用質譜技術從分子層面對生命體進行動態、精準的檢測，可以了解生命體內代謝與蛋白整體水平的變化，為基礎科學研究提供新方向。 為了貫徹 “兩城一中心”的戰略，江北新區繼基因測序平臺后，又重磅打造了質譜檢測平臺，旨在服務生命