氣相色譜儀的分析對象是在柱溫下具有一定揮發性和熱穩定的物質,因此它只限于沸點<500℃、熱穩定性好和相對分子量<400的化合物或揮發性的衍生物。而液相色譜儀由于以液體作為流動相,只要被分析物質在選用的流動相中有一定的溶解度,便可以分析,因此適用性廣,不受樣品揮發性和熱穩定性的限制,特別適合分析沸點高、極性強和熱穩定性差的物質。
氣相色譜中的流動相是惰性的,對組分沒有作用力,僅起運載作用。而液相色譜的流動相不僅起運載作用,而且流動相對組分有一定親和力,可通過改變流動相種類類和組成提高分離的選擇性,另外可作流動相的化合物多,選擇余地大。
液相色譜的樣品收集比較容易,只要將開口容器放在色譜柱末端,就可以很容易地將所分離的各組分收集。回收是定量的,可用來提純和制備具有足夠純度的單一物質。
液相色譜的不足是目前檢測器的靈敏度不及氣相色譜。必須特別注意柱外效應對柱效率和色譜分離的影響。
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